More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0382 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
357 aa  745    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.85 
 
 
375 aa  520  1e-146  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.29 
 
 
374 aa  515  1.0000000000000001e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.28 
 
 
370 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.15 
 
 
369 aa  500  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.18 
 
 
372 aa  495  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.52 
 
 
373 aa  490  1e-137  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.8 
 
 
379 aa  483  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.8 
 
 
379 aa  483  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.75 
 
 
379 aa  480  1e-134  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.96 
 
 
373 aa  479  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.69 
 
 
370 aa  478  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.41 
 
 
380 aa  479  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.69 
 
 
380 aa  481  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.67 
 
 
379 aa  475  1e-133  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.18 
 
 
373 aa  476  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.92 
 
 
379 aa  473  1e-132  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.87 
 
 
379 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.78 
 
 
372 aa  465  9.999999999999999e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.15 
 
 
379 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.87 
 
 
379 aa  464  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.58 
 
 
379 aa  462  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.58 
 
 
379 aa  462  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.58 
 
 
379 aa  462  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.58 
 
 
379 aa  462  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.58 
 
 
379 aa  462  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.87 
 
 
379 aa  464  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.58 
 
 
379 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.71 
 
 
369 aa  462  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.58 
 
 
379 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.32 
 
 
394 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.33 
 
 
372 aa  451  1e-125  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.34 
 
 
392 aa  446  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.03 
 
 
368 aa  434  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000643926  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.87 
 
 
370 aa  436  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.46 
 
 
368 aa  433  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.65 
 
 
380 aa  432  1e-120  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.21 
 
 
380 aa  432  1e-120  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.18 
 
 
388 aa  428  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.69 
 
 
372 aa  428  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.69 
 
 
372 aa  427  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.02 
 
 
373 aa  424  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.87 
 
 
371 aa  427  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.53 
 
 
367 aa  427  1e-118  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.46 
 
 
382 aa  425  1e-118  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0919  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.1 
 
 
381 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.62 
 
 
368 aa  422  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0455  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.93 
 
 
384 aa  423  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0710  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.11 
 
 
376 aa  418  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2017  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.49 
 
 
380 aa  419  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000528319  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3335  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.94 
 
 
368 aa  418  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00131766  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3755  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.96 
 
 
387 aa  416  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.145582 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0911  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.66 
 
 
368 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8642e-32 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.27 
 
 
369 aa  414  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114064  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.27 
 
 
355 aa  411  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.38 
 
 
384 aa  414  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.06 
 
 
375 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.97 
 
 
370 aa  410  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0218  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.66 
 
 
376 aa  409  1e-113  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.989201  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0376  queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
406 aa  409  1e-113  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0401753  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4079  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.06 
 
 
376 aa  409  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.137728 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2795  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.06 
 
 
366 aa  404  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1430  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.06 
 
 
376 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143529  normal  0.876583 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0045  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.06 
 
 
376 aa  405  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.642849  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1275  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.62 
 
 
336 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.08 
 
 
365 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1197  queuine tRNA-ribosyltransferase (tRNA-guanine transglycosylase)  55.36 
 
 
376 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.196997  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3305  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.06 
 
 
366 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.423867 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.06 
 
 
380 aa  402  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0270  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.75 
 
 
379 aa  402  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147453  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1703  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.67 
 
 
383 aa  404  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108277  normal  0.62465 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004367  tRNA-guanine transglycosylase  53.91 
 
 
382 aa  401  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.78 
 
 
381 aa  402  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3291  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.49 
 
 
381 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1524  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.39 
 
 
383 aa  401  9.999999999999999e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000558338  normal  0.0203734 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1927  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.14 
 
 
383 aa  401  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000713351  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6918  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.37 
 
 
376 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.625358  normal  0.464203 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.33 
 
 
371 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0901  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.97 
 
 
373 aa  401  9.999999999999999e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000294135  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.26 
 
 
374 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.49 
 
 
373 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370638  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.26 
 
 
394 aa  401  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1321  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.76 
 
 
391 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0500  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.62 
 
 
376 aa  397  1e-109  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.260336 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2647  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.52 
 
 
381 aa  395  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000956702  hitchhiker  0.00180241 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00865  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.93 
 
 
376 aa  395  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1347  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.69 
 
 
372 aa  396  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0144  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.1 
 
 
384 aa  395  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0518824  decreased coverage  0.000581764 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2456  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.82 
 
 
367 aa  396  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.359127  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0820  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.3 
 
 
387 aa  394  1e-109  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.49 
 
 
387 aa  397  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0565  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.67 
 
 
373 aa  396  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.005662  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.16 
 
 
395 aa  395  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3203  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.21 
 
 
375 aa  392  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.372376  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3359  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.62 
 
 
377 aa  391  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.142206  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0476  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.21 
 
 
375 aa  392  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01046  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.35 
 
 
378 aa  394  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0325  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.21 
 
 
375 aa  392  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2542  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.83 
 
 
387 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.213207  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0875  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.49 
 
 
375 aa  392  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.68635  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>