147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0538 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_3570  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  86.46 
 
 
382 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3625  membrane-bound lytic murein transglycosylase  98.54 
 
 
410 aa  823    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.475479  normal  0.908257 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2905  membrane-bound lytic murein transglycosylase A, putative  84.88 
 
 
433 aa  682    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.622173  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0465  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  81.82 
 
 
374 aa  638    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2567  MltA  99.02 
 
 
409 aa  782    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0443  MltA domain-containing protein  97.07 
 
 
410 aa  783    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0538  MltA domain-containing protein  100 
 
 
410 aa  831    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0936  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  85.85 
 
 
425 aa  692    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.988318  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0510  MltA domain-containing protein  98.54 
 
 
410 aa  822    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.916574 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0468  MltA domain-containing protein  96.79 
 
 
374 aa  708    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0646444  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3551  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  85.85 
 
 
425 aa  692    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.383635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3578  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  85.85 
 
 
425 aa  692    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1906  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  85.85 
 
 
425 aa  692    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.569775  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2694  MltA domain-containing protein  80.73 
 
 
410 aa  681    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2856  MltA domain-containing protein  93.9 
 
 
410 aa  750    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.720718 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3491  MltA domain protein  84.32 
 
 
374 aa  641    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00102732  decreased coverage  0.0000391078 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0538  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  86.93 
 
 
372 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0177949  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3173  MltA  57.77 
 
 
382 aa  423  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.647325  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0640  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  84.35 
 
 
277 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.699933  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3018  MltA  58.58 
 
 
393 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.707687  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2876  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  58.43 
 
 
380 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.268076  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3118  MltA domain protein  53.91 
 
 
380 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.212465  normal  0.0576054 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2753  MltA domain protein  57.02 
 
 
384 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0054451  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3277  MltA  50.53 
 
 
374 aa  374  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.717533  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0165  MltA domain protein  47.38 
 
 
376 aa  342  1e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0151  MltA domain-containing protein  46.81 
 
 
375 aa  341  2e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.585633  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2446  MltA  46.93 
 
 
397 aa  325  6e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2232  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  48.57 
 
 
400 aa  323  4e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.490009  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3704  MltA:3D  46.08 
 
 
405 aa  322  6e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.472718 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3662  MltA domain protein  50.29 
 
 
418 aa  316  5e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2635  MltA  44.14 
 
 
421 aa  277  2e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3470  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  46.9 
 
 
397 aa  268  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348474  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3902  MltA domain-containing protein  39.62 
 
 
431 aa  259  8e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0352522 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0639  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  90.3 
 
 
134 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.229529  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4651  MltA domain-containing protein  45.35 
 
 
433 aa  251  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1285  MltA  37.28 
 
 
386 aa  249  9e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4013  MltA domain-containing protein  45.51 
 
 
402 aa  249  9e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3363  MltA domain protein  45.37 
 
 
380 aa  248  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.894208  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3444  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  42.53 
 
 
342 aa  245  8e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2854  MltA  42.9 
 
 
352 aa  245  9.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351784  normal  0.348654 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3607  murein degrading transglycosylase protein  40.51 
 
 
398 aa  242  7e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0365  MltA  43.28 
 
 
456 aa  241  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4166  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  38.54 
 
 
386 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0843  MltA domain-containing protein  43.37 
 
 
416 aa  239  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4971  MltA domain protein  37.16 
 
 
392 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4844  MltA domain-containing protein  36.92 
 
 
392 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2411  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0494  MltA domain-containing protein  39.55 
 
 
383 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0190  MltA  41.21 
 
 
338 aa  236  5.0000000000000005e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.386735  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48520  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  37.66 
 
 
385 aa  235  9e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000207292  normal  0.163378 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1240  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  44.41 
 
 
341 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4828  MltA domain-containing protein  40.69 
 
 
435 aa  233  5e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.368727  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5020  MltA domain-containing protein  38.1 
 
 
383 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.946608 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3893  MltA domain-containing protein  40.57 
 
 
414 aa  232  8.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.304798 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2901  MltA domain-containing protein  44.41 
 
 
341 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.249493  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2677  MltA domain-containing protein  42.63 
 
 
341 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.345131 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4651  MltA  41.16 
 
 
422 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.139284  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1025  transglycosylase, putative  40.17 
 
 
399 aa  229  5e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4845  MltA domain protein  40.38 
 
 
475 aa  229  6e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.603998  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5273  MltA  37.47 
 
 
402 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542778  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0119  MltA domain protein  39.47 
 
 
386 aa  226  8e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0707409 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1211  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  36.51 
 
 
404 aa  224  2e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.632654  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5152  MltA domain protein  38.89 
 
 
382 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0880  MltA:3D  40.64 
 
 
403 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0155  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  35.48 
 
 
543 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0300  MltA  34.92 
 
 
542 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1975  hypothetical protein  34.71 
 
 
398 aa  219  7e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1970  hypothetical protein  34.44 
 
 
396 aa  218  1e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0401  membrane-bound lytic murein transglycosylase  38.81 
 
 
506 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0287  MltA domain protein  40.5 
 
 
405 aa  215  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.797874  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0420  MltA  38.54 
 
 
492 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0118  MltA  35.75 
 
 
500 aa  211  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0425257  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0108  membrane-bound lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 
502 aa  206  7e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0364059 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2144  MltA domain protein  38.05 
 
 
356 aa  206  7e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1247  MltA domain-containing protein  39.14 
 
 
354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3831  MltA domain-containing protein  35.77 
 
 
412 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.328531  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2017  MltA  41.85 
 
 
440 aa  195  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00129045 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0306  MltA domain protein  34.2 
 
 
497 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0484  MltA domain-containing protein  35.2 
 
 
416 aa  183  6e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2049  MltA domain-containing protein  35.92 
 
 
396 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0057  MltA domain protein  39.59 
 
 
395 aa  179  8e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0069  MltA domain protein  40.77 
 
 
395 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1995  transglycosylase-related protein  33.42 
 
 
362 aa  177  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2075  transglycosylase-related protein  33.42 
 
 
369 aa  176  7e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4085  MltA domain-containing protein  38.35 
 
 
395 aa  176  7e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000353348  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0053  membrane-bound lytic murein transglycosylase  39.06 
 
 
399 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3486  MltA  34.7 
 
 
368 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2981  MltA domain-containing protein  35.05 
 
 
413 aa  173  3.9999999999999995e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1143  MltA domain protein  36.52 
 
 
351 aa  173  5e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000848892 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0055  MltA domain-containing protein  40.43 
 
 
405 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.158061 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0365  MltA domain-containing protein  36.86 
 
 
514 aa  172  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.914991  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1358  MltA domain protein  37.89 
 
 
386 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0139  MltA domain-containing protein  31.71 
 
 
400 aa  171  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0583  MltA  34.77 
 
 
407 aa  170  5e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0658317  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3112  MltA domain-containing protein  34.34 
 
 
382 aa  168  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1398  MltA domain protein  40.23 
 
 
389 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1368  MltA domain protein  40.23 
 
 
389 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3943  MltA domain protein  32.14 
 
 
372 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0886  MltA domain protein  37.23 
 
 
390 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.341693  hitchhiker  0.00895003 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1254  murein transglycosylase A  32 
 
 
363 aa  160  3e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000109222  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4269  MltA domain protein  31.23 
 
 
372 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.36621 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>