More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6914 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
279 aa  570  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1687  short chain dehydrogenase  50.18 
 
 
279 aa  264  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  48.75 
 
 
286 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.76 
 
 
282 aa  258  9e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  48.92 
 
 
280 aa  256  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  49.64 
 
 
280 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2942  short chain dehydrogenase  50.92 
 
 
280 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.976984  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.21 
 
 
287 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.74 
 
 
285 aa  251  9.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.103253 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.71 
 
 
280 aa  251  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.16 
 
 
281 aa  250  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.966352 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.35 
 
 
284 aa  246  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.329601  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  47.97 
 
 
276 aa  245  6e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6478  short chain dehydrogenase  46.74 
 
 
277 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0193628  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  47.23 
 
 
276 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.79 
 
 
280 aa  242  6e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.59 
 
 
275 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.57 
 
 
279 aa  239  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.35 
 
 
276 aa  239  4e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.71 
 
 
276 aa  238  5.999999999999999e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5725  short chain dehydrogenase  46.38 
 
 
277 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519964  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6919  short chain dehydrogenase  46.01 
 
 
276 aa  238  8e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.52 
 
 
282 aa  238  9e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1451  short chain dehydrogenase  45.65 
 
 
277 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6377  short chain dehydrogenase  45.65 
 
 
277 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  46.18 
 
 
284 aa  237  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7041  short chain dehydrogenase  45.65 
 
 
277 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  normal  0.204999 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.29 
 
 
281 aa  236  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0984  short chain dehydrogenase  45.93 
 
 
283 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46420  short chain dehydrogenase  44.93 
 
 
277 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000350021  hitchhiker  0.000971378 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.19 
 
 
279 aa  235  6e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  45.88 
 
 
280 aa  234  9e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.96 
 
 
276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.0351935 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  45.82 
 
 
284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8863  short chain dehydrogenase  46.49 
 
 
282 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32520  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  46.49 
 
 
278 aa  233  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.53 
 
 
296 aa  233  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149437 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2359  short chain dehydrogenase  43.48 
 
 
277 aa  232  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.99 
 
 
276 aa  232  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.74 
 
 
280 aa  232  5e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140446  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.49 
 
 
276 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  44.93 
 
 
277 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.16 
 
 
277 aa  229  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1950  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.39 
 
 
284 aa  229  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417893  normal  0.0791039 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.88 
 
 
279 aa  228  6e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205485  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.76 
 
 
283 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.69 
 
 
276 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.81 
 
 
285 aa  227  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.69 
 
 
293 aa  226  4e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.29 
 
 
281 aa  225  7e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1176  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.05 
 
 
286 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.72 
 
 
274 aa  223  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0106192 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0843  short chain dehydrogenase  43.7 
 
 
275 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767433  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.32 
 
 
276 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.32 
 
 
274 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.62 
 
 
290 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.65 
 
 
276 aa  218  7.999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.13 
 
 
280 aa  218  7.999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.76 
 
 
283 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.38 
 
 
282 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7039  short chain dehydrogenase  41.48 
 
 
275 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0246661  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.04 
 
 
279 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.39 
 
 
279 aa  216  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000868521 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.07 
 
 
278 aa  214  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.314719  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2139  short chain dehydrogenase  45.13 
 
 
284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.980351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 
281 aa  212  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0756  short chain dehydrogenase  43.4 
 
 
274 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 
290 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0762  short chain dehydrogenase  43.4 
 
 
274 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.59 
 
 
273 aa  210  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.01823 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0776  short chain dehydrogenase  43.4 
 
 
274 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.03 
 
 
286 aa  209  5e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.11 
 
 
283 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0526  short chain dehydrogenase  43.53 
 
 
279 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928222  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1177  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.58 
 
 
288 aa  205  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.22 
 
 
292 aa  205  8e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.97 
 
 
279 aa  204  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.03 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366194  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  41.61 
 
 
303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.24 
 
 
295 aa  199  6e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.09 
 
 
284 aa  198  7e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.16 
 
 
299 aa  198  9e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  41.2 
 
 
285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1178  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.59 
 
 
286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.46 
 
 
292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0160935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.82 
 
 
274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  0.0715195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.07 
 
 
277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0647025  normal  0.205798 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02393  short chain oxidoreductase/dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01770)  43.51 
 
 
287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930439  normal  0.559669 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  46.06 
 
 
274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.71 
 
 
282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0971  Short-chain alcohol dehydrogenase  38.83 
 
 
287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1152  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.17 
 
 
258 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 
290 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 
290 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507857  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.51 
 
 
273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.07 
 
 
280 aa  195  5.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.35 
 
 
282 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  43.02 
 
 
283 aa  192  6e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.59 
 
 
279 aa  191  8e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96036  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.98 
 
 
272 aa  191  9e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>