171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2384 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA0671  permease, putative  84.81 
 
 		 365 aa  642    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2472  permease YjgP/YjgQ family protein  96.7 
 
 		 364 aa  688    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1174  permease, putative  84.81 
 
 		 365 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5798  YjgP/YjgQ like transporter  95.87 
 
 		 363 aa  712    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.159259 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0822  permease, putative  84.25 
 
 		 365 aa  640    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2384  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 363 aa  734    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1856  permease YjgP/YjgQ  96.43 
 
 		 364 aa  687    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2516  permease YjgP/YjgQ family protein  99.72 
 
 		 363 aa  733    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2467  permease YjgP/YjgQ family protein  96.7 
 
 		 364 aa  688    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2340  hypothetical protein  84.81 
 
 		 365 aa  642    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2945  hypothetical protein  84.81 
 
 		 365 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1014  hypothetical protein  84.53 
 
 		 365 aa  640    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.146018  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1021  hypothetical protein  84.81 
 
 		 365 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1654  hypothetical protein  84.81 
 
 		 365 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.398552  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0827  permease YjgP/YjgQ family protein  94.23 
 
 		 364 aa  702    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.249961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3639  membrane protein, YjgP/YjgQ like  85.64 
 
 		 365 aa  621  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  85.36 
 
 		 365 aa  619  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2226  permease YjgP/YjgQ family protein  84.49 
 
 		 370 aa  616  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2220  permease YjgP/YjgQ family protein  51.56 
 
 		 372 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2680  permease YjgP/YjgQ family protein  51.27 
 
 		 372 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2808  permease YjgP/YjgQ  50.55 
 
 		 372 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.94667  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1234  permease YjgP/YjgQ family protein  49.16 
 
 		 371 aa  358  7e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132199  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2416  hypothetical protein  50.57 
 
 		 372 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2684  permease YjgP/YjgQ  49.05 
 
 		 373 aa  349  4e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0622  permease YjgP/YjgQ family protein  49.44 
 
 		 371 aa  347  2e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0271293  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3081  permease YjgP/YjgQ  42.9 
 
 		 360 aa  292  7e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.770978  normal  0.0713723 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2407  permease YjgP/YjgQ  39.26 
 
 		 376 aa  272  6e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.481022  normal  0.64368 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0221  permease YjgP/YjgQ  38.1 
 
 		 361 aa  272  7e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2786  permease YjgP/YjgQ family protein  44.97 
 
 		 360 aa  269  5e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2115  permease YjgP/YjgQ  40.35 
 
 		 373 aa  266  5e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2170  permease YjgP/YjgQ family protein  39.33 
 
 		 373 aa  266  5e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2729  permease YjgP/YjgQ family protein  38.87 
 
 		 379 aa  256  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0581  hypothetical protein  37.14 
 
 		 359 aa  251  1e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.201151  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3163  permease YjgP/YjgQ family protein  37.2 
 
 		 365 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2596  permease YjgP/YjgQ family protein  37.46 
 
 		 364 aa  246  6e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0445451 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3538  permease YjgP/YjgQ family protein  37.92 
 
 		 375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147965 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1943  putative transmembrane protein  38.35 
 
 		 363 aa  241  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.729281  normal  0.0884093 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4923  permease YjgP/YjgQ family protein  35.63 
 
 		 372 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1724  permease YjgP/YjgQ family protein  37.13 
 
 		 363 aa  230  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1920  permease YjgP/YjgQ family protein  37.13 
 
 		 363 aa  230  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.960962 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1092  permease YjgP/YjgQ  32.49 
 
 		 375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  32.03 
 
 		 375 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0990  permease YjgP/YjgQ  30.81 
 
 		 373 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.171814  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4236  permease YjgP/YjgQ family protein  32.26 
 
 		 371 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  31.25 
 
 		 372 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  32.26 
 
 		 371 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0987  permease YjgP/YjgQ family protein  32.26 
 
 		 371 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1019  permease YjgP/YjgQ family protein  31.96 
 
 		 383 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2100  hypothetical protein  32.06 
 
 		 339 aa  179  7e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0377846  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  32.08 
 
 		 367 aa  177  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1283  hypothetical protein  31.23 
 
 		 372 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0559  permease YjgP/YjgQ family protein  30.95 
 
 		 372 aa  170  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.298895  hitchhiker  0.00000418027 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2139  permease YjgP/YjgQ family protein  32.44 
 
 		 367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1910  permease YjgP/YjgQ  28.94 
 
 		 381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11670  permease YjgP/YjgQ family  31.67 
 
 		 376 aa  163  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3526  permease YjgP/YjgQ family protein  30.46 
 
 		 372 aa  161  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.536872  normal  0.31629 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2114  permease YjgP/YjgQ family protein  30.56 
 
 		 386 aa  150  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.774642 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2082  hypothetical protein  31.53 
 
 		 366 aa  150  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000432404  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0680  permease YjgP/YjgQ family protein  29.43 
 
 		 372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.519951  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  27.62 
 
 		 370 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  27.62 
 
 		 370 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  27.35 
 
 		 370 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  30.35 
 
 		 369 aa  144  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1369  hypothetical protein  29.01 
 
 		 370 aa  143  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2555  hypothetical protein  27.2 
 
 		 359 aa  143  5e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  27.07 
 
 		 370 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1179  permease YjgP/YjgQ family protein  29.28 
 
 		 370 aa  143  6e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.301073  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2917  permease YjgP/YjgQ  29.36 
 
 		 386 aa  142  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2683  hypothetical protein  26.63 
 
 		 359 aa  141  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  28.42 
 
 		 371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  28.74 
 
 		 370 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3561  permease YjgP/YjgQ  28.45 
 
 		 368 aa  138  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000903673  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  30 
 
 		 370 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2826  permease YjgP/YjgQ family protein  28.45 
 
 		 370 aa  138  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00420336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3005  permease YjgP/YjgQ family protein  28.45 
 
 		 370 aa  138  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000818676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  30.17 
 
 		 370 aa  138  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2908  permease YjgP/YjgQ family protein  28.73 
 
 		 370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000409785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0925  permease YjgP/YjgQ family protein  29.65 
 
 		 370 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000914337  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  27.95 
 
 		 366 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1373  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.14 
 
 		 360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01575  permease YjgP/YjgQ  29.59 
 
 		 366 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154727  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  27.67 
 
 		 366 aa  132  7.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000155201  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  28.13 
 
 		 370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000695544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  30.21 
 
 		 370 aa  130  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1231  permease YjgP/YjgQ family protein  29.41 
 
 		 371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192979  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0389  permease YjgP/YjgQ family protein  29.39 
 
 		 371 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00124488  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0741  putative permease  27.3 
 
 		 388 aa  120  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4764  putative permease  31.54 
 
 		 366 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000634787  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4864  putative permease  31.54 
 
 		 366 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000973807  normal  0.308777 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1142  putative permease  29.09 
 
 		 370 aa  120  3e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4827  putative permease  31.54 
 
 		 366 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000984202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4883  permease  31.54 
 
 		 366 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00332815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4734  putative permease  31.54 
 
 		 366 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000385303  normal  0.325053 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0396  permease YjgP/YjgQ family protein  27.71 
 
 		 358 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.167769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3647  permease YjgP/YjgQ family protein  31.27 
 
 		 366 aa  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000993409  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3751  permease YjgP/YjgQ family protein  31 
 
 		 366 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000820962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04091  hypothetical protein  31 
 
 		 366 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000267736  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4742  putative permease  31 
 
 		 366 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000002134  normal  0.891327 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0875  hypothetical membrane spanning protein  29.52 
 
 		 372 aa  118  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4517  putative permease  31 
 
 		 366 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.2463499999999995e-20  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>