59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4438 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4438  hypothetical protein  100 
 
 		 476 aa  982    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.35414  normal  0.628211 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3361  hypothetical protein  63.03 
 
 		 482 aa  635    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0373  hypothetical protein  45.82 
 
 		 481 aa  450  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4173  hypothetical protein  45.6 
 
 		 479 aa  410  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0983315  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1037  hypothetical protein  45.52 
 
 		 477 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.960638  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4364  hypothetical protein  32 
 
 		 484 aa  210  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.945805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0314  hypothetical protein  30.96 
 
 		 210 aa  105  2e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0663161  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0169  hypothetical protein  33.95 
 
 		 211 aa  102  2e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.917424  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0275  hypothetical protein  33.33 
 
 		 210 aa  101  3e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00635248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0866  hypothetical protein  29.61 
 
 		 511 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0849  hypothetical protein  30.9 
 
 		 480 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.338117  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6511  hypothetical protein  27.83 
 
 		 497 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3820  hypothetical protein  29.46 
 
 		 541 aa  77.4  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1653  hypothetical protein  27.59 
 
 		 500 aa  73.2  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0855  hypothetical protein  29.13 
 
 		 511 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1597  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  27.43 
 
 		 286 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.417903  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0266  hypothetical protein  23.64 
 
 		 263 aa  72  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0144  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  27.92 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5775  hypothetical protein  27.05 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.314122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0072  hypothetical protein  26.03 
 
 		 838 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.661071  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0167  hypothetical protein  25.33 
 
 		 632 aa  69.3  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.427298  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3018  hypothetical protein  27.82 
 
 		 441 aa  69.3  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00034439  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2550  hypothetical protein  26.38 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4725  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  25 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045977 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004333  hypothetical protein  26.09 
 
 		 1199 aa  68.2  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330356  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2483  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  25.17 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000992077  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0345  hypothetical protein  29.67 
 
 		 474 aa  66.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0836  hypothetical protein  26.32 
 
 		 613 aa  64.7  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.715517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17060  hypothetical protein  24.89 
 
 		 294 aa  62.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3482  hypothetical protein  34.38 
 
 		 325 aa  62.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5662  hypothetical protein  25 
 
 		 442 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0687  hypothetical protein  26.15 
 
 		 519 aa  60.5  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4003  hypothetical protein  24.74 
 
 		 906 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0925  hypothetical protein  34.82 
 
 		 461 aa  58.9  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.841538  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5659  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1319 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0145  hypothetical protein  23.11 
 
 		 306 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.185076  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0454  phage protein  23.72 
 
 		 538 aa  53.9  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267672  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2653  phage protein  23.72 
 
 		 538 aa  53.9  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0142  hypothetical protein  25.11 
 
 		 323 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253672 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2020  hypothetical protein  24.55 
 
 		 290 aa  53.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6920  hypothetical protein  23.11 
 
 		 293 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2861  hypothetical protein  23.81 
 
 		 504 aa  52  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0476882  normal  0.0347919 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6364  hypothetical protein  26.64 
 
 		 606 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.038941  normal  0.601528 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0156  hypothetical protein  22.69 
 
 		 306 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3327  hypothetical protein  24.32 
 
 		 435 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000506493  hitchhiker  9.65434e-22 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1324  hypothetical protein  27.27 
 
 		 716 aa  50.4  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.772779 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0626  hypothetical protein  25 
 
 		 496 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339165 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0138  hypothetical protein  23.01 
 
 		 306 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.650511  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6572  hypothetical protein  29.93 
 
 		 358 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102603  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3377  phage protein  33.94 
 
 		 516 aa  47.4  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00845273  hitchhiker  0.00000000000000133815 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2487  hypothetical protein  26.36 
 
 		 436 aa  47.4  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0438109  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0929  hypothetical protein  23.84 
 
 		 409 aa  46.2  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.230723  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2265  hypothetical protein  22.76 
 
 		 540 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730456  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1992  hypothetical protein  28.22 
 
 		 518 aa  46.2  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4272  hypothetical protein  23.96 
 
 		 494 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0228  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  27.95 
 
 		 1036 aa  44.3  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1068  hypothetical protein  33.67 
 
 		 480 aa  43.9  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1090  hypothetical protein  25.32 
 
 		 268 aa  43.9  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1557  hypothetical protein  25.48 
 
 		 377 aa  43.5  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.71793  normal  0.744672 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>