More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03842 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03842  ferrochelatase  100 
 
 
321 aa  653    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1664  ferrochelatase  75.16 
 
 
320 aa  501  1e-141  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1736  ferrochelatase  74.84 
 
 
320 aa  501  1e-141  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3991  ferrochelatase  69.06 
 
 
320 aa  444  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.4603 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004135  ferrochelatase protoheme ferro-lyase  45.6 
 
 
320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  48.26 
 
 
367 aa  302  6.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  50.16 
 
 
352 aa  301  8.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  50.16 
 
 
352 aa  300  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  47.32 
 
 
367 aa  300  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1545  ferrochelatase  46.3 
 
 
369 aa  299  5e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01329  ferrochelatase  45.45 
 
 
321 aa  297  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2495  ferrochelatase  47.47 
 
 
363 aa  292  4e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3000  ferrochelatase  49.22 
 
 
354 aa  292  5e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0358  Ferrochelatase  49.84 
 
 
337 aa  287  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.22206  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0179  ferrochelatase  49.84 
 
 
337 aa  287  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2019  ferrochelatase  45.71 
 
 
348 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3193  ferrochelatase  46.42 
 
 
320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795846  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3053  ferrochelatase  46.42 
 
 
320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2895  ferrochelatase  46.42 
 
 
320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.187224  normal  0.0904041 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1801  ferrochelatase  43.75 
 
 
339 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.452842  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0508  ferrochelatase  43.75 
 
 
324 aa  286  4e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2440  ferrochelatase  43.5 
 
 
348 aa  285  7e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000390134  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2660  ferrochelatase  43.75 
 
 
339 aa  285  8e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0278413  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2583  ferrochelatase  43.44 
 
 
339 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166892  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0929  ferrochelatase  44.98 
 
 
367 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2846  ferrochelatase  44.41 
 
 
335 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000266321  decreased coverage  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0746  ferrochelatase  45.28 
 
 
354 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.442383  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1671  ferrochelatase  50.32 
 
 
325 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2248  ferrochelatase  44.24 
 
 
348 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000320467  normal  0.140516 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1723  ferrochelatase  46.34 
 
 
365 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2296  ferrochelatase  43.03 
 
 
347 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000361328  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2545  ferrochelatase  43.75 
 
 
339 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.445897  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3230  ferrochelatase  46.33 
 
 
320 aa  282  7.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258803  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1081  ferrochelatase  46.47 
 
 
425 aa  281  7.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  45.62 
 
 
364 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2320  ferrochelatase  43.93 
 
 
348 aa  280  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  unclonable  0.0000443294 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1574  ferrochelatase  49.53 
 
 
398 aa  279  4e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102455 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  45.14 
 
 
327 aa  279  4e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3965  ferrochelatase  44.27 
 
 
356 aa  279  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0641641 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2562  ferrochelatase  45.59 
 
 
365 aa  277  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.132687 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1143  ferrochelatase  46.23 
 
 
320 aa  276  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559652  unclonable  0.0000000305999 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2502  ferrochelatase  45.14 
 
 
356 aa  276  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20421  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1545  ferrochelatase  45.68 
 
 
368 aa  276  4e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0955  ferrochelatase  45.83 
 
 
320 aa  276  4e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0551  ferrochelatase  46.2 
 
 
320 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139306  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0733  ferrochelatase  44.2 
 
 
356 aa  276  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1037  ferrochelatase  44.98 
 
 
371 aa  275  6e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0536  ferrochelatase  46.2 
 
 
320 aa  275  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3034  ferrochelatase  45.95 
 
 
320 aa  275  8e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0515  ferrochelatase  46.15 
 
 
320 aa  275  9e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.402786  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3021  ferrochelatase  45.31 
 
 
337 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00598338  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0595  ferrochelatase  46.2 
 
 
320 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0541  ferrochelatase  46.2 
 
 
320 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229981  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0535  ferrochelatase  46.2 
 
 
320 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  45.79 
 
 
371 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3179  ferrochelatase  45.31 
 
 
337 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00714455  normal  0.0188906 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1771  ferrochelatase  44.51 
 
 
364 aa  273  3e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2638  ferrochelatase  45.79 
 
 
355 aa  273  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1496  ferrochelatase  44.65 
 
 
370 aa  273  4.0000000000000004e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  44.48 
 
 
368 aa  273  4.0000000000000004e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1529  ferrochelatase  41.18 
 
 
331 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000651574  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0262  ferrochelatase  45 
 
 
354 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3036  ferrochelatase  44.86 
 
 
337 aa  272  6e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000027258  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1001  ferrochelatase  44.07 
 
 
371 aa  272  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.535203 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1342  Ferrochelatase  45 
 
 
337 aa  272  7e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0425559  hitchhiker  0.000000000751933 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  44.69 
 
 
337 aa  272  7e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0716  ferrochelatase  45 
 
 
354 aa  272  7e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.825613  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2425  ferrochelatase  47.98 
 
 
354 aa  271  9e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0495  ferrochelatase  46.27 
 
 
367 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.950986  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1104  ferrochelatase  46.27 
 
 
367 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624385  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2330  ferrochelatase  46.27 
 
 
367 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2211  ferrochelatase  46.27 
 
 
367 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3326  ferrochelatase  46.27 
 
 
367 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0664  ferrochelatase  45.17 
 
 
354 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1303  ferrochelatase  47.2 
 
 
355 aa  270  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3283  ferrochelatase  46.27 
 
 
367 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140379  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3316  ferrochelatase  46.27 
 
 
367 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0640  ferrochelatase  45.17 
 
 
354 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2215  ferrochelatase  41.8 
 
 
330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.228153 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2424  ferrochelatase  42.72 
 
 
370 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.695246  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1025  ferrochelatase  47.12 
 
 
320 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  45.96 
 
 
369 aa  269  5e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  42.99 
 
 
355 aa  269  5e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0737  ferrochelatase  45.51 
 
 
373 aa  269  5e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00426  ferrochelatase  45.51 
 
 
320 aa  268  7e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00431  hypothetical protein  45.51 
 
 
320 aa  268  7e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3141  ferrochelatase  45.51 
 
 
320 aa  268  7e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.692979  hitchhiker  0.00475646 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0552  ferrochelatase  45.51 
 
 
320 aa  268  7e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.425129  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3135  Ferrochelatase  45.19 
 
 
320 aa  268  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.942163  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3835  ferrochelatase  44.69 
 
 
354 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0568  ferrochelatase  45.19 
 
 
320 aa  267  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.414363  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0408  ferrochelatase  45.19 
 
 
320 aa  267  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.86584  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0520  ferrochelatase  45.19 
 
 
320 aa  265  5.999999999999999e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0674477  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0772  ferrochelatase  44.69 
 
 
344 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000682617 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2229  ferrochelatase  43.65 
 
 
337 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0013566  hitchhiker  0.00122405 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0897  ferrochelatase  45.79 
 
 
328 aa  265  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  43.44 
 
 
327 aa  264  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0415  ferrochelatase  42.37 
 
 
339 aa  263  2e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3987  ferrochelatase  41.96 
 
 
360 aa  263  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.189595  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  43.12 
 
 
327 aa  263  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>