More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3455 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  100 
 
 
246 aa  514  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  64.85 
 
 
249 aa  343  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  64.85 
 
 
249 aa  342  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  64.85 
 
 
249 aa  342  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  64.44 
 
 
249 aa  338  2.9999999999999998e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  64.85 
 
 
249 aa  337  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  64.44 
 
 
249 aa  337  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  63.87 
 
 
251 aa  333  2e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  61.51 
 
 
248 aa  332  3e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1631  undecaprenyl pyrophosphate synthase  55.51 
 
 
260 aa  291  5e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.060942  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.78 
 
 
260 aa  286  2e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.01 
 
 
259 aa  284  7e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09951  undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.81 
 
 
265 aa  284  8e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801732 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14881  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.56 
 
 
256 aa  281  6.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.574217 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.56 
 
 
256 aa  280  1e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10941  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.89 
 
 
266 aa  276  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.291205  normal  0.66612 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.95 
 
 
267 aa  273  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.32 
 
 
267 aa  271  9e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.32 
 
 
267 aa  268  5e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  51.69 
 
 
264 aa  264  8e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  51.5 
 
 
256 aa  263  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.57 
 
 
253 aa  258  6e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.57 
 
 
253 aa  258  6e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11991  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.16 
 
 
267 aa  258  9e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.113196  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
238 aa  257  1e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  50.21 
 
 
257 aa  257  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.23 
 
 
249 aa  255  6e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.84 
 
 
247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.14 
 
 
238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.58 
 
 
252 aa  251  6e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  49.13 
 
 
252 aa  250  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  50.64 
 
 
251 aa  250  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.43 
 
 
258 aa  249  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0709  undecaprenyl diphosphate synthase  48.95 
 
 
259 aa  249  2e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0105503  unclonable  0.000000024348 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23600  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.41 
 
 
259 aa  248  4e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0983  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.74 
 
 
241 aa  249  4e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017531  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  46.81 
 
 
247 aa  248  5e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  48.52 
 
 
248 aa  248  8e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  46.38 
 
 
246 aa  248  9e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1417  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.97 
 
 
267 aa  247  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0645618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  48.51 
 
 
245 aa  247  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.71 
 
 
257 aa  247  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  46.81 
 
 
246 aa  244  6e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  45.73 
 
 
263 aa  244  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  49.16 
 
 
254 aa  243  9.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  46.19 
 
 
266 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  48.31 
 
 
240 aa  241  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1193  undecaprenyl diphosphate synthase  50.86 
 
 
238 aa  240  2e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000857215  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  45.92 
 
 
239 aa  240  2e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  47.64 
 
 
252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.11 
 
 
258 aa  239  4e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2031  undecaprenyl diphosphate synthase  47.68 
 
 
260 aa  238  5e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2631  undecaprenyl diphosphate synthase  44.68 
 
 
263 aa  238  5e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000342439  normal  0.527492 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  46.72 
 
 
240 aa  238  8e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2489  undecaprenyl diphosphate synthase  47.26 
 
 
260 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2433  undecaprenyl diphosphate synthase  47.26 
 
 
260 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0292825  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2579  undecaprenyl diphosphate synthase  47.26 
 
 
260 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93392  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  46.05 
 
 
264 aa  237  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1439  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.42 
 
 
256 aa  237  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000108865 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0361  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.76 
 
 
255 aa  237  1e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.15 
 
 
256 aa  237  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88710  predicted protein  45.08 
 
 
273 aa  237  2e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0116194  decreased coverage  0.00230003 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  47.26 
 
 
260 aa  236  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  45.76 
 
 
254 aa  237  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1557  undecaprenyl diphosphate synthase  44.44 
 
 
254 aa  236  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2451  undecaprenyl diphosphate synthase  47.48 
 
 
260 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351956  hitchhiker  0.00162806 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1916  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.41 
 
 
250 aa  235  4e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000170757  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2471  undecaprenyl diphosphate synthase  47.18 
 
 
259 aa  235  4e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1551  undecaprenyl diphosphate synthase  46.84 
 
 
260 aa  235  6e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3259  undecaprenyl diphosphate synthase  46.84 
 
 
260 aa  235  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540086  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2052  undecaprenyl diphosphate synthase  46.84 
 
 
260 aa  235  6e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1324  undecaprenyl diphosphate synthase  46.84 
 
 
260 aa  235  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.134804  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  43.51 
 
 
253 aa  234  8e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  45.64 
 
 
262 aa  234  9e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3355  undecaprenyl diphosphate synthase  48.05 
 
 
253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0813466  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0326  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.34 
 
 
255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3429  undecaprenyl diphosphate synthase  47.62 
 
 
252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278251  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0178  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.62 
 
 
252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405538  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  44.26 
 
 
232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  48.05 
 
 
253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00394287  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1126  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.28 
 
 
243 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0176  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.62 
 
 
252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000145579  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45 
 
 
252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3160  undecaprenyl diphosphate synthase  47.14 
 
 
253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1686  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.06 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.184494 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0511  undecaprenyl diphosphate synthase  46.12 
 
 
257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0663424  normal  0.27617 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00172  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.62 
 
 
253 aa  233  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0442077  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0184  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.62 
 
 
253 aa  233  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0185  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.62 
 
 
253 aa  233  3e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0180399  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.34 
 
 
252 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.34 
 
 
252 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3486  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.62 
 
 
253 aa  233  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000338142  normal  0.111087 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00171  hypothetical protein  47.62 
 
 
253 aa  233  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0565957  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  46.93 
 
 
234 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.23 
 
 
249 aa  231  6e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0167  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.62 
 
 
252 aa  231  6e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00639838  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3157  di-trans, poly-cis-decaprenylcistransferase  44.49 
 
 
264 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0130117  normal  0.0586851 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1454  undecaprenyl diphosphate synthase  43.4 
 
 
275 aa  230  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000365113  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10910  undecaprenyl diphosphate synthase  43.7 
 
 
289 aa  231  1e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.183526  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1449  undecaprenyl diphosphate synthase  43.4 
 
 
275 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000030821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>