More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0913 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_1299  DNA mismatch repair protein MutS  42.07 
 
 		 914 aa  639    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.141225  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0032  DNA mismatch repair protein MutS  45.92 
 
 		 880 aa  636    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_004310  BR0147  DNA mismatch repair protein MutS  45.95 
 
 		 910 aa  686    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0513  DNA mismatch repair protein MutS  47.42 
 
 		 907 aa  653    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3466  DNA mismatch repair protein MutS  48.19 
 
 		 877 aa  672    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0142  DNA mismatch repair protein MutS  45.95 
 
 		 898 aa  685    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1263  DNA mismatch repair protein MutS  47.47 
 
 		 919 aa  679    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0902404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0490  DNA mismatch repair protein MutS  47.45 
 
 		 888 aa  648    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4799  DNA mismatch repair protein MutS  47.87 
 
 		 896 aa  639    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.720607 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3541  DNA mismatch repair protein MutS  47.14 
 
 		 929 aa  636    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0528  DNA mismatch repair protein MutS  48.31 
 
 		 911 aa  668    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0799066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0209  DNA mismatch repair protein MutS  45.48 
 
 		 877 aa  642    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.784326 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0299  DNA mismatch repair protein MutS  59.45 
 
 		 873 aa  894    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.391446  normal  0.153174 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0363  DNA mismatch repair protein MutS  48.26 
 
 		 882 aa  668    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0913  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 882 aa  1696    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3599  DNA mismatch repair protein MutS  50.34 
 
 		 908 aa  692    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0321  DNA mismatch repair protein MutS  47.4 
 
 		 923 aa  649    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.784021  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0614  DNA mismatch repair protein MutS  47.61 
 
 		 907 aa  665    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2875  DNA mismatch repair protein MutS  43.98 
 
 		 879 aa  650    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.928835 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4031  DNA mismatch repair protein MutS  47.23 
 
 		 881 aa  664    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137829  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4649  DNA mismatch repair protein MutS  47.47 
 
 		 916 aa  638    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.427089 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0159  DNA mismatch repair protein MutS  45.89 
 
 		 910 aa  686    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0423  DNA mismatch repair protein MutS  45.12 
 
 		 883 aa  649    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7642  DNA mismatch repair protein MutS  46.26 
 
 		 910 aa  647    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.532158 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0035  DNA mismatch repair protein MutS  49.94 
 
 		 921 aa  678    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0621  DNA mismatch repair protein MutS  49.72 
 
 		 905 aa  635  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.720679  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4282  DNA mismatch repair protein MutS  47.36 
 
 		 916 aa  635  1e-180  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0047  DNA mismatch repair protein MutS  45.67 
 
 		 908 aa  630  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.967716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0827  DNA mismatch repair protein MutS  46.95 
 
 		 878 aa  632  1e-179  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2761  DNA mismatch repair protein MutS  47.91 
 
 		 904 aa  628  1e-178  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2326  DNA mismatch repair protein MutS  47.46 
 
 		 925 aa  627  1e-178  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.160487 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3021  DNA mismatch repair protein MutS  46.56 
 
 		 897 aa  621  1e-176  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2655  DNA mismatch repair protein MutS  46.8 
 
 		 876 aa  617  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.607224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2791  DNA mismatch repair protein MutS  47.47 
 
 		 864 aa  617  1e-175  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6533  DNA mismatch repair protein MutS  48 
 
 		 962 aa  617  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948742  normal  0.317969 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1218  DNA mismatch repair protein MutS  45.2 
 
 		 875 aa  610  1e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.318661  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3293  DNA mismatch repair protein MutS  45.8 
 
 		 858 aa  610  1e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0310827  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2879  DNA mismatch repair protein MutS  45.2 
 
 		 880 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0008  DNA mismatch repair protein MutS  46.11 
 
 		 904 aa  602  1e-170  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0030  DNA mismatch repair protein MutS  44.53 
 
 		 915 aa  595  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355609 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7101  DNA mismatch repair protein MutS  47.09 
 
 		 929 aa  595  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743761  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0260  DNA mismatch repair protein MutS  37.1 
 
 		 804 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.76262  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  40.2 
 
 		 868 aa  562  1e-158  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_002978  WD0190  DNA mismatch repair protein MutS  36.68 
 
 		 820 aa  557  1e-157  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0824  DNA mismatch repair protein MutS  37.09 
 
 		 804 aa  556  1e-157  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  40.98 
 
 		 881 aa  550  1e-155  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0335  DNA mismatch repair protein MutS  37.91 
 
 		 815 aa  545  1e-153  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.213975  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  39.95 
 
 		 863 aa  536  1e-151  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  37.64 
 
 		 887 aa  523  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  39.64 
 
 		 884 aa  523  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  39.64 
 
 		 884 aa  523  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5989  DNA mismatch repair protein MutS  40.13 
 
 		 885 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  36.37 
 
 		 858 aa  520  1e-146  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1998  DNA mismatch repair protein MutS  39.53 
 
 		 885 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368418 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2691  DNA mismatch repair protein MutS  40.18 
 
 		 938 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0407651  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3263  DNA mismatch repair protein MutS  36.78 
 
 		 889 aa  521  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  39.66 
 
 		 891 aa  519  1.0000000000000001e-145  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  37.58 
 
 		 859 aa  519  1.0000000000000001e-145  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2124  DNA mismatch repair protein MutS  39.4 
 
 		 886 aa  519  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  38.84 
 
 		 851 aa  513  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2173  DNA mismatch repair protein MutS  39.91 
 
 		 939 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.01775  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2612  DNA mismatch repair protein MutS  39.91 
 
 		 939 aa  515  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1671  DNA mismatch repair protein MutS  39.91 
 
 		 891 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207117  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  36.02 
 
 		 846 aa  515  1e-144  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  36.25 
 
 		 846 aa  515  1e-144  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2107  DNA mismatch repair protein MutS  40 
 
 		 885 aa  515  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.069343 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  37.93 
 
 		 854 aa  512  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  39.75 
 
 		 855 aa  513  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  38.85 
 
 		 872 aa  515  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  38.28 
 
 		 854 aa  515  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  37.36 
 
 		 859 aa  515  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1446  DNA mismatch repair protein MutS  39.91 
 
 		 939 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350724  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  39.41 
 
 		 859 aa  515  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3424  DNA mismatch repair protein MutS  38.26 
 
 		 851 aa  513  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  37.06 
 
 		 853 aa  514  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3145  DNA mismatch repair protein MutS  39.91 
 
 		 939 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  38.46 
 
 		 872 aa  513  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  38.75 
 
 		 852 aa  513  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  36.92 
 
 		 853 aa  515  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  41.08 
 
 		 878 aa  515  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2088  DNA mismatch repair protein MutS  40 
 
 		 885 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  38.73 
 
 		 858 aa  516  1e-144  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0956  DNA mismatch repair protein MutS  38.14 
 
 		 851 aa  511  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  38.05 
 
 		 854 aa  510  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  38.39 
 
 		 871 aa  512  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5394  DNA mismatch repair protein MutS  39.29 
 
 		 885 aa  509  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.597717  normal  0.74748 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  38.95 
 
 		 874 aa  510  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3292  DNA mismatch repair protein MutS  38.14 
 
 		 851 aa  510  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1075  DNA mismatch repair protein MutS  38.83 
 
 		 916 aa  509  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.835373  normal  0.410772 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2559  DNA mismatch repair protein MutS  40.02 
 
 		 891 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  38.3 
 
 		 880 aa  508  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1111  DNA mismatch repair protein MutS  39.2 
 
 		 922 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.88674  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1166  DNA mismatch repair protein MutS  39.04 
 
 		 863 aa  507  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  37.26 
 
 		 863 aa  508  9.999999999999999e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4050  DNA mismatch repair protein MutS  38.57 
 
 		 857 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593835  hitchhiker  0.000000000609956 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  37.73 
 
 		 856 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1913  DNA mismatch repair protein MutS  39.28 
 
 		 893 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.396246  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  37.4 
 
 		 861 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1186  DNA mismatch repair protein MutS  38.96 
 
 		 884 aa  505  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296401 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  36.16 
 
 		 862 aa  503  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>