190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2294 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2294  porin  100 
 
 		 250 aa  500  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  50.38 
 
 		 244 aa  227  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  54.31 
 
 		 254 aa  221  8e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  53.18 
 
 		 255 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  48.99 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  43.38 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  36.93 
 
 		 229 aa  151  8e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  37.76 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  38.6 
 
 		 228 aa  135  7.000000000000001e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0116  putative outer membrane protein  38.5 
 
 		 228 aa  135  7.000000000000001e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  34.58 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  34.58 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  34.54 
 
 		 236 aa  128  8.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  34.47 
 
 		 255 aa  121  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  33.86 
 
 		 453 aa  119  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  36.28 
 
 		 232 aa  119  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5086  porin  35.95 
 
 		 274 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62657  normal  0.99686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4568  porin  37.76 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.117161 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5028  porin  36.51 
 
 		 274 aa  115  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654238  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4191  porin  43.4 
 
 		 277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  37.17 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  35.08 
 
 		 447 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  37.78 
 
 		 207 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  39.74 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  32.94 
 
 		 240 aa  112  8.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  31.87 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  36.95 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0513  porin  38.64 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.263575  hitchhiker  0.00240622 
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  32.95 
 
 		 261 aa  109  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  38.11 
 
 		 207 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0132  porin  34.02 
 
 		 229 aa  109  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5409  porin  37.19 
 
 		 279 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.801907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  31.6 
 
 		 452 aa  107  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  34.67 
 
 		 449 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2972  porin  32.65 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  39.29 
 
 		 248 aa  106  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4377  putative outer-membrane protein  33.33 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  35.47 
 
 		 236 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1729  putative outer membrane protein precursor  35.65 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2745  porin  32.3 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  31.08 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1415  porin  44.55 
 
 		 276 aa  102  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118187 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  33.2 
 
 		 449 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4560  outer membrane protein  35.38 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  37.37 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0278  OmpA-like transmembrane region  35.06 
 
 		 245 aa  99.4  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.670906  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  30.42 
 
 		 225 aa  99.8  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2587  porin  30.38 
 
 		 213 aa  99.8  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4247  porin  43.19 
 
 		 278 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.740101  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0475  porin  32.32 
 
 		 283 aa  99.4  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556645  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  32.69 
 
 		 237 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1292  porin  43.6 
 
 		 276 aa  98.6  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  35 
 
 		 207 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0125  porin  31.72 
 
 		 283 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  33.07 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4957  porin  35.25 
 
 		 302 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2428  porin  32.58 
 
 		 284 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799812  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  37.89 
 
 		 250 aa  95.5  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5652  porin  34.98 
 
 		 207 aa  95.1  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303382  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_004310  BR0701  outer-membrane protein Omp25  32.35 
 
 		 213 aa  94.7  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1001  porin  37.39 
 
 		 288 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221202  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1238  outer membrane protein, 31 kDa  33.48 
 
 		 234 aa  94.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2867  porin  33.46 
 
 		 285 aa  94  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  34.35 
 
 		 454 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2567  hypothetical protein  30.3 
 
 		 234 aa  93.2  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2845  outer membrane autotransporter barrel  32.7 
 
 		 652 aa  92.4  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4523  putative outer-membrane protein precursor  34.47 
 
 		 237 aa  92.4  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  31.54 
 
 		 236 aa  92  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0423  carbohydrate-selective porin OprB  32.16 
 
 		 692 aa  92  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  32.92 
 
 		 237 aa  92  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6698  porin  36.54 
 
 		 246 aa  92  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4907  porin  39.46 
 
 		 296 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.279354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0473  Carbohydrate-selective porin OprB  33.64 
 
 		 689 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.693985  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4443  porin  39.46 
 
 		 296 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.877928  normal  0.484649 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5256  porin  39.35 
 
 		 287 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0841  putative outer membrane protein  33.58 
 
 		 242 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0819  porin  36.28 
 
 		 204 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0719605  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3005  porin  38.91 
 
 		 290 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0932  hypothetical protein  35.04 
 
 		 205 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544275  normal  0.834774 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3292  porin  33.99 
 
 		 296 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  33.2 
 
 		 240 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2788  hypothetical protein  32.92 
 
 		 578 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0959536  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1282  putative outer membrane protein  35.71 
 
 		 207 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494917  normal  0.183567 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2714  outer membrane protein  32.31 
 
 		 243 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155382  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0244  outer membrane protein  36.43 
 
 		 241 aa  89  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  30.92 
 
 		 237 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0692  outer-membrane protein Omp25  31.22 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2145  outer membrane protein  35.47 
 
 		 274 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.225218  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2882  porin  38.53 
 
 		 290 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3108  porin  38.53 
 
 		 290 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0475237 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3175  hypothetical protein  33.48 
 
 		 566 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424838  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2756  putative outer membrane protein  29.84 
 
 		 241 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0474  porin  37.07 
 
 		 302 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682837  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0567  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  32.59 
 
 		 661 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  32.02 
 
 		 570 aa  85.9  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  30.71 
 
 		 997 aa  85.9  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7000  hypothetical protein  33.94 
 
 		 583 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.000000122606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1182  porin  37.79 
 
 		 289 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.0724335 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1340  porin  37.79 
 
 		 289 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3321  porin  40.65 
 
 		 285 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>