More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6931 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  71.64 
 
 
307 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  71.17 
 
 
305 aa  363  3e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3995  protein of unknown function DUF6 transmembrane  71.17 
 
 
305 aa  363  3e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  67.27 
 
 
297 aa  360  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  67.8 
 
 
304 aa  358  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  66.06 
 
 
301 aa  358  6e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0388  hypothetical protein  68 
 
 
320 aa  334  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61.75 
 
 
306 aa  319  3.9999999999999996e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1070  hypothetical protein  60.36 
 
 
310 aa  288  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  36.65 
 
 
311 aa  178  9e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  36.88 
 
 
319 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  35.69 
 
 
314 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  37.14 
 
 
301 aa  163  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  34.63 
 
 
290 aa  152  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  35.94 
 
 
319 aa  148  9e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6570  hypothetical protein  37.62 
 
 
316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1591  hypothetical protein  36.43 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.12309 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.19 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  30.63 
 
 
304 aa  142  9e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  33.33 
 
 
321 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  32.97 
 
 
321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  32.52 
 
 
304 aa  129  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.45 
 
 
301 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  31.85 
 
 
314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.42 
 
 
301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  31.34 
 
 
300 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  32.36 
 
 
307 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  32.76 
 
 
297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  30.43 
 
 
298 aa  105  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.58 
 
 
310 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  35.16 
 
 
303 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  34.1 
 
 
308 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.88 
 
 
310 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  27.67 
 
 
291 aa  100  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  33.45 
 
 
311 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  32.12 
 
 
310 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.7 
 
 
283 aa  99.4  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0553  hypothetical protein  31.56 
 
 
301 aa  99.4  7e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  31.54 
 
 
335 aa  97.1  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  28.91 
 
 
294 aa  95.9  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.64 
 
 
324 aa  95.9  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0860474  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  28.11 
 
 
312 aa  94  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.22 
 
 
299 aa  94  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1744  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.29 
 
 
324 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  31.42 
 
 
312 aa  93.2  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.99 
 
 
312 aa  92.8  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.86 
 
 
309 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  30.79 
 
 
302 aa  91.3  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2091  hypothetical protein  29.77 
 
 
301 aa  89.7  5e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  29.9 
 
 
311 aa  89.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  29.72 
 
 
298 aa  89.4  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0225  hypothetical protein  31.47 
 
 
364 aa  89.4  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.490189  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1843  hypothetical protein  29.93 
 
 
294 aa  89  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  29.9 
 
 
292 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.61 
 
 
319 aa  87  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  28.37 
 
 
296 aa  86.7  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  32.09 
 
 
310 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  31.75 
 
 
298 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  31.67 
 
 
308 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  31.67 
 
 
308 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.93 
 
 
303 aa  84.3  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.93 
 
 
313 aa  84  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02645  Predicted permease  27.05 
 
 
294 aa  83.6  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.880959  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.32 
 
 
326 aa  83.2  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  31.23 
 
 
308 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  28.92 
 
 
297 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  29.43 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1236  hypothetical protein  31.22 
 
 
307 aa  80.5  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  32.79 
 
 
308 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  32.79 
 
 
308 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  26.92 
 
 
295 aa  79.3  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  29.15 
 
 
302 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  29.03 
 
 
296 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5126  hypothetical protein  28.91 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0428934  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  29.03 
 
 
296 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  29.03 
 
 
296 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  27.14 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  27.14 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4767  hypothetical protein  27.99 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0878197  hitchhiker  0.00351087 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  30.66 
 
 
308 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  27.27 
 
 
334 aa  77.4  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4780  hypothetical protein  27.65 
 
 
304 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119859  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  25.9 
 
 
302 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16131  integral membrane protein, DUF6  27.34 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  30.1 
 
 
310 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  27.31 
 
 
311 aa  76.3  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0653  hypothetical protein  27.36 
 
 
306 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.005138  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2304  hypothetical protein  28.42 
 
 
299 aa  75.9  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4642  hypothetical protein  27.65 
 
 
306 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0734055  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  29.17 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  29.17 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  29.17 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1791  hypothetical protein  30.36 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.82082  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.86 
 
 
324 aa  75.1  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  29.17 
 
 
310 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  29.17 
 
 
310 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  26.99 
 
 
316 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  27.37 
 
 
379 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>