More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2189 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2320  ABC transporter, ATP-binding protein  99.57 
 
 
276 aa  437  1e-122  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2152  ABC transporter, ATP-binding protein  99.57 
 
 
264 aa  437  1e-122  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2189  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
231 aa  439  1e-122  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1068  ABC transporter, ATP-binding protein  99.57 
 
 
231 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1797  ABC transporter, ATP-binding protein  99.57 
 
 
231 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.515092  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0098  ABC transporter, ATP-binding protein  99.57 
 
 
231 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432018  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1310  ABC transporter, ATP-binding protein  99.57 
 
 
231 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2267  ABC transporter, ATP-binding protein  91.77 
 
 
276 aa  387  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5071  ABC transporter, ATPase subunit  76.62 
 
 
233 aa  326  2e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310601  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1498  ABC transporter related  78.92 
 
 
233 aa  325  5e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0282182 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6306  ABC transporter related  76 
 
 
233 aa  319  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1773  ABC transporter related  76 
 
 
233 aa  319  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.057555  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1798  ABC transporter related  76 
 
 
233 aa  319  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1684  ABC transporter related  77.97 
 
 
233 aa  317  8e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1712  ABC transporter related  77.09 
 
 
266 aa  312  3e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0987  ABC transporter related  71.23 
 
 
246 aa  299  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1864  ABC transporter related  68.14 
 
 
242 aa  288  5e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00206412  normal  0.0919522 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2322  ABC transporter, ATPase subunit  66.52 
 
 
242 aa  287  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0765  ABC transporter related  56.88 
 
 
224 aa  225  5e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0339667 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0699  ABC transporter related  56.42 
 
 
224 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.442107  normal  0.210343 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0749  ABC transporter ATP-binding protein  55.05 
 
 
230 aa  217  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2540  ABC transporter-related protein  47.94 
 
 
192 aa  144  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.263174  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1436  ABC transporter related  41.1 
 
 
221 aa  136  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343902  normal  0.0885291 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  31.6 
 
 
244 aa  119  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2530  ABC transporter related  34.26 
 
 
220 aa  117  2e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573558  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2481  ABC transporter related  34.26 
 
 
220 aa  117  2e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000539797  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0688  ABC transporter, ATP-binding protein  33.83 
 
 
218 aa  115  4e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.580982  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2038  ABC transporter, ATP-binding protein  32.87 
 
 
220 aa  114  1e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436914  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4667  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.78 
 
 
225 aa  108  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00446  hypothetical protein  37.24 
 
 
225 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0253  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  30.77 
 
 
240 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  7.10517e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0594  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  37.7 
 
 
225 aa  106  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.355686 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00441  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  37.24 
 
 
225 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0539  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  37.23 
 
 
225 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0529  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  37.7 
 
 
225 aa  106  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0569  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  37.24 
 
 
225 aa  106  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3072  ABC transporter related  34.34 
 
 
213 aa  106  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0425  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  37.7 
 
 
225 aa  105  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3126  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  37.7 
 
 
225 aa  105  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  9.46354e-05 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3120  ABC transporter related protein  37.7 
 
 
225 aa  105  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.981007  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0129  ABC transporter related  36.63 
 
 
202 aa  104  9e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00335673  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0610  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  33.78 
 
 
225 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0566  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  33.78 
 
 
225 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0533  ABC transporter related  42.69 
 
 
226 aa  104  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0549  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  33.78 
 
 
225 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0556  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  33.78 
 
 
225 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0551  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.67 
 
 
225 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.522757  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2233  ABC transporter related  29.19 
 
 
246 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.693391  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1879  ABC transporter-related protein  36.53 
 
 
362 aa  101  8e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0768  ABC transporter related  38.38 
 
 
199 aa  101  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0627  basic organic compound ABC-transporter  37.05 
 
 
251 aa  101  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1628  ABC transporter ATP-binding protein  34.9 
 
 
216 aa  100  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0700  ABC transporter related  35.35 
 
 
241 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.752157 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1086  ABC transporter related  36.69 
 
 
222 aa  100  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76035  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A10  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  34.74 
 
 
216 aa  99.4  5e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  8.52984e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0933  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  33.69 
 
 
212 aa  99  6e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  4.01651e-08  normal  0.238349 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1026  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.58 
 
 
260 aa  98.6  7e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.259586  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2298  ABC transporter related  26.91 
 
 
247 aa  97.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.78919e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2461  ABC transporter related  35.75 
 
 
251 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01090  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  32.88 
 
 
233 aa  97.1  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.848315  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0701  ABC transporter related  40.4 
 
 
197 aa  97.1  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0467  hypothetical protein  31.98 
 
 
352 aa  96.3  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.548776  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0803  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppF  35.27 
 
 
251 aa  95.9  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.592318  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1808  ABC transporter related  34.48 
 
 
213 aa  95.9  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0422599  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3833  ABC transporter related  35.38 
 
 
257 aa  95.9  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0861  ATPase  31.39 
 
 
363 aa  95.9  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0168  ABC transporter, ATP-binding protein  34.02 
 
 
215 aa  95.9  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0382909  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1038  ATPase  31.39 
 
 
363 aa  95.9  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.396319 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  31.92 
 
 
256 aa  95.1  8e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1382  polar amino acid ABC transporter ATPase  31.36 
 
 
267 aa  95.1  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282532  normal  0.874451 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1467  ABC transporter related protein  35.81 
 
 
222 aa  95.1  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0020  ABC-type sugar transport system, ATPase component  31.17 
 
 
373 aa  94.7  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  31.82 
 
 
242 aa  94.7  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  30.24 
 
 
258 aa  94.4  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0376  ABC transporter related  36.04 
 
 
251 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0713  ABC transporter related  31.63 
 
 
363 aa  94.4  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0292  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  33.48 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2021  ABC transporter related  33.49 
 
 
363 aa  94.4  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0183  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  31.1 
 
 
253 aa  94  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  9.42393e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4084  ABC transporter related  29.36 
 
 
231 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0225  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  32.47 
 
 
252 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.73407  hitchhiker  0.0063151 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  31.53 
 
 
244 aa  93.2  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1936  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  33.79 
 
 
245 aa  93.2  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0352158  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3121  ABC transporter related  38.07 
 
 
207 aa  93.2  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.522166  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0911  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  30 
 
 
242 aa  93.2  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.250049  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1533  ABC transporter related  29.33 
 
 
246 aa  93.6  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  5.34266e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0981  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  30 
 
 
242 aa  93.2  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  31.3 
 
 
339 aa  92.8  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0240  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  32.47 
 
 
252 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.773772  normal  0.21486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0249  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  32.47 
 
 
252 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1231  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  31.31 
 
 
242 aa  92.8  4e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0197  ABC transporter related protein  39.82 
 
 
206 aa  92.8  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.994247 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0433  glutamine transport ATP-binding protein GlnQ  30.84 
 
 
242 aa  92.8  4e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0911  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  30.45 
 
 
242 aa  92.8  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.233716  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3884  ABC transporter  35.35 
 
 
250 aa  92.4  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.940827  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1836  ABC transporter, ATPase subunit  38.12 
 
 
209 aa  92.4  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  30.81 
 
 
242 aa  92.4  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18750  ABC transporter related  32.34 
 
 
250 aa  92  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.78719e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  38.92 
 
 
244 aa  92  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  32.35 
 
 
240 aa  92  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>