More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0027 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0027  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 
412 aa  824  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0347  transcriptional regulator, AraC family  27.43 
 
 
405 aa  147  4e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1886  transcriptional regulator, AraC family  36.27 
 
 
289 aa  69.3  1e-10  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3182  AraC family transcriptional regulator  27 
 
 
315 aa  68.6  2e-10  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000265571 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3712  AraC family transcriptional regulator  34.44 
 
 
337 aa  67  6e-10  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.660721  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2123  AraC family transcriptional regulator  26.79 
 
 
287 aa  66.6  8e-10  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.184363  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5590  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 
310 aa  65.9  1e-09  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4301  transcriptional regulator, AraC family  29.52 
 
 
286 aa  65.5  2e-09  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220521  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3546  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 
319 aa  64.3  4e-09  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.776433  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4821  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 
319 aa  64.3  4e-09  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535496  normal  0.116549 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5462  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 
319 aa  64.3  4e-09  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2339  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 
303 aa  64.3  4e-09  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.295664 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4725  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 
319 aa  63.9  5e-09  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.70917  normal  0.0655004 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6144  transcriptional regulator, AraC family  26.01 
 
 
301 aa  63.2  7e-09  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2642  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 
304 aa  63.5  7e-09  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  30.11 
 
 
301 aa  62.4  1e-08  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0883  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 
322 aa  62.4  1e-08  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4283  transcriptional regulator, AraC family  30.05 
 
 
290 aa  62.8  1e-08  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.294163  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1597  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 
310 aa  62.4  1e-08  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  28 
 
 
299 aa  61.6  2e-08  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4202  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 
319 aa  62  2e-08  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1891  transcriptional regulator, AraC family  33.04 
 
 
291 aa  62  2e-08  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1432  AraC family transcriptional regulator  29.3 
 
 
686 aa  61.2  3e-08  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00438113  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1116  transcriptional regulator, AraC family  34.12 
 
 
325 aa  60.8  4e-08  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1698  AraC family transcriptional regulator  29.3 
 
 
686 aa  61.2  4e-08  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000348751  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2441  helix-turn-helix, AraC type  29.03 
 
 
307 aa  60.5  5e-08  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0002572  decreased coverage  0.000290212 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3782  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 
319 aa  60.5  5e-08  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0502919 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2310  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.18 
 
 
299 aa  60.5  6e-08  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120361  normal  0.040249 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  31.07 
 
 
513 aa  60.5  6e-08  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 
301 aa  60.5  6e-08  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2607  AraC family transcriptional regulator  23 
 
 
303 aa  60.1  7e-08  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3306  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 
275 aa  60.1  8e-08  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4681  transcriptional regulator, AraC family  24.83 
 
 
277 aa  59.7  9e-08  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399866  hitchhiker  0.000374446 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  26 
 
 
332 aa  59.7  9e-08  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0133  AraC family transcriptional regulator  26.02 
 
 
315 aa  59.7  1e-07  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13686 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3214  AraC family transcriptional regulator  32.94 
 
 
360 aa  58.9  1e-07  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3030  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 
275 aa  59.3  1e-07  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2471  transcriptional regulator, AraC family  21.11 
 
 
311 aa  59.3  1e-07  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  5.18709e-05  normal  0.0153728 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1548  transcriptional regulator, AraC family  31.96 
 
 
276 aa  58.9  1e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2344  AraC family DNA-binding response regulator  32.2 
 
 
507 aa  59.3  1e-07  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.627636  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0732  AraC-like transcriptional regulator  30.58 
 
 
292 aa  58.9  1e-07  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  5.98686e-09  normal  0.0654387 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3502  AraC family transcriptional regulator  32.94 
 
 
355 aa  59.3  1e-07  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5153  AraC family transcriptional regulator  32.94 
 
 
360 aa  58.9  1e-07  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3328  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 
275 aa  59.3  1e-07  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3298  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 
275 aa  58.9  1e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3086  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 
275 aa  59.3  1e-07  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  2.57264e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  25.64 
 
 
306 aa  59.7  1e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4832  transcriptional regulator  32.26 
 
 
393 aa  58.9  2e-07  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.304205  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0314  two component transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 
494 aa  58.9  2e-07  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  31.73 
 
 
530 aa  58.9  2e-07  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5126  AraC family transcriptional regulator  32.94 
 
 
357 aa  58.9  2e-07  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3165  helix-turn-helix domain-containing protein  28.85 
 
 
308 aa  58.9  2e-07  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00840402  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2976  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 
275 aa  58.2  3e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00165868  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2056  AraC family DNA-binding response regulator  32.2 
 
 
507 aa  58.2  3e-07  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4548  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
357 aa  57.8  3e-07  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1575  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 
339 aa  58.2  3e-07  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1770  transcriptional regulator, AraC family  30.1 
 
 
320 aa  58.2  3e-07  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3861  two component AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
259 aa  58.2  3e-07  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  29.91 
 
 
515 aa  58.2  3e-07  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  25.24 
 
 
301 aa  57.8  3e-07  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5071  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
357 aa  57.8  3e-07  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1284  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 
150 aa  57.4  4e-07  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113344 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3335  AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 
361 aa  57.4  4e-07  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.519645 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3483  transcriptional regulator, AraC family  20.69 
 
 
296 aa  57  5e-07  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3850  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.2 
 
 
275 aa  57  5e-07  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.427371  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  25.22 
 
 
299 aa  57.4  5e-07  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1956  transcriptional regulator  32.94 
 
 
396 aa  57  6e-07  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976768  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2203  transcriptional regulator, AraC family  37.08 
 
 
285 aa  57  6e-07  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0328064 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0187  cupin 2 domain-containing protein  23.05 
 
 
277 aa  57  6e-07  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.778643  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1864  AraC family transcriptional regulator  32.94 
 
 
410 aa  57  6e-07  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0353  MSM (multiple sugar metabolism) operon regulatory protein  27.27 
 
 
301 aa  57  6e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  25.26 
 
 
517 aa  56.6  7e-07  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  6.11836e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0397  AraC/XylS family transcription factor  32.94 
 
 
396 aa  57  7e-07  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2057  AraC family transcriptional regulator  30.1 
 
 
293 aa  57  7e-07  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227096  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4426  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 
290 aa  57  7e-07  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.378526 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  30.3 
 
 
291 aa  56.6  8e-07  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02019  transcription regulator protein  30.77 
 
 
387 aa  56.6  8e-07  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2436  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
329 aa  56.6  9e-07  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3596  transcriptional regulator, AraC family  29.93 
 
 
301 aa  56.2  1e-06  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  9.94716e-07  hitchhiker  6.11237e-05 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4384  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
312 aa  55.8  1e-06  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.7748  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3808  AraC family transcriptional regulator  28.28 
 
 
321 aa  55.8  1e-06  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.323672  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3988  transcriptional regulator, AraC family  26.12 
 
 
291 aa  56.2  1e-06  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00119398  normal  0.630817 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  23.08 
 
 
301 aa  55.8  1e-06  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1984  transcriptional regulator, AraC family  33.66 
 
 
275 aa  56.2  1e-06  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.626531  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  33.66 
 
 
544 aa  55.8  1e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  23 
 
 
287 aa  55.8  1e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3070  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
311 aa  55.8  1e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0301  transcriptional regulator, AraC family  28.21 
 
 
304 aa  55.8  1e-06  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1219  transcriptional regulator  24.75 
 
 
329 aa  55.8  1e-06  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5065  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
312 aa  56.2  1e-06  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289747  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0484  transcriptional regulator  31.76 
 
 
356 aa  55.8  1e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2157  two component AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 
250 aa  55.8  1e-06  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0322408 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0251  AraC family transcriptional regulator  29.03 
 
 
309 aa  56.2  1e-06  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1480  transcriptional regulator, AraC family  25.93 
 
 
288 aa  56.2  1e-06  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0895908  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0879  AraC/XylS family transcriptional regulator  29.2 
 
 
299 aa  55.8  1e-06  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  3.1891e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1098  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  29.41 
 
 
360 aa  56.2  1e-06  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5795  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
312 aa  56.2  1e-06  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112606  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1715  AraC family transcriptional regulator  27.43 
 
 
146 aa  55.5  2e-06  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1736  AraC family transcriptional regulator  27.43 
 
 
146 aa  55.5  2e-06  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228742  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1783  AraC family transcriptional regulator  27.43 
 
 
146 aa  55.5  2e-06  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.244044  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>