More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1652 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  100 
 
 
352 aa  719    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  99.15 
 
 
352 aa  711    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3000  ferrochelatase  76.99 
 
 
354 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2562  ferrochelatase  69.94 
 
 
365 aa  470  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.132687 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2495  ferrochelatase  69.23 
 
 
363 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  66.96 
 
 
367 aa  464  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  66.67 
 
 
367 aa  455  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1545  ferrochelatase  65.63 
 
 
369 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1574  ferrochelatase  68.39 
 
 
398 aa  439  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102455 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2425  ferrochelatase  67.27 
 
 
354 aa  428  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  63.98 
 
 
368 aa  424  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0929  ferrochelatase  57.49 
 
 
367 aa  400  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0179  ferrochelatase  57.41 
 
 
337 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0358  Ferrochelatase  57.41 
 
 
337 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.22206  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1723  ferrochelatase  58.64 
 
 
365 aa  373  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  53.23 
 
 
327 aa  367  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0733  ferrochelatase  56.63 
 
 
356 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  54.27 
 
 
355 aa  367  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1037  ferrochelatase  55.59 
 
 
371 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2033  ferrochelatase  60.06 
 
 
367 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.814285 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3965  ferrochelatase  56.63 
 
 
356 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0641641 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  52.92 
 
 
337 aa  365  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  52.62 
 
 
327 aa  364  1e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2502  ferrochelatase  56.85 
 
 
356 aa  363  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20421  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  52.62 
 
 
327 aa  362  4e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0772  ferrochelatase  54.91 
 
 
344 aa  362  6e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000682617 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3036  ferrochelatase  52.32 
 
 
337 aa  361  1e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000027258  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1342  Ferrochelatase  52.32 
 
 
337 aa  361  1e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0425559  hitchhiker  0.000000000751933 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3021  ferrochelatase  52.32 
 
 
337 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00598338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3179  ferrochelatase  52.32 
 
 
337 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00714455  normal  0.0188906 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  53.09 
 
 
337 aa  360  2e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  52 
 
 
327 aa  360  2e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1001  ferrochelatase  54.68 
 
 
371 aa  359  3e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.535203 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1771  ferrochelatase  56.23 
 
 
364 aa  359  4e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2424  ferrochelatase  55.96 
 
 
370 aa  358  7e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.695246  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2678  ferrochelatase  52.4 
 
 
338 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0698939  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2471  ferrochelatase  54.65 
 
 
371 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00654  ferrochelatase  51.99 
 
 
359 aa  354  1e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2643  ferrochelatase  54.65 
 
 
371 aa  353  2e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2852  ferrochelatase  52.78 
 
 
337 aa  353  2e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142653  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0746  ferrochelatase  54.19 
 
 
354 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.442383  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2877  ferrochelatase  54.35 
 
 
371 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  55.18 
 
 
369 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  53.66 
 
 
371 aa  352  5.9999999999999994e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3283  ferrochelatase  55.56 
 
 
367 aa  349  5e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140379  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1235  ferrochelatase  50.45 
 
 
345 aa  348  7e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404951  normal  0.452003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  54.77 
 
 
364 aa  348  8e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1496  ferrochelatase  53.68 
 
 
370 aa  348  9e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1545  ferrochelatase  51.54 
 
 
368 aa  347  1e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0495  ferrochelatase  55.26 
 
 
367 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.950986  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2330  ferrochelatase  55.26 
 
 
367 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3326  ferrochelatase  55.26 
 
 
367 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3316  ferrochelatase  55.26 
 
 
367 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2211  ferrochelatase  55.26 
 
 
367 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1104  ferrochelatase  55.26 
 
 
367 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624385  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2583  ferrochelatase  52.62 
 
 
339 aa  346  3e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166892  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1335  ferrochelatase  49.85 
 
 
343 aa  343  2e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2296  ferrochelatase  53.07 
 
 
347 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000361328  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3835  ferrochelatase  54.19 
 
 
354 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2660  ferrochelatase  52.92 
 
 
339 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0278413  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1303  ferrochelatase  55.56 
 
 
355 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1801  ferrochelatase  52.92 
 
 
339 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.452842  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0262  ferrochelatase  54.19 
 
 
354 aa  342  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  52.44 
 
 
370 aa  342  5.999999999999999e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0716  ferrochelatase  53.89 
 
 
354 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.825613  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0508  ferrochelatase  51.39 
 
 
324 aa  338  9e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1486  ferrochelatase  54.1 
 
 
364 aa  337  9.999999999999999e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2638  ferrochelatase  54.19 
 
 
355 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2545  ferrochelatase  52.31 
 
 
339 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.445897  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2248  ferrochelatase  52.63 
 
 
348 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000320467  normal  0.140516 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2440  ferrochelatase  52.63 
 
 
348 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000390134  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0664  ferrochelatase  54.19 
 
 
354 aa  335  5e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0640  ferrochelatase  54.19 
 
 
354 aa  335  5e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2019  ferrochelatase  52.63 
 
 
348 aa  335  7e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1529  ferrochelatase  49.54 
 
 
331 aa  335  7e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000651574  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2320  ferrochelatase  52.32 
 
 
348 aa  333  3e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  unclonable  0.0000443294 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  51.7 
 
 
327 aa  332  6e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0737  ferrochelatase  52 
 
 
373 aa  330  2e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1864  ferrochelatase  51.06 
 
 
378 aa  328  7e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000715246  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0129  ferrochelatase  56.27 
 
 
371 aa  326  4.0000000000000003e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3987  ferrochelatase  46.41 
 
 
360 aa  326  5e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.189595  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2846  ferrochelatase  50.77 
 
 
335 aa  325  7e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000266321  decreased coverage  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01329  ferrochelatase  50.16 
 
 
321 aa  324  1e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004135  ferrochelatase protoheme ferro-lyase  49.84 
 
 
320 aa  324  2e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0897  ferrochelatase  52.32 
 
 
328 aa  321  9.999999999999999e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2535  ferrochelatase  49.69 
 
 
340 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1039  ferrochelatase  46.9 
 
 
354 aa  316  4e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1081  ferrochelatase  48.77 
 
 
425 aa  315  9e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1671  ferrochelatase  51.4 
 
 
325 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1664  ferrochelatase  51.88 
 
 
320 aa  314  1.9999999999999998e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1736  ferrochelatase  51.88 
 
 
320 aa  314  1.9999999999999998e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3230  ferrochelatase  49.22 
 
 
320 aa  311  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258803  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3991  ferrochelatase  52.29 
 
 
320 aa  309  4e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.4603 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3034  ferrochelatase  49.69 
 
 
320 aa  308  6.999999999999999e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03842  ferrochelatase  50.16 
 
 
321 aa  301  9e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3053  ferrochelatase  46.39 
 
 
320 aa  300  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3193  ferrochelatase  46.39 
 
 
320 aa  300  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795846  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2895  ferrochelatase  46.39 
 
 
320 aa  300  2e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.187224  normal  0.0904041 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2229  ferrochelatase  49.85 
 
 
337 aa  299  4e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0013566  hitchhiker  0.00122405 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2057  ferrochelatase  46.77 
 
 
339 aa  298  6e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.967381  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>