More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1268 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1268  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 288 aa  602  1.0000000000000001e-171  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0462  metallo-beta-lactamase family protein  38.19 
 
 		 269 aa  188  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000870775  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15960  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  37.59 
 
 		 269 aa  186  5e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.612617  hitchhiker  0.00000215477 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3910  aldehyde dehydrogenase  30.3 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.259628 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  28.86 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1577  hypothetical protein  29.57 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  28.07 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  28.03 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  25.15 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4144  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.98 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  29.56 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1393  beta-lactamase domain-containing protein  31.39 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3347  twin-arginine translocation pathway signal  26.81 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  28.07 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1257  hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  30.29 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  26.88 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2651  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.66 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0421465 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3716  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.51 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0174  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.48 
 
 		 398 aa  58.9  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1258  hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  30.29 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  27.33 
 
 		 215 aa  58.9  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0172  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.48 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1721  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.52 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2440  hydrolase, putative  26.28 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0911202  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2241  hydrolase  27.39 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2175  metal-dependent hydrolase  27.39 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000879537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2161  metal-dependent hydrolase  27.39 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57885  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2405  hydrolase  27.39 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.903974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4572  Beta-lactamase  32.64 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  26.61 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2422  putative hydrolase  27.39 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  27.49 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1796  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1530  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.788095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  26.99 
 
 		 332 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0909  hydroxyacylglutathione hydrolase  42 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.830211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0591  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.21 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  24.84 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  23.93 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  28.65 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3469  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.97 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  27.83 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0035  beta-lactamase domain protein  31.25 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03213  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.26 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  27.36 
 
 		 318 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  26.92 
 
 		 213 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0118  beta-lactamase-like protein  29.8 
 
 		 339 aa  55.5  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  24.74 
 
 		 207 aa  55.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0343  metallo-beta-lactamase family protein  29.22 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  28.28 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0851  beta-lactamase domain protein  26.29 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1402  glyoxalase II  27.63 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.701553  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 		 205 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2530  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.95 
 
 		 257 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.785477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  28.85 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0521  beta-lactamase domain protein  24.84 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000535463  hitchhiker  0.000000708931 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2116  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.95 
 
 		 257 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  29.63 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2505  putative hydrolase  26.75 
 
 		 217 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  25.16 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2720  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.74 
 
 		 299 aa  54.3  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29620  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.46 
 
 		 258 aa  53.9  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2338  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.27 
 
 		 259 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2960  putative hydrolase  24.18 
 
 		 217 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047526 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  24.75 
 
 		 363 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  25.15 
 
 		 330 aa  53.9  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1067  hypothetical protein  25.91 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.21331  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  26.16 
 
 		 213 aa  53.9  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3222  beta-lactamase domain protein  32.12 
 
 		 266 aa  53.5  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal  0.400192 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  26.04 
 
 		 215 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1678  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.04 
 
 		 256 aa  53.5  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3735  beta-lactamase domain protein  24.17 
 
 		 246 aa  53.5  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.555348  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  27.07 
 
 		 209 aa  53.1  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  27.49 
 
 		 332 aa  53.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4316  beta-lactamase domain protein  34.83 
 
 		 397 aa  53.1  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.558515  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  28.93 
 
 		 210 aa  53.1  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  32.79 
 
 		 210 aa  52.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.16 
 
 		 215 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.16 
 
 		 215 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.16 
 
 		 215 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2207  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.65 
 
 		 259 aa  53.1  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.181464  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.16 
 
 		 215 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.16 
 
 		 215 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1662  beta-lactamase domain protein  26.32 
 
 		 212 aa  52.8  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2529  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.75 
 
 		 259 aa  52.8  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366844  normal  0.610569 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  26.04 
 
 		 215 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  26.04 
 
 		 215 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  26.04 
 
 		 215 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  26.04 
 
 		 215 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  26.04 
 
 		 215 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  26.04 
 
 		 215 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  24.57 
 
 		 212 aa  52.4  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1989  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.78 
 
 		 272 aa  52.4  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000136825  hitchhiker  0.000132084 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1776  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.65 
 
 		 267 aa  52.4  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000249519  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.19 
 
 		 222 aa  52.4  0.000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3483  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.26 
 
 		 258 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0934  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.36 
 
 		 259 aa  52.4  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.421322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0215  beta-lactamase domain protein  27.75 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  25.52 
 
 		 215 aa  52  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00097  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  28.32 
 
 		 287 aa  52  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>