142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_0640 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0640  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  100 
 
 
277 aa  564  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.699933  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0936  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  100 
 
 
425 aa  563  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.988318  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3551  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  100 
 
 
425 aa  563  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.383635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3578  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  100 
 
 
425 aa  563  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1906  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  100 
 
 
425 aa  563  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.569775  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2905  membrane-bound lytic murein transglycosylase A, putative  95.31 
 
 
433 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.622173  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3570  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  100 
 
 
382 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0538  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  100 
 
 
372 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0177949  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0443  MltA domain-containing protein  82.44 
 
 
410 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0538  MltA domain-containing protein  84.35 
 
 
410 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2856  MltA domain-containing protein  84.73 
 
 
410 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.720718 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3625  membrane-bound lytic murein transglycosylase  83.21 
 
 
410 aa  410  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.475479  normal  0.908257 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2567  MltA  83.59 
 
 
409 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2694  MltA domain-containing protein  77.1 
 
 
410 aa  407  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0510  MltA domain-containing protein  83.97 
 
 
410 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.916574 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0468  MltA domain-containing protein  82.74 
 
 
374 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0646444  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0465  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  74.78 
 
 
374 aa  345  5e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3491  MltA domain protein  74.78 
 
 
374 aa  341  9e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00102732  decreased coverage  0.0000391078 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3173  MltA  49.55 
 
 
382 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.647325  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2876  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  56.25 
 
 
380 aa  207  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.268076  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3018  MltA  46.83 
 
 
393 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.707687  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2753  MltA domain protein  53.8 
 
 
384 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0054451  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3118  MltA domain protein  54.24 
 
 
380 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.212465  normal  0.0576054 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3277  MltA  51.4 
 
 
374 aa  199  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.717533  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2446  MltA  43.5 
 
 
397 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0165  MltA domain protein  41.48 
 
 
376 aa  156  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0151  MltA domain-containing protein  36.99 
 
 
375 aa  155  6e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.585633  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3662  MltA domain protein  44.33 
 
 
418 aa  149  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2854  MltA  43.26 
 
 
352 aa  145  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351784  normal  0.348654 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2232  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  39.6 
 
 
400 aa  142  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.490009  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3444  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  39.42 
 
 
342 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3704  MltA:3D  36.95 
 
 
405 aa  125  6e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.472718 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2635  MltA  36.65 
 
 
421 aa  124  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1240  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  41.71 
 
 
341 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2901  MltA domain-containing protein  41.71 
 
 
341 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.249493  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0300  MltA  29.68 
 
 
542 aa  118  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0190  MltA  38.86 
 
 
338 aa  118  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.386735  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2677  MltA domain-containing protein  39.31 
 
 
341 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.345131 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3607  murein degrading transglycosylase protein  36.63 
 
 
398 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0155  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  30.91 
 
 
543 aa  115  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4845  MltA domain protein  36.57 
 
 
475 aa  115  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.603998  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1285  MltA  33.67 
 
 
386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1247  MltA domain-containing protein  35.35 
 
 
354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0365  MltA  35.29 
 
 
456 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3470  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  38.17 
 
 
397 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348474  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0401  membrane-bound lytic murein transglycosylase  33.63 
 
 
506 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0420  MltA  31.96 
 
 
492 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1975  hypothetical protein  28.1 
 
 
398 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0118  MltA  32.73 
 
 
500 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0425257  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0306  MltA domain protein  29.63 
 
 
497 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0108  membrane-bound lytic murein transglycosylase  30.08 
 
 
502 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0364059 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1211  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  31.94 
 
 
404 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.632654  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3902  MltA domain-containing protein  31.74 
 
 
431 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0352522 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1970  hypothetical protein  27.62 
 
 
396 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4844  MltA domain-containing protein  30.8 
 
 
392 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2411  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4971  MltA domain protein  30.8 
 
 
392 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5152  MltA domain protein  32.03 
 
 
382 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0287  MltA domain protein  35.37 
 
 
405 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.797874  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4651  MltA domain-containing protein  34.41 
 
 
433 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5020  MltA domain-containing protein  30.89 
 
 
383 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.946608 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4013  MltA domain-containing protein  34.57 
 
 
402 aa  103  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0494  MltA domain-containing protein  31.55 
 
 
383 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4166  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  31.49 
 
 
386 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3363  MltA domain protein  34.57 
 
 
380 aa  102  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.894208  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48520  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  29.91 
 
 
385 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000207292  normal  0.163378 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3893  MltA domain-containing protein  33.67 
 
 
414 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.304798 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4828  MltA domain-containing protein  33.33 
 
 
435 aa  101  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.368727  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0843  MltA domain-containing protein  30.95 
 
 
416 aa  99  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0484  MltA domain-containing protein  42.55 
 
 
416 aa  98.6  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4651  MltA  33.33 
 
 
422 aa  95.9  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.139284  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2144  MltA domain protein  30.94 
 
 
356 aa  94.4  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0119  MltA domain protein  30.26 
 
 
386 aa  94  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0707409 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1025  transglycosylase, putative  30.62 
 
 
399 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2981  MltA domain-containing protein  32.88 
 
 
413 aa  93.6  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5273  MltA  28.38 
 
 
402 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542778  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1358  MltA domain protein  42.61 
 
 
386 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1840  MltA domain protein  32.76 
 
 
418 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290365  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2049  MltA domain-containing protein  30.94 
 
 
396 aa  89  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0880  MltA:3D  31.44 
 
 
403 aa  89  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1398  MltA domain protein  42.11 
 
 
389 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0886  MltA domain protein  42.61 
 
 
390 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.341693  hitchhiker  0.00895003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1368  MltA domain protein  42.11 
 
 
389 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2017  MltA  38.55 
 
 
440 aa  86.7  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00129045 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3831  MltA domain-containing protein  34.18 
 
 
412 aa  86.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.328531  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1143  MltA domain protein  41.13 
 
 
351 aa  86.7  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000848892 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1561  MltA domain-containing protein  32.14 
 
 
387 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_004310  BR2075  transglycosylase-related protein  30 
 
 
369 aa  85.5  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1995  transglycosylase-related protein  30 
 
 
362 aa  85.5  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0583  MltA  30.57 
 
 
407 aa  84  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0658317  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0139  MltA domain-containing protein  29.77 
 
 
400 aa  80.5  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0967  MltA  34.43 
 
 
411 aa  79.7  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.820227  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0520  3D domain protein  37.01 
 
 
534 aa  79  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1680  MltA domain protein  32.73 
 
 
383 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2733  transglycosylase, putative  40.32 
 
 
412 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.927679  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0606  MltA domain protein  39.81 
 
 
358 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.964162  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3486  MltA  30.99 
 
 
368 aa  77.4  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0999  MltA domain protein  33.63 
 
 
407 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3159  MltA domain-containing protein  36.36 
 
 
411 aa  75.9  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3112  MltA domain-containing protein  34.27 
 
 
382 aa  75.9  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0501  MltA domain protein  38.71 
 
 
412 aa  74.7  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>