14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0626 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0626  hypothetical protein  100 
 
 		 496 aa  1017    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339165 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4272  hypothetical protein  56.45 
 
 		 494 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1557  hypothetical protein  35.55 
 
 		 377 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.71793  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2247  hypothetical protein  29.68 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0221493  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4364  hypothetical protein  25 
 
 		 484 aa  63.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.945805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0025  hypothetical protein  25.97 
 
 		 603 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0033  hypothetical protein  25.97 
 
 		 603 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3361  hypothetical protein  23.11 
 
 		 482 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4438  hypothetical protein  25 
 
 		 476 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.35414  normal  0.628211 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1992  hypothetical protein  21.83 
 
 		 518 aa  47.8  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3859  hypothetical protein  28.02 
 
 		 734 aa  47.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0867  hypothetical protein  25 
 
 		 451 aa  47.4  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.886139  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0228  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  25.28 
 
 		 1036 aa  46.2  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0138  hypothetical protein  29.23 
 
 		 306 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.650511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>