More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0259 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 308 aa  600  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  64.38 
 
 		 313 aa  389  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  55.12 
 
 		 349 aa  316  3e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  54.82 
 
 		 304 aa  314  9.999999999999999e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  54.79 
 
 		 307 aa  306  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  56.94 
 
 		 301 aa  306  3e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  51.63 
 
 		 311 aa  306  4.0000000000000004e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  54.33 
 
 		 308 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  54.13 
 
 		 308 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3926  alpha/beta hydrolase fold protein  50.16 
 
 		 322 aa  303  2.0000000000000002e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.838043  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13701  epoxide hydrolase ephE  49.07 
 
 		 327 aa  291  1e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0688152 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4812  alpha/beta hydrolase fold  51.27 
 
 		 317 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.744056  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4898  alpha/beta hydrolase fold  51.27 
 
 		 317 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.451029  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5199  alpha/beta hydrolase fold  51.27 
 
 		 317 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0800557  hitchhiker  0.000578485 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5429  alpha/beta hydrolase fold  50.47 
 
 		 319 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80867 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  50.98 
 
 		 308 aa  287  2e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1377  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 		 319 aa  286  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.2117  normal  0.107315 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  49.5 
 
 		 311 aa  278  1e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  52.15 
 
 		 494 aa  272  4.0000000000000004e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  52.61 
 
 		 310 aa  271  9e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  49.83 
 
 		 307 aa  268  8e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4437  alpha/beta hydrolase fold  51.21 
 
 		 310 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.684387  hitchhiker  0.00120619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  45.99 
 
 		 299 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0418  alpha/beta hydrolase fold  51.95 
 
 		 305 aa  249  3e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0502159  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  44.41 
 
 		 298 aa  215  9e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.681258  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3092  alpha/beta hydrolase fold protein  45.83 
 
 		 309 aa  208  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0723  alpha/beta hydrolase fold protein  44.74 
 
 		 270 aa  206  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3036  alpha/beta hydrolase fold protein  43.14 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  45.57 
 
 		 308 aa  179  5.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0438  alpha/beta hydrolase fold protein  36.07 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.207857 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  41.2 
 
 		 301 aa  165  6.9999999999999995e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  35.93 
 
 		 287 aa  165  8e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  33.79 
 
 		 291 aa  159  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  35.62 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  30.9 
 
 		 289 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  30.56 
 
 		 289 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  32.43 
 
 		 284 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  35.59 
 
 		 303 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  32.19 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  37.7 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  39.46 
 
 		 270 aa  143  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 		 288 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  38.67 
 
 		 308 aa  139  3.9999999999999997e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 		 287 aa  138  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 		 317 aa  136  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  33.76 
 
 		 304 aa  135  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  33.99 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  36.65 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  32.99 
 
 		 283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  32.32 
 
 		 305 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  40.62 
 
 		 294 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  37.11 
 
 		 293 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  29.69 
 
 		 290 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 		 300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  40.62 
 
 		 307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  37.88 
 
 		 291 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  59.17 
 
 		 350 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  38.61 
 
 		 288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  38.22 
 
 		 288 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  35.26 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  32.99 
 
 		 287 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  33.74 
 
 		 323 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  36.39 
 
 		 291 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  36.05 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  36.05 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  35.23 
 
 		 289 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.68 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  35.25 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  51.22 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  32.11 
 
 		 297 aa  122  9e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  30.41 
 
 		 315 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 		 315 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  36.52 
 
 		 300 aa  119  7e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 		 351 aa  119  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  30.32 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  47.17 
 
 		 324 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  35.34 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 		 291 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  31.36 
 
 		 292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  33.68 
 
 		 291 aa  115  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 323 aa  115  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  31.76 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  32.55 
 
 		 288 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 		 306 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 		 306 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  35.91 
 
 		 274 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  30.03 
 
 		 323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  35.37 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  32.25 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1381  alpha/beta hydrolase fold protein  37.6 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  34.47 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  28.53 
 
 		 334 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  46.83 
 
 		 356 aa  106  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  30.95 
 
 		 300 aa  106  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 		 288 aa  105  7e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1416  Alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75275  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  31.87 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>