More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0615 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0615  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  100 
 
 		 276 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0074  HAD-superfamily hydrolase  31.8 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.542278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0144  phosphatase YbhA  32.94 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.21 
 
 		 290 aa  106  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.962827  hitchhiker  0.00110837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1954  Cof-like hydrolase  31.27 
 
 		 274 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.67 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.384246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0126  Cof-like hydrolase  31.01 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4106  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.88 
 
 		 272 aa  98.2  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.607815  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0293  Cof-like hydrolase  31.11 
 
 		 268 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4318  Cof protein  32.82 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.873657 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1155  Cof-like hydrolase  31.11 
 
 		 270 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269988  normal  0.0161592 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0158  Cof-like hydrolase  30.71 
 
 		 277 aa  96.7  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0121  Cof-like hydrolase  30.48 
 
 		 273 aa  96.3  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13847  hypothetical protein  31.09 
 
 		 273 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.320421 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  31.09 
 
 		 271 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  31.09 
 
 		 271 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0280  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.46 
 
 		 267 aa  93.6  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  30.71 
 
 		 271 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0228  Cof-like hydrolase  31.14 
 
 		 272 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  30.08 
 
 		 267 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2103  Cof-like hydrolase  29.45 
 
 		 281 aa  90.1  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.519808 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0111  Cof-like hydrolase  29.62 
 
 		 272 aa  89  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07610  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.74 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0517229 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1388  Cof-like hydrolase  27.61 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.323635  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0177  HAD family hydrolase  31.56 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0958993  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00960  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.97 
 
 		 282 aa  82  0.000000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0141  Cof-like hydrolase  30.22 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2032  Cof-like hydrolase  25.37 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.201826 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3241  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.48 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1746  Cof-like hydrolase  23.57 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0279  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.66 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.333001  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01160  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.74 
 
 		 269 aa  75.5  0.0000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  25.28 
 
 		 269 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0299  Cof-like hydrolase  29.48 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  24.91 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  21.15 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6169  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  27.08 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  24.73 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  24.73 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6168  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  27.72 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3183  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  35.69 
 
 		 265 aa  72  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0375981 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  26.71 
 
 		 268 aa  72  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  26.28 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1895  HAD superfamily hydrolase  28.46 
 
 		 278 aa  72  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000132103  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  24.53 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4525  Cof-like hydrolase  28.03 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.992091 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0511  HAD superfamily hydrolase  25.09 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.930094  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5573  hypothetical protein  29.18 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  26.28 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  23.21 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0324  Cof-like hydrolase  23.51 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3074  Cof-like hydrolase  25.7 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  24.91 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  22.86 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  25.91 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  25.47 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0560  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.87 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  25.47 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  25.47 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  25.47 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  25.47 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2987  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  27.21 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  25.47 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  25.47 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  25.47 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  25.91 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  25.91 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.3 
 
 		 266 aa  67  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452319  hitchhiker  0.00105022 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5035  HAD family hydrolase  27.65 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0175  HAD family hydrolase  30.07 
 
 		 282 aa  65.5  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  25 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3120  Cof-like hydrolase family protein  26.47 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330489  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0506  hypothetical protein  25.28 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.670453  normal  0.663931 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  26.69 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  22.22 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0709  HAD family hydrolase  23.33 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  21 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0560  hypothetical protein  25.28 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.62907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0497  protein cof  25.28 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0247  HAD superfamily hydrolase  21.72 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00065793  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0500  hypothetical protein  25.28 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3524  Cof-like hydrolase  26.89 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.756821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0113  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.81 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0516  protein cof  24.91 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01730  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.57 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0277  Cof-like hydrolase  28.79 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7012  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.32 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00675343  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  21.94 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1119  Cof-like hydrolase  26.1 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.78603  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00301  hydrolase  23.28 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2937  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  34.02 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0182848  hitchhiker  0.000402295 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  23.62 
 
 		 265 aa  62  0.000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4024  HAD superfamily hydrolase  24.91 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4095  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.91 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603342  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002120  hydrolase (HAD superfamily)  23.28 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  21.58 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  20.28 
 
 		 277 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2934  phosphotransferase  23.08 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3733  HAD superfamily hydrolase  24.55 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1448  Cof-like hydrolase  25.96 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>