More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2803 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2803  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
387 aa  751    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129737  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  44.17 
 
 
403 aa  268  8.999999999999999e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4408  glycosyl transferase group 1  47.2 
 
 
393 aa  260  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406195  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1891  glycosyl transferase group 1  45.43 
 
 
382 aa  226  7e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  39.75 
 
 
406 aa  219  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  39.53 
 
 
402 aa  218  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1278  glycosyl transferase, group 1  42.32 
 
 
408 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.352326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1295  glycosyl transferase, group 1  42.32 
 
 
408 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675113  normal  0.124079 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  38.27 
 
 
392 aa  209  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  40.36 
 
 
407 aa  208  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  41.16 
 
 
406 aa  207  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0295  hypothetical protein  38.1 
 
 
413 aa  207  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1307  glycosyl transferase, group 1  41.81 
 
 
408 aa  206  7e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
422 aa  204  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  41.6 
 
 
405 aa  202  5e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  41.69 
 
 
415 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1513  group 1 glycosyl transferase  38.33 
 
 
349 aa  196  7e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.42388  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  38.69 
 
 
397 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4103  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 
400 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.355354 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3722  glycosyl transferase, group 1  34.5 
 
 
400 aa  184  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  37.25 
 
 
420 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0459  glycosyl transferase group 1  39.36 
 
 
418 aa  177  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.391248  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1891  glycosyl transferase group 1  37.64 
 
 
415 aa  168  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120755  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5208  glycosyl transferase group 1  33.25 
 
 
425 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.330402  normal  0.673241 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  31.46 
 
 
421 aa  129  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3449  glycosyl transferase, group 1  33.52 
 
 
409 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.455826  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3205  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 
381 aa  126  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 
440 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
453 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.73 
 
 
443 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.73 
 
 
443 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.73 
 
 
495 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.73 
 
 
499 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 
672 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.48 
 
 
443 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.48 
 
 
443 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  27.9 
 
 
423 aa  116  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.48 
 
 
498 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 
437 aa  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 
437 aa  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 
438 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  25.68 
 
 
423 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  31.93 
 
 
421 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 
419 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 
438 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 
438 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 
435 aa  109  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  28.98 
 
 
439 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  28.98 
 
 
439 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  30.4 
 
 
650 aa  108  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 
434 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  30.47 
 
 
401 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 
410 aa  107  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 
405 aa  107  5e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  27.79 
 
 
439 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0358  glycosyl transferase group 1  32.15 
 
 
405 aa  106  7e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  32.28 
 
 
417 aa  105  9e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  26.78 
 
 
405 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  31.85 
 
 
477 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  31.51 
 
 
412 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  31.51 
 
 
412 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  29.72 
 
 
414 aa  105  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  31.51 
 
 
412 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.78 
 
 
405 aa  103  4e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0890  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
435 aa  103  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  decreased coverage  0.000533539 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
426 aa  103  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  29.79 
 
 
420 aa  103  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 
425 aa  103  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  34.13 
 
 
410 aa  103  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  26.47 
 
 
425 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  30.72 
 
 
435 aa  102  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 
434 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 
482 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  33.1 
 
 
362 aa  99.8  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  38.68 
 
 
411 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 
424 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  27.59 
 
 
442 aa  98.6  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  32.73 
 
 
360 aa  97.8  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  29.36 
 
 
424 aa  97.8  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  24.57 
 
 
391 aa  97.4  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4001  glycogen synthase  31.19 
 
 
382 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4075  glycogen synthase  31.19 
 
 
382 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 
387 aa  96.7  7e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  27.24 
 
 
388 aa  96.7  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 
536 aa  96.7  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  30.39 
 
 
367 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  30.24 
 
 
415 aa  95.5  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  28.43 
 
 
427 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 
904 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  33.72 
 
 
417 aa  95.1  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  30.57 
 
 
935 aa  95.5  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  35.89 
 
 
370 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11840  glycosyltransferase  29.38 
 
 
411 aa  94  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363429  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 
448 aa  94  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  27.76 
 
 
434 aa  94  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
395 aa  93.6  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  40.22 
 
 
376 aa  93.6  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  32.37 
 
 
382 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3641  hypothetical protein  25.26 
 
 
384 aa  93.6  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.802577  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>