More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_41790 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_41790  carbohydrate transport membrane protein  100 
 
 
415 aa  823    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  38.56 
 
 
427 aa  254  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  36.67 
 
 
420 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  37.18 
 
 
420 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  33.07 
 
 
425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  32.49 
 
 
405 aa  199  6e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  35.55 
 
 
420 aa  196  8.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  31.74 
 
 
418 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 
413 aa  183  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0872  major facilitator transporter  30.15 
 
 
414 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104086  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  35.38 
 
 
431 aa  180  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  29.38 
 
 
413 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1604  major facilitator family tranporter  30.02 
 
 
412 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1470  major facilitator family transporter  30.02 
 
 
412 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1500  major facilitator family transporter  30.02 
 
 
430 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0767  major facilitator family tranporter  30.02 
 
 
430 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0560  major facilitator family transporter  30.02 
 
 
412 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0591  major facilitator family tranporter  30.02 
 
 
412 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1277  major facilitator family transporter  30.02 
 
 
412 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.552414  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1756  major facilitator transporter  35.26 
 
 
407 aa  172  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2786  major facilitator family tranporter  29.6 
 
 
412 aa  170  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000499606  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4431  major facilitator transporter  30.73 
 
 
405 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000464132  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1260  major facilitator transporter  30.47 
 
 
405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00393517  normal  0.0788656 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1166  major facilitator transporter  31.37 
 
 
410 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117427  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1178  major facilitator transporter  30.77 
 
 
410 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0817029  normal  0.188851 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0808  major facilitator transporter  30.21 
 
 
405 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000152405  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1289  major facilitator transporter  30.21 
 
 
405 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000170185  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0296  major facilitator transporter  31.15 
 
 
431 aa  159  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  30.58 
 
 
412 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  29.83 
 
 
407 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2031  major facilitator transporter  29.98 
 
 
410 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000192505  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  36.23 
 
 
461 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0236  major facilitator superfamily transporter  30.25 
 
 
423 aa  151  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4899  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 
415 aa  147  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0289  major facilitator superfamily MFS_1  29.75 
 
 
412 aa  145  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0294  major facilitator superfamily transporter  29.48 
 
 
412 aa  142  7e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000111052 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  31.54 
 
 
395 aa  139  7.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1446  major facilitator transporter  31.36 
 
 
416 aa  138  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 
392 aa  129  7.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1279  major facilitator superfamily transporter  28.03 
 
 
493 aa  124  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  27.99 
 
 
414 aa  123  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  27.25 
 
 
432 aa  117  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  23.93 
 
 
434 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  24.23 
 
 
434 aa  107  6e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  27.39 
 
 
418 aa  106  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 
441 aa  106  9e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  26.76 
 
 
417 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  29.08 
 
 
418 aa  99.8  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  26.11 
 
 
417 aa  98.6  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  22.92 
 
 
445 aa  97.8  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  26.39 
 
 
428 aa  97.8  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2772  major facilitator transporter  26.74 
 
 
397 aa  95.1  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0450  major facilitator superfamily MFS_1  24.38 
 
 
436 aa  95.5  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.912084  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1897  major facilitator transporter  29.21 
 
 
416 aa  92.8  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0473254  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5613  major facilitator protein family permease  28.7 
 
 
432 aa  90.5  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 
411 aa  89.7  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1490  major facilitator transporter  27.65 
 
 
427 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189239  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  23.1 
 
 
437 aa  88.6  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  26.43 
 
 
432 aa  87.8  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  27.22 
 
 
434 aa  88.2  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 
421 aa  87.4  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0480  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 
395 aa  87  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1373  major facilitator transporter  29.18 
 
 
390 aa  86.3  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  24.06 
 
 
446 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1147  major facilitator superfamily transporter  24.86 
 
 
420 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1068  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 
420 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27901  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 
415 aa  84  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0117  major facilitator transporter  25.85 
 
 
389 aa  83.6  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1034  hypothetical protein  27.43 
 
 
406 aa  83.6  0.000000000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  25.21 
 
 
430 aa  83.2  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  25.21 
 
 
430 aa  82.4  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2160  major facilitator transporter  27.12 
 
 
433 aa  82.8  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  24.16 
 
 
425 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  23.84 
 
 
430 aa  81.3  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  24.09 
 
 
430 aa  81.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  24.87 
 
 
423 aa  80.1  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  29.1 
 
 
437 aa  80.1  0.00000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0158  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 
411 aa  80.1  0.00000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  24.26 
 
 
432 aa  80.1  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  24.26 
 
 
432 aa  79.7  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6493  major facilitator transporter  28 
 
 
417 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  normal  0.0270431 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0019  major facilitator family transporter  24.53 
 
 
452 aa  79.3  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2159  transporter, MFS superfamily  24.53 
 
 
452 aa  79.3  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 
421 aa  79  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  23.25 
 
 
443 aa  77.8  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  28.28 
 
 
437 aa  77.8  0.0000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  24.81 
 
 
423 aa  77  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0041  major facilitator transporter  28.4 
 
 
390 aa  77  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  24.11 
 
 
434 aa  76.3  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0113  major facilitator superfamily transporter  25 
 
 
407 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0130  major facilitator superfamily MFS_1  24.64 
 
 
407 aa  73.2  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1663  major facilitator family transporter  24.29 
 
 
428 aa  73.2  0.000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.106817  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0529  transporter, MFS superfamily  22.37 
 
 
428 aa  73.2  0.000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.027512  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0031  major facilitator transporter  26.56 
 
 
390 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2835  major facilitator transporter  26.23 
 
 
428 aa  71.2  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0779  permease, putative  23.21 
 
 
411 aa  70.1  0.00000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.759724  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2438  hypothetical protein  20.51 
 
 
410 aa  69.7  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2584  hypothetical protein  20.51 
 
 
410 aa  69.7  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3235  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 
404 aa  69.3  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4524  major facilitator superfamily transporter  23.96 
 
 
450 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>