39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0363 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0363  DNA-binding protein, putative  100 
 
 		 76 aa  158  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15227  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2545  phage transcriptional regulator, AlpA  62.69 
 
 		 81 aa  87.4  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227611  hitchhiker  0.000981483 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2652  AlpA family transcriptional regulator  60.29 
 
 		 76 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00696014  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1725  phage transcriptional regulator, AlpA  59.7 
 
 		 74 aa  85.1  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0616  prophage CP4-57 regulatory  56.34 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0353  Phage transcriptional regulator, AlpA  60 
 
 		 69 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2141  prophage CP4-57 regulatory  56.45 
 
 		 98 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1173  phage transcriptional regulator, AlpA  47.83 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.436282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3562  phage transcriptional regulator, AlpA  47.83 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3111  phage transcriptional regulator, AlpA  54.39 
 
 		 86 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0497  phage transcriptional regulator, AlpA  54.24 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2018  phage transcriptional regulator, AlpA  54.55 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2893  phage transcriptional regulator, AlpA  58 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0941309 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1133  phage transcriptional regulator, AlpA  50.91 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1468  phage transcriptional regulator, AlpA  50.82 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0978574  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3481  phage transcriptional regulator, AlpA  54.24 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1265  phage transcriptional regulator, AlpA  52.54 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3362  phage transcriptional regulator, AlpA  50.91 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2218  phage transcriptional regulator, AlpA  54.17 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.353724 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5807  phage transcriptional regulator, AlpA  47.69 
 
 		 91 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  0.0888575 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3870  phage transcriptional regulator, AlpA  38.1 
 
 		 80 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2950  hypothetical protein  36.73 
 
 		 103 aa  47  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.058037  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004310  phage transcriptional regulator AlpA  37.93 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.207831  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2339  phage transcriptional regulator, AlpA  42.86 
 
 		 73 aa  46.2  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0340  phage transcriptional regulator, AlpA  45.45 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1062  phage transcriptional regulator, AlpA  36.73 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.979085  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2186  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  33.78 
 
 		 85 aa  45.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0232094  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2662  Phage transcriptional regulator, AlpA  32.43 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1258  phage transcriptional regulator, AlpA  38.98 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1777  phage transcriptional regulator, AlpA  38.78 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.235945 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1897  hypothetical protein  32.26 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.088473  normal  0.90287 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1382  transcriptional regulator  35.42 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0999  phage transcriptional regulator, AlpA  45.65 
 
 		 57 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2683  phage transcriptional regulator, AlpA  50 
 
 		 77 aa  41.6  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000806139  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0481  phage transcriptional regulator, AlpA  53.12 
 
 		 70 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.922024  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1667  phage transcriptional regulator, AlpA  53.12 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.215931  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1700  phage transcriptional regulator, AlpA  35.29 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.843747  normal  0.0591517 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001834  predicted transcriptional regulator  34.69 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3522  phage transcriptional regulator, AlpA  34.69 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>