More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1551 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_1071  oxidoreductase-like  100 
 
 
328 aa  659    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1527  oxidoreductase domain-containing protein  97.26 
 
 
328 aa  640    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.727189 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1551  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
328 aa  659    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4693  oxidoreductase  94.21 
 
 
328 aa  620  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.454342  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1473  oxidoreductase domain-containing protein  91.77 
 
 
328 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1452  oxidoreductase domain-containing protein  91.77 
 
 
328 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1681  oxidoreductase domain-containing protein  89.02 
 
 
328 aa  528  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0855152 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1806  oxidoreductase, NAD-binding  76.92 
 
 
327 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.677561  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1258  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  76.92 
 
 
327 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.185464  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1975  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  76.92 
 
 
327 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1741  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  76.92 
 
 
327 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.994489  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0151  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  76.92 
 
 
327 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.191769  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1822  oxidoreductase, NAD-binding  76.92 
 
 
327 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1015  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  76.92 
 
 
327 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2514  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  77.54 
 
 
327 aa  448  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0152325  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2511  oxidoreductase  69.06 
 
 
348 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1726  oxidoreductase domain protein  68.75 
 
 
348 aa  428  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1666  oxidoreductase domain-containing protein  67.19 
 
 
334 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0263052 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  34.44 
 
 
327 aa  172  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  36.7 
 
 
329 aa  170  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  35.44 
 
 
329 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  32.21 
 
 
354 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  35.49 
 
 
334 aa  158  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  32.42 
 
 
328 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  30.49 
 
 
329 aa  149  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  33.74 
 
 
329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  31.6 
 
 
327 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  32.92 
 
 
321 aa  145  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  37.76 
 
 
379 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  32.52 
 
 
331 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  35.19 
 
 
332 aa  143  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  33.14 
 
 
362 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  29.66 
 
 
324 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  32.67 
 
 
319 aa  137  2e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  28.86 
 
 
321 aa  136  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  29.36 
 
 
323 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  36.62 
 
 
341 aa  135  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0352  oxidoreductase domain protein  34.77 
 
 
352 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.688596  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  33.85 
 
 
342 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  34.01 
 
 
352 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  32.73 
 
 
356 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  29.64 
 
 
327 aa  132  6e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  31.99 
 
 
349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  27.59 
 
 
320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  34.94 
 
 
333 aa  130  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  33.73 
 
 
345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  35.49 
 
 
338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26160  predicted dehydrogenase  34.46 
 
 
358 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0688077  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1593  oxidoreductase domain-containing protein  32.51 
 
 
332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  31.3 
 
 
667 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3322  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 
328 aa  126  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0789  oxidoreductase domain protein  34.58 
 
 
338 aa  125  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 
667 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  32.92 
 
 
338 aa  124  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  32.4 
 
 
334 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  31.1 
 
 
346 aa  122  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  33.94 
 
 
338 aa  122  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  33.77 
 
 
358 aa  122  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  33.13 
 
 
336 aa  122  9e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  29.74 
 
 
667 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1175  oxidoreductase domain protein  33.03 
 
 
357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000136533 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0327  oxidoreductase domain-containing protein  35.2 
 
 
322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.36589  hitchhiker  0.000842403 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2588  cytidyltransferase-related domain protein  32.4 
 
 
447 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1747  cytidyltransferase-related domain protein  29.3 
 
 
451 aa  120  3.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1210  putative NADP or NAD utilising oxidoreductase  28.83 
 
 
331 aa  119  7e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4438  oxidoreductase domain protein  34.83 
 
 
354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2075  Trans-1,2-dihydrobenzene-1,2-diol dehydrogenase  27.93 
 
 
332 aa  117  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  33.59 
 
 
665 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  30.15 
 
 
323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  26.22 
 
 
329 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0125  oxidoreductase domain protein  33.97 
 
 
360 aa  110  3e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4235  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 
356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1298  oxidoreductase-like  26.02 
 
 
349 aa  109  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132661  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 
667 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  31.4 
 
 
335 aa  106  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0476  oxidoreductase domain protein  32.13 
 
 
338 aa  106  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.84 
 
 
338 aa  104  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05123  dimeric dihydrodiol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07520)  28.39 
 
 
388 aa  103  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1333  oxidoreductase domain protein  30.43 
 
 
665 aa  104  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.157894 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.91 
 
 
349 aa  103  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  29.06 
 
 
343 aa  102  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.6 
 
 
349 aa  102  9e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.77 
 
 
327 aa  102  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  27.95 
 
 
359 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1475  oxidoreductase domain protein  22.36 
 
 
370 aa  102  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0697456  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  31.64 
 
 
338 aa  101  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00036  conserved hypothetical protein  28.13 
 
 
366 aa  101  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.448897  normal  0.142561 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  26.99 
 
 
331 aa  101  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0817  oxidoreductase domain protein  25.61 
 
 
326 aa  100  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  30.56 
 
 
670 aa  100  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3188  oxidoreductase domain-containing protein  37.56 
 
 
344 aa  99.4  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05910  cytidyltransferase-related enzyme  27.74 
 
 
464 aa  95.9  8e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000737737 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  30.69 
 
 
331 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  31.84 
 
 
327 aa  90.9  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25422  predicted protein  25.56 
 
 
374 aa  89.4  7e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  31.07 
 
 
321 aa  89.4  9e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29330  oxidoreductase (Bacterial)  25.71 
 
 
361 aa  88.6  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  41.1 
 
 
326 aa  87.8  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3482  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
337 aa  88.2  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0446  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.06 
 
 
319 aa  87  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.128623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>