More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1643 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 		 146 aa  311  1.9999999999999998e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  67.67 
 
 		 139 aa  202  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  66.42 
 
 		 136 aa  198  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  62.22 
 
 		 151 aa  197  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  68.25 
 
 		 140 aa  194  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  62.22 
 
 		 137 aa  189  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  61.43 
 
 		 148 aa  189  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  60 
 
 		 137 aa  186  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2451  PilB-related protein  65.62 
 
 		 137 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  59.42 
 
 		 141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  64.34 
 
 		 135 aa  180  7e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1275  methionine-R-sulfoxide reductase  62.6 
 
 		 134 aa  179  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.285091  normal  0.167765 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2617  peptide methionine sulfoxide reductase  62.6 
 
 		 134 aa  179  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0781659  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  62.31 
 
 		 136 aa  179  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  62.7 
 
 		 136 aa  177  5.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  63.49 
 
 		 159 aa  176  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  63.85 
 
 		 132 aa  176  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  61.11 
 
 		 132 aa  172  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  60.63 
 
 		 138 aa  172  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1063  methionine-R-sulfoxide reductase  58.21 
 
 		 137 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803638  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  58.87 
 
 		 163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  58.73 
 
 		 132 aa  172  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  62.02 
 
 		 133 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  56.49 
 
 		 133 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  58.46 
 
 		 134 aa  171  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  62.1 
 
 		 144 aa  170  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  57.03 
 
 		 135 aa  169  9e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  58.21 
 
 		 138 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2257  methionine sulfoxide reductase B  56.82 
 
 		 133 aa  169  1e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2658  methionine-R-sulfoxide reductase  61.11 
 
 		 133 aa  169  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173178  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  57.89 
 
 		 155 aa  168  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  62.99 
 
 		 138 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  62.99 
 
 		 138 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1706  peptide methionine sulfoxide reductase  58.65 
 
 		 149 aa  167  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0428865  normal  0.0200729 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  57.36 
 
 		 131 aa  167  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  54.93 
 
 		 164 aa  167  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  59.09 
 
 		 159 aa  167  4e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1533  methionine-R-sulfoxide reductase  59.38 
 
 		 167 aa  167  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  57.36 
 
 		 131 aa  167  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4073  methionine-R-sulfoxide reductase  53.33 
 
 		 177 aa  166  7e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000057525  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  59.06 
 
 		 131 aa  166  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2131  methionine-R-sulfoxide reductase  56.93 
 
 		 136 aa  165  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0517033  normal  0.533919 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  57.26 
 
 		 128 aa  165  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  57.81 
 
 		 185 aa  165  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  57.78 
 
 		 167 aa  165  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2097  methionine-R-sulfoxide reductase  58.27 
 
 		 167 aa  165  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.3057 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  56.69 
 
 		 135 aa  165  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0799  methionine-R-sulfoxide reductase  61.6 
 
 		 138 aa  165  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126104  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1425  methionine-R-sulfoxide reductase  55.97 
 
 		 137 aa  165  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1761  methionine-R-sulfoxide reductase  58.27 
 
 		 198 aa  165  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  56.59 
 
 		 131 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  58.73 
 
 		 131 aa  164  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1907  methionine-R-sulfoxide reductase  58.78 
 
 		 134 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.954215 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  57.26 
 
 		 128 aa  164  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  58.06 
 
 		 128 aa  164  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1767  methionine-S-oxide reductase  55.97 
 
 		 138 aa  164  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0415378 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27510  methionine sulfoxide reductase B  57.69 
 
 		 132 aa  164  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156355  normal  0.0230939 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0159  methionine-R-sulfoxide reductase  53.52 
 
 		 164 aa  164  5e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0013  protein-methionine-S-oxide reductase  58.14 
 
 		 130 aa  163  5.9999999999999996e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1350  protein-methionine-S-oxide reductase  58.59 
 
 		 133 aa  163  5.9999999999999996e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000258473  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2521  methionine sulfoxide reductase B  56.59 
 
 		 131 aa  163  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0744717  normal  0.336049 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1777  methionine sulfoxide reductase B  52.41 
 
 		 166 aa  163  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1835  methionine-R-sulfoxide reductase  59.4 
 
 		 136 aa  163  8e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.462521 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0873  methionine-R-sulfoxide reductase  60.48 
 
 		 138 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0384215 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  55.12 
 
 		 136 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  59.84 
 
 		 131 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1027  methionine sulfoxide reductase B  61.98 
 
 		 161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0833  methionine-R-sulfoxide reductase  60.48 
 
 		 138 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.151751 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0972  methionine-R-sulfoxide reductase  57.81 
 
 		 134 aa  162  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2328  methionine sulfoxide reductase B  56.92 
 
 		 132 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2039  methionine-R-sulfoxide reductase  58.73 
 
 		 131 aa  161  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.122601  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  58.14 
 
 		 131 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  55.56 
 
 		 140 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0336  methionine-R-sulfoxide reductase  62.1 
 
 		 140 aa  160  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  55.56 
 
 		 140 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2582  protein-methionine-S-oxide reductase  57.89 
 
 		 136 aa  160  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2319  methionine-R-sulfoxide reductase  57.6 
 
 		 131 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.69896  normal  0.111888 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1893  methionine-R-sulfoxide reductase  59.84 
 
 		 130 aa  160  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.513926  normal  0.442885 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  54.89 
 
 		 142 aa  160  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  59.84 
 
 		 131 aa  160  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0348  methionine-R-sulfoxide reductase  61.29 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  57.48 
 
 		 137 aa  158  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5538  methionine sulfoxide reductase B  56.49 
 
 		 167 aa  159  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  54.26 
 
 		 133 aa  158  3e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0705  methionine-R-sulfoxide reductase  57.94 
 
 		 137 aa  158  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.906192  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  57.48 
 
 		 137 aa  157  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1841  methionine-R-sulfoxide reductase  57.94 
 
 		 141 aa  158  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  58.06 
 
 		 183 aa  157  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15440  methionine sulfoxide reductase B  53.08 
 
 		 133 aa  157  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0325  methionine-S-oxide reductase  59.84 
 
 		 150 aa  157  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231035  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0822  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 154 aa  157  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000300416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2777  methionine-R-sulfoxide reductase  58.06 
 
 		 140 aa  157  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  53.33 
 
 		 166 aa  155  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1330  methionine sulfoxide reductase B  54.07 
 
 		 171 aa  156  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3070  methionine-R-sulfoxide reductase  56.69 
 
 		 166 aa  156  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.972743 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  57.48 
 
 		 137 aa  155  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  55.47 
 
 		 137 aa  154  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1894  methionine-R-sulfoxide reductase  55.47 
 
 		 140 aa  154  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  51.11 
 
 		 136 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1234  methionine-R-sulfoxide reductase  57.72 
 
 		 290 aa  152  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0160878 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>