More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A0060 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_1487  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
128 aa  265  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1557  4-carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
128 aa  265  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0060  4-carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
128 aa  265  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.34038  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1204  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
128 aa  265  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0058  4-carboxymuconolactone decarboxylase  99.22 
 
 
128 aa  262  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161595  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0071  4-carboxymuconolactone decarboxylase  97.66 
 
 
128 aa  258  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499909  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  93.75 
 
 
128 aa  251  2e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3162  4-carboxymuconolactone decarboxylase  88.28 
 
 
128 aa  239  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  88.28 
 
 
128 aa  239  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4473  4-carboxymuconolactone decarboxylase  88.19 
 
 
128 aa  237  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5750  4-carboxymuconolactone decarboxylase  87.5 
 
 
129 aa  237  5e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5109  4-carboxymuconolactone decarboxylase  87.5 
 
 
129 aa  237  5e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3125  carboxymuconolactone decarboxylase  87.5 
 
 
129 aa  237  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5284  4-carboxymuconolactone decarboxylase  88.19 
 
 
128 aa  236  9e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.327444  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4461  4-carboxymuconolactone decarboxylase  84.38 
 
 
128 aa  234  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.273934 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0647  4-carboxymuconolactone decarboxylase (PcaC)  85.04 
 
 
130 aa  230  4e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.153527 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4316  4-carboxymuconolactone decarboxylase  84.38 
 
 
131 aa  229  8e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146371  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  78.12 
 
 
392 aa  204  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2061  4-carboxymuconolactone decarboxylase  78.12 
 
 
132 aa  203  6e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2454  4-carboxymuconolactone decarboxylase  78.57 
 
 
132 aa  201  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.835529  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  75.59 
 
 
396 aa  200  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0318  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  72.36 
 
 
133 aa  200  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623335  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2249  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  76.98 
 
 
131 aa  199  9e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0833929  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02850  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  71.54 
 
 
133 aa  198  2e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181902 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  71.2 
 
 
129 aa  196  9e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38170  4-carboxymuconolactone decarboxylase  70.73 
 
 
130 aa  194  5e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.230767  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1381  4-carboxymuconolactone decarboxylase  70.73 
 
 
130 aa  193  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760953  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4433  4-carboxymuconolactone decarboxylase  69.92 
 
 
130 aa  192  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145648  hitchhiker  0.00893399 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  69.92 
 
 
130 aa  192  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0210047  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2126  carboxymuconolactone decarboxylase  69.92 
 
 
132 aa  192  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191574  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  69.92 
 
 
132 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0594936 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  69.11 
 
 
132 aa  191  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1275  4-carboxymuconolactone decarboxylase  67.48 
 
 
130 aa  185  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.537713  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02910  4-carboxymuconolactone decarboxylase  71.9 
 
 
137 aa  180  6e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  62.5 
 
 
402 aa  166  7e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  57.85 
 
 
373 aa  160  8e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1577  4-carboxymuconolactone decarboxylase  62.9 
 
 
128 aa  159  9e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00107459  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  61.98 
 
 
161 aa  158  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4074  4-carboxymuconolactone decarboxylase  61.48 
 
 
154 aa  157  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  61.79 
 
 
393 aa  158  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0563  4-carboxymuconolactone decarboxylase  61.34 
 
 
393 aa  155  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1679  4-carboxymuconolactone decarboxylase  62.18 
 
 
393 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412767  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1745  4-carboxymuconolactone decarboxylase  62.18 
 
 
393 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  63.93 
 
 
391 aa  155  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  8.20278e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1729  4-carboxymuconolactone decarboxylase  62.18 
 
 
393 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0527  4-carboxymuconolactone decarboxylase  62.18 
 
 
393 aa  155  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1701  4-carboxymuconolactone decarboxylase  62.18 
 
 
393 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186237  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3004  3-oxoadipate enol-lactonase  59.66 
 
 
390 aa  150  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2568  carboxymuconolactone decarboxylase  53.78 
 
 
132 aa  143  7e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.136392 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  58.97 
 
 
134 aa  142  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2974  4-carboxymuconolactone decarboxylase  49.59 
 
 
125 aa  142  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7932  4-carboxymuconolactone decarboxylase  62.5 
 
 
132 aa  140  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2255  carboxymuconolactone decarboxylase  48.8 
 
 
129 aa  139  2e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344767  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2190  4-carboxymuconolactone decarboxylase  54.1 
 
 
133 aa  138  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2322  4-carboxymuconolactone decarboxylase  55.46 
 
 
129 aa  138  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254356  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  58.87 
 
 
397 aa  137  5e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5222  Carboxymuconolactone decarboxylase  47.2 
 
 
126 aa  137  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0618  4-carboxymuconolactone decarboxylase  54.92 
 
 
400 aa  136  8e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3726  4-carboxymuconolactone decarboxylase  50.42 
 
 
135 aa  135  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4821  carboxymuconolactone decarboxylase  50.41 
 
 
126 aa  135  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0925911  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7078  4-carboxymuconolactone decarboxylase  48.8 
 
 
134 aa  134  3e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0342158  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  63.2 
 
 
397 aa  134  3e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  57.85 
 
 
396 aa  134  3e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  52.1 
 
 
123 aa  134  3e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2082  carboxymuconolactone decarboxylase  46.77 
 
 
129 aa  134  3e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.984068 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0939  carboxymuconolactone decarboxylase  46.4 
 
 
126 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.947177  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0830  carboxymuconolactone decarboxylase  46.4 
 
 
126 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3648  carboxymuconolactone decarboxylase  46.77 
 
 
129 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00963465  normal  0.158809 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0571  4-carboxymuconolactone decarboxylase  50.41 
 
 
134 aa  134  6e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3382  4-carboxymuconolactone decarboxylase  50.41 
 
 
134 aa  133  7e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5940  4-carboxymuconolactone decarboxylase  48.8 
 
 
134 aa  133  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3552  4-carboxymuconolactone decarboxylase  50.41 
 
 
134 aa  133  9e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2260  carboxymuconolactone decarboxylase  46.83 
 
 
129 aa  132  1e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2960  carboxymuconolactone decarboxylase  53.15 
 
 
126 aa  132  2e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00839552  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0681  carboxymuconolactone decarboxylase  50.41 
 
 
128 aa  132  2e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0673  Carboxymuconolactone decarboxylase  50.41 
 
 
128 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2734  4-carboxymuconolactone decarboxylase  48.76 
 
 
127 aa  130  4e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.888805  hitchhiker  6.28107e-05 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4207  4-carboxymuconolactone decarboxylase  48.78 
 
 
135 aa  130  4e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3703  carboxymuconolactone decarboxylase  49.59 
 
 
128 aa  130  7e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1984  4-carboxymuconolactone decarboxylase  49.17 
 
 
134 aa  129  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3646  carboxymuconolactone decarboxylase  48.78 
 
 
128 aa  129  1e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2692  4-carboxymuconolactone decarboxylase  52.54 
 
 
133 aa  129  1e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00273056  normal  0.231258 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0644  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.5 
 
 
138 aa  129  1e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0606  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.5 
 
 
138 aa  129  1e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3478  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.66 
 
 
128 aa  129  2e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  53.39 
 
 
393 aa  129  2e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3235  4-carboxymuconolactone decarboxylase  48.25 
 
 
129 aa  129  2e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621974  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6127  4-carboxymuconolactone decarboxylase  48.72 
 
 
136 aa  127  7e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1912  carboxymuconolactone decarboxylase  47.11 
 
 
126 aa  127  7e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.955365  normal  0.169242 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  53.91 
 
 
393 aa  126  8e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  55.83 
 
 
386 aa  125  2e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  49.59 
 
 
127 aa  125  2e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.89978  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0934  carboxymuconolactone decarboxylase  50.88 
 
 
124 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5081  Carboxymuconolactone decarboxylase  52.03 
 
 
122 aa  125  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0832  4-carboxymuconolactone decarboxylase  50.88 
 
 
126 aa  124  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190386  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3442  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.61 
 
 
127 aa  124  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222691  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1856  4-carboxymuconolactone decarboxylase  52.34 
 
 
138 aa  123  8e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.177717  normal  0.121417 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2931  carboxymuconolactone decarboxylase  46.34 
 
 
129 aa  123  8e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000640912  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4478  4-carboxymuconolactone decarboxylase  47.46 
 
 
127 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2687  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.54 
 
 
140 aa  121  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.22317 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>