More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0309 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0309  50S ribosomal protein L21  100 
 
 
157 aa  307  4e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.848766  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  71.43 
 
 
188 aa  151  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1050  50S ribosomal protein L21  72.38 
 
 
129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436024  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  71.43 
 
 
142 aa  150  5.9999999999999996e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  64.71 
 
 
105 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  63.73 
 
 
105 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  64.36 
 
 
124 aa  135  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  61.76 
 
 
104 aa  132  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  54.05 
 
 
223 aa  124  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  53.77 
 
 
131 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  61.39 
 
 
104 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3819  50S ribosomal protein L21  53.77 
 
 
131 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.711796  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  53.77 
 
 
136 aa  122  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  54.72 
 
 
198 aa  120  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4103  50S ribosomal protein L21  55.66 
 
 
140 aa  117  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3283  50S ribosomal protein L21  56.44 
 
 
125 aa  117  7e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  58.82 
 
 
103 aa  117  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3461  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  62.96 
 
 
230 aa  116  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2589  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0231  50S ribosomal protein L21  57.14 
 
 
104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  51.89 
 
 
221 aa  113  8.999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  53.85 
 
 
104 aa  110  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0514  50S ribosomal protein L21  52.31 
 
 
128 aa  110  9e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0439  50S ribosomal protein L21  51.54 
 
 
146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0153  50S ribosomal protein L21  51.94 
 
 
132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  49.11 
 
 
115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 
102 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4922  50S ribosomal protein L21  57.8 
 
 
130 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0179671  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1683  50S ribosomal protein L21  48.21 
 
 
115 aa  108  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000196723  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  50.5 
 
 
104 aa  107  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0246  50S ribosomal protein L21  57.98 
 
 
128 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4877  50S ribosomal protein L21  56.88 
 
 
130 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4414  50S ribosomal protein L21  56.88 
 
 
130 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 
102 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2280  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  47.37 
 
 
258 aa  105  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.372527  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 
102 aa  104  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0194  50S ribosomal protein L21  48.67 
 
 
171 aa  103  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.472355 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 
102 aa  103  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  49.5 
 
 
103 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0589  50S ribosomal protein L21  60.95 
 
 
128 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0151  50S ribosomal protein L21  58.1 
 
 
126 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.772781  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  50 
 
 
104 aa  101  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  52.04 
 
 
103 aa  101  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  50.5 
 
 
103 aa  101  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  51.02 
 
 
103 aa  100  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  51.49 
 
 
102 aa  100  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  42.86 
 
 
106 aa  100  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 
102 aa  100  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  49.5 
 
 
103 aa  100  9e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 
102 aa  99.8  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4210  50S ribosomal protein L21  58.82 
 
 
105 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124058 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  43.14 
 
 
104 aa  99  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 
102 aa  98.6  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  51.02 
 
 
100 aa  98.6  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 
103 aa  98.2  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  50.98 
 
 
104 aa  97.4  6e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0427  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 
127 aa  97.4  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518139  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  46.94 
 
 
103 aa  97.1  8e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 
103 aa  96.7  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 
103 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 
103 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3352  50S ribosomal protein L21P  54.08 
 
 
101 aa  96.7  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000809209  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  46.94 
 
 
103 aa  95.5  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1755  50S ribosomal protein L21  46.94 
 
 
103 aa  95.5  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.092624  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 
103 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  50 
 
 
103 aa  95.5  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  47.96 
 
 
149 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4723  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 
105 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  49.5 
 
 
103 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 
102 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0929  50S ribosomal protein L21  51.92 
 
 
98 aa  94.4  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 
103 aa  94  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  41.58 
 
 
103 aa  94  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2576  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 
103 aa  93.6  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 
105 aa  93.2  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0086  50S ribosomal protein L21  43.27 
 
 
104 aa  92.8  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109341  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  47.96 
 
 
103 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  47.52 
 
 
103 aa  92.8  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4328  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 
138 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.665904 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2704  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 
103 aa  91.7  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0891  50S ribosomal protein L21  44.9 
 
 
103 aa  92  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0723214 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 
103 aa  92  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 
103 aa  92  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 
103 aa  91.7  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3449  50S ribosomal protein L21  47.96 
 
 
103 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00752607  hitchhiker  0.00404832 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0507  50S ribosomal protein L21  47.96 
 
 
103 aa  91.3  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  46.53 
 
 
103 aa  91.7  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 
103 aa  91.3  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  46.94 
 
 
102 aa  90.9  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 
104 aa  90.9  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  45.54 
 
 
103 aa  90.9  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2041  50S ribosomal protein L21  52.88 
 
 
164 aa  90.9  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.214914 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4512  ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  90.5  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03731  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 
103 aa  90.5  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000230006  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3526  50S ribosomal protein L21  46.94 
 
 
103 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0108  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 
104 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.111218 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1140  50S ribosomal protein L21  46.94 
 
 
103 aa  89.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  43.88 
 
 
131 aa  89.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0509  50S ribosomal protein L21  46.94 
 
 
103 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00322629  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0446  50S ribosomal protein L21  46.94 
 
 
103 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0551  50S ribosomal protein L21  46.94 
 
 
103 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000001032  normal  0.0263071 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>