More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2113 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2113  ABC transporter related  100 
 
 
240 aa  486  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  1.36112e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0166  ABC transporter related  70 
 
 
240 aa  333  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1116  ABC transporter related protein  55.8 
 
 
240 aa  270  1e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.53256  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1809  ABC transporter, ATP-binding protein  53.45 
 
 
235 aa  255  6e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.596439  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0470  ABC transporter related protein  51.95 
 
 
264 aa  249  2e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1629  ABC transporter related  53.15 
 
 
315 aa  233  1e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1395  ABC transporter related protein  48.43 
 
 
238 aa  232  5e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0267947  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0964  ABC transporter related  50 
 
 
241 aa  227  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  42.15 
 
 
240 aa  205  5e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  47.71 
 
 
259 aa  203  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5887  ABC transporter related  43.24 
 
 
232 aa  201  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  42.73 
 
 
252 aa  201  1e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  40.74 
 
 
221 aa  199  4e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1504  ABC transporter related  44.29 
 
 
231 aa  196  2e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.211906  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  45.75 
 
 
217 aa  195  7e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1223  ABC transporter related  43.24 
 
 
232 aa  195  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.438365  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7010  ABC transporter related  42.34 
 
 
232 aa  194  9e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0349987  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0445  ABC transporter, ATP-binding protein  43.11 
 
 
232 aa  192  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168038  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  45.33 
 
 
242 aa  193  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5591  ABC transporter related  43.24 
 
 
232 aa  192  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0559495  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5154  ABC transporter related  45 
 
 
245 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3084  ABC transporter related  43.56 
 
 
230 aa  192  4e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.319445  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  42.67 
 
 
255 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1294  ABC transporter related  43.69 
 
 
234 aa  192  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  43.84 
 
 
232 aa  192  6e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1554  ABC transporter related  46.95 
 
 
246 aa  191  8e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  40.35 
 
 
239 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  42.79 
 
 
251 aa  191  1e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0101  ABC transporter, ATP-binding protein  46.76 
 
 
230 aa  190  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0103  ABC transporter related  46.76 
 
 
230 aa  190  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  42.73 
 
 
238 aa  189  3e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  40.37 
 
 
237 aa  189  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0009  ABC transporter related  42.54 
 
 
235 aa  188  5e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  4.06325e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  43.05 
 
 
646 aa  188  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1318  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  43.05 
 
 
234 aa  188  6e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  43.12 
 
 
224 aa  188  6e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  43.12 
 
 
224 aa  188  6e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0173  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  43.05 
 
 
234 aa  188  6e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0147  ABC transporter, ATP-binding protein  43.05 
 
 
232 aa  188  6e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  43.12 
 
 
224 aa  188  7e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  42.15 
 
 
238 aa  188  7e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  40.17 
 
 
235 aa  187  9e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  1.35458e-07  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1033  ABC transporter, ATP-binding protein  43.05 
 
 
232 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2768  ABC transporter, ATP-binding protein  43.05 
 
 
234 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 
224 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2625  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  43.05 
 
 
234 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  43.12 
 
 
224 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  40.91 
 
 
233 aa  186  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  42.73 
 
 
652 aa  186  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  42.66 
 
 
224 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  42.66 
 
 
224 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 
224 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  41.74 
 
 
649 aa  186  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  40.99 
 
 
654 aa  186  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  39.38 
 
 
234 aa  186  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  41.74 
 
 
224 aa  185  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  41.63 
 
 
234 aa  185  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  7.26379e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  40.83 
 
 
248 aa  185  6e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  37.99 
 
 
241 aa  185  7e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  40.72 
 
 
649 aa  184  8e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7063  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 
239 aa  184  1e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  44.59 
 
 
236 aa  184  1e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  44.72 
 
 
225 aa  184  1e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  41.44 
 
 
650 aa  184  1e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  44.72 
 
 
225 aa  184  1e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  39.82 
 
 
293 aa  184  2e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3214  ABC transporter related  41.15 
 
 
233 aa  183  2e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.418962  normal  0.11192 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  39.64 
 
 
236 aa  183  2e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  40.44 
 
 
234 aa  183  2e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  38.01 
 
 
229 aa  183  2e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  42.66 
 
 
224 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0332  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  42.52 
 
 
241 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.240707  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0826  ATPase  43.38 
 
 
233 aa  182  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.22 
 
 
227 aa  182  4e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  41.28 
 
 
224 aa  182  4e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01531  hypothetical protein  39.81 
 
 
235 aa  182  5e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  40.54 
 
 
239 aa  182  5e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  39.46 
 
 
228 aa  182  6e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  41.28 
 
 
244 aa  181  7e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1769  ABC transporter related  39.64 
 
 
247 aa  181  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0564  ATPase  44.06 
 
 
237 aa  181  8e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0266482 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  41.44 
 
 
231 aa  181  8e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  40.27 
 
 
226 aa  181  8e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  40.62 
 
 
233 aa  181  9e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  39.27 
 
 
238 aa  180  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  40.09 
 
 
232 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.6 
 
 
648 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.6 
 
 
648 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.6 
 
 
648 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  39.45 
 
 
661 aa  180  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  39.82 
 
 
233 aa  179  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  37.78 
 
 
227 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  41.53 
 
 
240 aa  180  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  40.37 
 
 
668 aa  180  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  40.37 
 
 
668 aa  180  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  41.7 
 
 
248 aa  179  3e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  41.28 
 
 
244 aa  179  3e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19670  ABC transporter related  38.99 
 
 
232 aa  179  3e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  40.45 
 
 
234 aa  179  3e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  40.09 
 
 
666 aa  179  3e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>