More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2190 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2190  periplasmic solute binding protein  100 
 
 
287 aa  578  1e-164  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  35.89 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  32.79 
 
 
316 aa  170  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  32.46 
 
 
316 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  32.46 
 
 
316 aa  169  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  32.46 
 
 
316 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  32.13 
 
 
316 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  32.46 
 
 
316 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  33.44 
 
 
314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  31.48 
 
 
316 aa  163  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  31.15 
 
 
316 aa  163  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  30.82 
 
 
317 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  30.82 
 
 
317 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  30.67 
 
 
307 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  33.22 
 
 
304 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  31.83 
 
 
317 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  34.05 
 
 
313 aa  159  5e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  30.82 
 
 
316 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  30.33 
 
 
314 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  31.7 
 
 
316 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2419  zinc ABC transporter substrate-binding protein  33.22 
 
 
280 aa  154  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0902077  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  32.35 
 
 
333 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  31.83 
 
 
304 aa  152  7e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.87 
 
 
514 aa  151  1e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  34.94 
 
 
298 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  31.1 
 
 
506 aa  150  3e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  34.94 
 
 
298 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  29.08 
 
 
309 aa  150  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  30.12 
 
 
332 aa  149  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1234  laminin-binding surface protein  32.37 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000444188  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  25.62 
 
 
328 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  29.32 
 
 
318 aa  145  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  33.08 
 
 
290 aa  143  3e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1681  periplasmic solute binding protein  32.49 
 
 
277 aa  143  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  31.96 
 
 
323 aa  140  3e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  31.47 
 
 
333 aa  140  3e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  32.58 
 
 
290 aa  139  7e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  31.62 
 
 
265 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  31.35 
 
 
307 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.33 
 
 
349 aa  138  1e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2081  adhesion lipoprotein, putative  29.69 
 
 
315 aa  137  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.24614  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  32.32 
 
 
290 aa  136  4e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  32.93 
 
 
301 aa  133  3e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  29.64 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  26.89 
 
 
321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2478  ribulose-phosphate 3-epimerase  30.16 
 
 
515 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00360703  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  28.48 
 
 
316 aa  130  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2430  ribulose-phosphate 3-epimerase  30.16 
 
 
515 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000562899  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1891  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  30.57 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  26.95 
 
 
311 aa  125  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  28.72 
 
 
318 aa  124  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  25.17 
 
 
311 aa  123  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  24.59 
 
 
311 aa  122  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  27.54 
 
 
296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  29 
 
 
310 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1793  putative carbon storage regulator-like protein  30.6 
 
 
302 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.265514  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0516  periplasmic solute binding protein  26.37 
 
 
365 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  29.43 
 
 
321 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  28.62 
 
 
310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3749  periplasmic solute binding protein  26.17 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287102  hitchhiker  0.00387824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  27.92 
 
 
315 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1674  adhesion protein, putative  27.41 
 
 
311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0484174  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  26.02 
 
 
292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  26.88 
 
 
326 aa  115  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0037  ABC transporter substrate-binding protein  28.96 
 
 
321 aa  116  6e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0205  periplasmic solute binding protein  28.03 
 
 
300 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767408  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  25.93 
 
 
312 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  26.38 
 
 
323 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0963  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 
320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.000541493  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0860  periplasmic solute binding protein  34.05 
 
 
298 aa  114  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00530614  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  29.69 
 
 
353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2383  ABC transporter, substrate-binding protein  38.01 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  26.58 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  26.58 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3805  periplasmic solute binding protein  30 
 
 
298 aa  113  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0163421  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1937  periplasmic solute binding protein  27.17 
 
 
311 aa  114  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  26.58 
 
 
311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  28.16 
 
 
304 aa  112  6e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  26.81 
 
 
311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3026  ABC-type transport system, periplasmic component  27.05 
 
 
302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.03 
 
 
320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  27.69 
 
 
331 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  29.12 
 
 
300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  29.36 
 
 
292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3402  periplasmic solute binding protein  28.14 
 
 
305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1015  periplasmic solute binding protein  28.89 
 
 
293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2600  periplasmic solute binding protein  28.39 
 
 
316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  26.67 
 
 
311 aa  109  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  23.61 
 
 
312 aa  109  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18691  ABC transporter substrate-binding protein  24.25 
 
 
287 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.349553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  27.41 
 
 
341 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  27.46 
 
 
313 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1533  periplasmic solute binding protein  23.59 
 
 
308 aa  106  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.411014  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  29.96 
 
 
296 aa  106  4e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  26.44 
 
 
291 aa  106  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2211  periplasmic solute binding protein  30.38 
 
 
304 aa  105  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00443052  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  26.67 
 
 
310 aa  105  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  26.8 
 
 
306 aa  105  9e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36810  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  25.37 
 
 
288 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00286711  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  27.97 
 
 
304 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>