88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_41390 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_41390  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 329 aa  672    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196664  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  71.04 
 
 		 328 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  68.1 
 
 		 328 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  68.1 
 
 		 327 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  67.18 
 
 		 327 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  68.71 
 
 		 328 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  68.1 
 
 		 328 aa  454  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  67.48 
 
 		 328 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  66.87 
 
 		 328 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  66.87 
 
 		 328 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  66.56 
 
 		 328 aa  436  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  36.5 
 
 		 341 aa  195  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  36.47 
 
 		 329 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  36.18 
 
 		 843 aa  192  7e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  37.13 
 
 		 343 aa  188  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  36.7 
 
 		 344 aa  187  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  37.24 
 
 		 324 aa  183  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  37.46 
 
 		 330 aa  176  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  34.82 
 
 		 355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  34.76 
 
 		 314 aa  174  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 332 aa  173  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  37.74 
 
 		 320 aa  172  9e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  33.12 
 
 		 333 aa  166  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  35.82 
 
 		 354 aa  163  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  33.23 
 
 		 339 aa  162  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  34.58 
 
 		 383 aa  161  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  33.82 
 
 		 358 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  33.72 
 
 		 351 aa  158  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0049  FAD dependent oxidoreductase  30.49 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  30.64 
 
 		 407 aa  139  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  31.38 
 
 		 367 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  31.09 
 
 		 367 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 		 368 aa  125  8.000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3031  FAD dependent oxidoreductase  30.9 
 
 		 369 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 		 346 aa  115  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  30.14 
 
 		 360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1276  putative NAD/FAD-dependent oxidoreductase  29.56 
 
 		 340 aa  112  8.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1154  hypothetical protein  30.97 
 
 		 337 aa  110  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4691  FAD dependent oxidoreductase  27.36 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0114981 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1925  hypothetical protein  27.94 
 
 		 347 aa  105  8e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.315657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0825  hypothetical protein  30.49 
 
 		 316 aa  105  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1735  hypothetical protein  29.81 
 
 		 313 aa  105  9e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  29.52 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0625  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  26.04 
 
 		 413 aa  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484917 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  25.86 
 
 		 346 aa  99  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0204  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  24.53 
 
 		 389 aa  92.4  8e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.508635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4120  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  28.21 
 
 		 348 aa  92  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254972  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1750  hypothetical protein  28.89 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  28.79 
 
 		 319 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  28.61 
 
 		 381 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2190  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 		 344 aa  87  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2015  hypothetical protein  25.63 
 
 		 347 aa  85.1  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.509344 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1426  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  24.7 
 
 		 362 aa  83.2  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  23.94 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0132  hypothetical protein  27.17 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.751971  normal  0.181819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  24.36 
 
 		 361 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39046  FAD dependent oxidoreductase precursor  25 
 
 		 439 aa  68.2  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32874  predicted protein  25.25 
 
 		 484 aa  66.6  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48060  predicted protein  24.23 
 
 		 523 aa  64.3  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.387117  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2785  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81235  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0027  FAD dependent oxidoreductase  24.5 
 
 		 344 aa  57  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0507  FAD dependent oxidoreductase  25.28 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770202  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0540  FAD dependent oxidoreductase  24.72 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0536  FAD dependent oxidoreductase  24.72 
 
 		 342 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.84854  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  40 
 
 		 502 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  40 
 
 		 502 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4506  cyclohexanone monooxygenase  40.35 
 
 		 661 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.569378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1428  hypothetical protein  26.88 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.521801  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  43.4 
 
 		 490 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0926  amine oxidase  35.38 
 
 		 435 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00368983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  47.17 
 
 		 436 aa  43.9  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  43.4 
 
 		 487 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  43.4 
 
 		 482 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  43.4 
 
 		 482 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  43.4 
 
 		 485 aa  43.9  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  43.4 
 
 		 482 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  45.45 
 
 		 493 aa  43.9  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  43.4 
 
 		 490 aa  43.5  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  38.81 
 
 		 469 aa  43.5  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  43.4 
 
 		 490 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  42.11 
 
 		 421 aa  43.1  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1289  FAD dependent oxidoreductase  38.36 
 
 		 516 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.571457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  38.75 
 
 		 469 aa  43.1  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  40.68 
 
 		 415 aa  42.4  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_92705  predicted protein  21.67 
 
 		 365 aa  42.4  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.844655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  41.51 
 
 		 487 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  41.51 
 
 		 487 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>