11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4272 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4272  hypothetical protein  100 
 
 		 494 aa  1011    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0626  hypothetical protein  56.45 
 
 		 496 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339165 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1557  hypothetical protein  34.44 
 
 		 377 aa  193  6e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.71793  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2247  hypothetical protein  26.55 
 
 		 351 aa  62.4  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0221493  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4364  hypothetical protein  23.64 
 
 		 484 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.945805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0025  hypothetical protein  24.54 
 
 		 603 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0033  hypothetical protein  24.54 
 
 		 603 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3361  hypothetical protein  24.74 
 
 		 482 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0867  hypothetical protein  23.22 
 
 		 451 aa  47.4  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.886139  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0855  hypothetical protein  25.99 
 
 		 511 aa  47  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4438  hypothetical protein  23.96 
 
 		 476 aa  45.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.35414  normal  0.628211 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>