290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1122 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1122  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 313 aa  622  1e-177  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.47 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27080  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  35.46 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1712  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.1 
 
 		 290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1007  hypothetical protein  32.87 
 
 		 335 aa  160  3e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24860  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  34.14 
 
 		 290 aa  159  5e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.72 
 
 		 293 aa  145  8.000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0322  putative permease of the drug/metabolite transporter  30.6 
 
 		 311 aa  142  9e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.806921  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.1 
 
 		 300 aa  132  5e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1883  hypothetical protein  32.99 
 
 		 310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00906285  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2231  hypothetical protein  27.22 
 
 		 358 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3509  hypothetical protein  26.9 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160994 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0417  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.87 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2471  hypothetical protein  31.8 
 
 		 360 aa  124  3e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0181629  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.17 
 
 		 301 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.27 
 
 		 318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1854  hypothetical protein  25.63 
 
 		 316 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135486 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3442  hypothetical protein  25.63 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  0.320096 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  26.79 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  28.77 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1518  hypothetical protein  28.32 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.372898 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3309  hypothetical protein  27.59 
 
 		 316 aa  102  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3187  hypothetical protein  26.22 
 
 		 300 aa  102  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589109 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.19 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.71 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  30.69 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 		 318 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  25.72 
 
 		 294 aa  98.6  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2982  DMT family permease  29.02 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  26.85 
 
 		 303 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  26.85 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  26.76 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  26.85 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  26.85 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  28.73 
 
 		 319 aa  97.1  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  26.85 
 
 		 303 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  26.85 
 
 		 303 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 		 308 aa  97.1  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1325  integral membrane protein  25.88 
 
 		 308 aa  97.4  3e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1817  hypothetical protein  24.21 
 
 		 305 aa  96.7  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.000661803 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.43 
 
 		 312 aa  96.3  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  25.84 
 
 		 301 aa  95.9  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  26.19 
 
 		 303 aa  95.5  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1360  hypothetical protein  30.07 
 
 		 296 aa  94.7  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.170247  hitchhiker  0.00808749 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  26.6 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1481  hypothetical protein  27.91 
 
 		 294 aa  93.6  4e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000470662  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5197  hypothetical protein  25.61 
 
 		 288 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5662  hypothetical protein  25.61 
 
 		 288 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3470  hypothetical protein  24.11 
 
 		 312 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461647  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.95 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97109  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0457  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.92 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  26.67 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  28.92 
 
 		 288 aa  92.4  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3251  hypothetical protein  22.57 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.18 
 
 		 283 aa  91.3  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.26 
 
 		 294 aa  90.9  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1696  hypothetical protein  28.17 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.591039 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 		 343 aa  89.7  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0893718  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.29 
 
 		 289 aa  90.1  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  27.66 
 
 		 299 aa  89.7  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  26.69 
 
 		 317 aa  89.7  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  25.26 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.99 
 
 		 302 aa  89  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0940  integral membrane protein  27.21 
 
 		 314 aa  88.6  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.26 
 
 		 289 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1621  hypothetical protein  25.38 
 
 		 289 aa  88.2  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  29.89 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1406  hypothetical protein  29.41 
 
 		 312 aa  86.3  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0365604  normal  0.0466705 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1031  hypothetical protein  26.69 
 
 		 307 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0145  hypothetical protein  25 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1424  transporter, drug/metabolite exporter family  28.52 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.43 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0994  hypothetical protein  26.16 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3634  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.16 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  27.15 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3301  hypothetical protein  27.44 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00885964  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2977  hypothetical protein  27.85 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1322  hypothetical protein  28.98 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  24.72 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1480  permeases of the drug/metabolite transporter  26.86 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000101724  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3621  hypothetical protein  28.72 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0545  hypothetical protein  27.11 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  25.99 
 
 		 322 aa  81.3  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19920  predicted permease, DMT superfamily  25.55 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.185467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0163  hypothetical protein  25.45 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.532161  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3336  hypothetical protein  26.94 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.547457  normal  0.396992 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0849  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.05 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266368  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1421  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.16 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  25.99 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.99 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  25.99 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2881  hypothetical protein  24.57 
 
 		 336 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0923868  hitchhiker  0.00000000000229015 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0643  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.08 
 
 		 297 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0274  threonine/homoserine efflux transporter  26.98 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00467202  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3027  DMT family permease  28.52 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.52 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  26.79 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7072  hypothetical protein  25.5 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3091  hypothetical protein  24.73 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  26.43 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>