More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_2157 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_2157  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 
193 aa  401  1e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00451511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0485  NADH dehydrogenase subunit B  61.85 
 
 
171 aa  235  3e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.130232 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2153  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  64.52 
 
 
194 aa  220  9e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  52.98 
 
 
184 aa  206  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0158  NADH-quinone oxidoreductase chain b  57.62 
 
 
168 aa  204  6e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.71 
 
 
202 aa  204  9e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  54.14 
 
 
268 aa  199  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  51.74 
 
 
174 aa  198  3.9999999999999996e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  53.59 
 
 
268 aa  197  5e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  57.62 
 
 
182 aa  197  7.999999999999999e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3857  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.78 
 
 
230 aa  196  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  52.57 
 
 
264 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2252  NADH dehydrogenase subunit B  55.78 
 
 
213 aa  195  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  51.14 
 
 
264 aa  195  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4981  NADH dehydrogenase subunit B  53.59 
 
 
250 aa  195  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000483357  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  51.72 
 
 
794 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  54.39 
 
 
179 aa  194  5.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07390  NADH dehydrogenase subunit B  56.76 
 
 
183 aa  194  8.000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  55.48 
 
 
793 aa  194  9e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0282  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  55.92 
 
 
183 aa  193  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.7 
 
 
179 aa  193  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  56 
 
 
179 aa  194  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.08 
 
 
226 aa  193  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  55.41 
 
 
271 aa  192  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  57.05 
 
 
794 aa  192  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  51.15 
 
 
794 aa  191  5e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  56.08 
 
 
182 aa  191  8e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0470  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.24 
 
 
183 aa  190  9e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677887  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0364  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.87 
 
 
180 aa  190  1e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3228  NADH dehydrogenase subunit B  54.97 
 
 
184 aa  190  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  55.63 
 
 
792 aa  189  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  57.05 
 
 
791 aa  189  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  54.73 
 
 
216 aa  189  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  59.48 
 
 
173 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1657  NADH dehydrogenase subunit B  55.13 
 
 
170 aa  188  4e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.659675  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1323  NADH dehydrogenase subunit B  53.33 
 
 
167 aa  188  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0910  NADH dehydrogenase subunit B  60.43 
 
 
178 aa  188  4e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.617047 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.86 
 
 
169 aa  187  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2715  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.73 
 
 
183 aa  188  5e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.24 
 
 
170 aa  188  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0747  NADH dehydrogenase subunit B  51.15 
 
 
177 aa  188  5e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000169053  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_795  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.72 
 
 
200 aa  187  5.999999999999999e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3169  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.41 
 
 
184 aa  187  7e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242992  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1381  NADH dehydrogenase subunit B  54.73 
 
 
181 aa  187  7e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.186905  normal  0.991286 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4482  NADH dehydrogenase subunit B  52.1 
 
 
184 aa  187  7e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00198426 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  57.43 
 
 
170 aa  187  8e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0540  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56 
 
 
183 aa  187  8e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.687461  normal  0.404608 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.55 
 
 
170 aa  187  8e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1884  NADH dehydrogenase subunit B  52.1 
 
 
184 aa  187  9e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0924  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  49.2 
 
 
200 aa  187  1e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0400  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.03 
 
 
184 aa  186  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0975  NADH dehydrogenase subunit B  48.37 
 
 
199 aa  186  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13167  NADH dehydrogenase subunit B  53.69 
 
 
184 aa  186  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1633  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.84 
 
 
251 aa  186  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514076  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.24 
 
 
170 aa  186  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0139  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.67 
 
 
169 aa  186  2e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3677  NADH dehydrogenase subunit B  52.67 
 
 
167 aa  186  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0978  NADH dehydrogenase subunit B  58.78 
 
 
166 aa  185  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1358  NADH dehydrogenase subunit B  55.56 
 
 
213 aa  184  5e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4064  NADH dehydrogenase subunit B  50.3 
 
 
226 aa  185  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1528  NADH dehydrogenase subunit B  56.46 
 
 
170 aa  184  6e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.152485  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2388  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.87 
 
 
225 aa  184  6e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0808  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.64 
 
 
200 aa  184  7e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4462  NADH dehydrogenase subunit B  50.3 
 
 
226 aa  184  7e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7690  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.67 
 
 
184 aa  184  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1245  NADH dehydrogenase subunit B  52.7 
 
 
182 aa  184  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  56.08 
 
 
170 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  60.42 
 
 
172 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1549  NADH dehydrogenase subunit B  49.7 
 
 
184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0528108  normal  0.21195 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5054  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.63 
 
 
181 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1579  NADH dehydrogenase subunit B  49.7 
 
 
184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0585  NADH dehydrogenase (quinone)  51.33 
 
 
183 aa  182  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5099  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.83 
 
 
181 aa  183  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  59.72 
 
 
179 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  59.72 
 
 
179 aa  182  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  59.72 
 
 
179 aa  182  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  59.72 
 
 
172 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  58.55 
 
 
172 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  59.72 
 
 
172 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  59.72 
 
 
172 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1126  NADH dehydrogenase subunit B  50.65 
 
 
212 aa  181  4.0000000000000006e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  59.72 
 
 
172 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  59.72 
 
 
172 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1828  NADH dehydrogenase subunit B  53.33 
 
 
169 aa  181  4.0000000000000006e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.124676  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  59.72 
 
 
172 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2694  NADH dehydrogenase subunit B  52.67 
 
 
185 aa  181  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0521  NADH dehydrogenase subunit B  54.93 
 
 
184 aa  181  5.0000000000000004e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7018  NADH dehydrogenase subunit B  50.96 
 
 
187 aa  181  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4417  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.67 
 
 
183 aa  181  7e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1698  NADH dehydrogenase subunit B  56.83 
 
 
222 aa  181  7e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0268752  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1444  NADH dehydrogenase subunit B  54.11 
 
 
165 aa  181  9.000000000000001e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0432732  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02212  NADH dehydrogenase subunit B  52.26 
 
 
220 aa  180  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1370  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.26 
 
 
220 aa  180  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00721379  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2436  NADH dehydrogenase subunit B  52.26 
 
 
220 aa  180  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2441  NADH dehydrogenase subunit B  52.26 
 
 
220 aa  180  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.675859  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2663  NADH dehydrogenase subunit B  52.26 
 
 
220 aa  180  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102783  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2580  NADH dehydrogenase subunit B  52.26 
 
 
220 aa  180  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0400998  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3426  NADH dehydrogenase subunit B  52.26 
 
 
220 aa  180  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101338  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02172  hypothetical protein  52.26 
 
 
220 aa  180  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1365  NADH dehydrogenase subunit B  52.26 
 
 
220 aa  180  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.806532  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>