More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4588 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
1096 aa  2179    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0515  ATPase-like  29.57 
 
 
1079 aa  300  7e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.413543  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000467  predicted ATPase  28.01 
 
 
1057 aa  300  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.73 
 
 
1175 aa  280  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  32.54 
 
 
1122 aa  244  7e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  28.94 
 
 
1160 aa  242  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  31.89 
 
 
1055 aa  236  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.92 
 
 
1089 aa  234  6e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  30.08 
 
 
1093 aa  233  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  29.14 
 
 
1046 aa  231  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.63 
 
 
1080 aa  230  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.96 
 
 
1081 aa  226  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  29.18 
 
 
1227 aa  219  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3762  serine/threonine protein kinase  31.02 
 
 
1192 aa  218  7e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00167797  normal  0.557916 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  28.62 
 
 
1142 aa  212  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  31.66 
 
 
1094 aa  211  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.5 
 
 
1050 aa  204  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  30.5 
 
 
1050 aa  204  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5633  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.74 
 
 
1131 aa  202  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  29 
 
 
1139 aa  199  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  29.64 
 
 
1134 aa  199  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.53 
 
 
1053 aa  198  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  28.5 
 
 
1148 aa  197  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4285  adenylate/guanylate cyclase  28.41 
 
 
1204 aa  196  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.4 
 
 
1441 aa  193  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.43 
 
 
1403 aa  192  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  29.58 
 
 
1198 aa  191  8e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.07 
 
 
1141 aa  190  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  27.8 
 
 
1105 aa  189  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.49 
 
 
1291 aa  188  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  30.11 
 
 
1138 aa  187  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  25.82 
 
 
1048 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.09 
 
 
1360 aa  186  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.73 
 
 
1055 aa  185  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.85 
 
 
1149 aa  182  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.14 
 
 
1429 aa  182  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  30.54 
 
 
1063 aa  177  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6499  adenylate/guanylate cyclase  31.6 
 
 
1043 aa  172  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953876  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.77 
 
 
1151 aa  169  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  26.06 
 
 
1271 aa  169  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  30.38 
 
 
1151 aa  167  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5519  serine/threonine protein kinase  29.82 
 
 
1188 aa  165  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  27.51 
 
 
1298 aa  165  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.52 
 
 
1014 aa  164  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.79 
 
 
1422 aa  164  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  30.77 
 
 
1065 aa  161  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1064  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.49 
 
 
1226 aa  160  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.25 
 
 
1087 aa  159  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  27.73 
 
 
1037 aa  157  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  29.56 
 
 
1358 aa  154  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0329  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.26 
 
 
1285 aa  152  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.902018  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  26.1 
 
 
1123 aa  151  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1844  adenylate/guanylate cyclase  25.42 
 
 
1153 aa  150  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  28.4 
 
 
1027 aa  149  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24.68 
 
 
1295 aa  148  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4346  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.8 
 
 
1190 aa  142  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  29.19 
 
 
1027 aa  140  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  29.19 
 
 
1027 aa  140  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.61 
 
 
1117 aa  135  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  28.53 
 
 
1377 aa  136  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000225277 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.03 
 
 
611 aa  132  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  35.41 
 
 
513 aa  132  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1214  adenylate/guanylate cyclase  24.82 
 
 
1130 aa  129  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  26.03 
 
 
1133 aa  127  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  35.57 
 
 
515 aa  127  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1821  adenylate/guanylate cyclase  33.62 
 
 
738 aa  124  8e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0453734  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1991  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.4 
 
 
1023 aa  124  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0171462  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  37.08 
 
 
665 aa  124  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
744 aa  122  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4787  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.96 
 
 
1190 aa  122  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000313261 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  26.42 
 
 
1403 aa  122  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  26.88 
 
 
1398 aa  122  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  35.16 
 
 
518 aa  121  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  32.11 
 
 
479 aa  121  9e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  32.07 
 
 
546 aa  120  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  30.96 
 
 
735 aa  120  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  33.84 
 
 
518 aa  120  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  32.83 
 
 
864 aa  120  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.76 
 
 
757 aa  119  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5021  adenylate/guanylate cyclase  33.05 
 
 
348 aa  118  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1173  ribosomal protein L19  32.97 
 
 
460 aa  118  6.9999999999999995e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000211521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0561  putative adenylate/guanylate cyclase  37.14 
 
 
817 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.436202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2514  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.07 
 
 
805 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255798  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  32.8 
 
 
1207 aa  116  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  34.5 
 
 
701 aa  115  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  27.34 
 
 
1015 aa  115  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1682  putative adenylate/guanylate cyclase  26.72 
 
 
1071 aa  115  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.114173 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  35.87 
 
 
758 aa  114  9e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4645  adenylate/guanylate cyclase  34.92 
 
 
546 aa  114  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98897  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  33.69 
 
 
794 aa  114  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  29.22 
 
 
860 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  33.99 
 
 
858 aa  113  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  31.86 
 
 
859 aa  112  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  30.39 
 
 
641 aa  112  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  30.13 
 
 
936 aa  112  4.0000000000000004e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1844  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  37.43 
 
 
725 aa  111  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.266709 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  36.87 
 
 
348 aa  111  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  37.21 
 
 
1020 aa  110  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  34.22 
 
 
614 aa  110  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  32.42 
 
 
911 aa  110  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>