More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0463 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
257 aa  524  1e-148  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.83 
 
 
258 aa  346  3e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.143319  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0919  putative oxidoreductase  63.42 
 
 
257 aa  320  1e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal  0.888241 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.26 
 
 
257 aa  316  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.2 
 
 
257 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563434  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.48 
 
 
257 aa  300  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.242227  normal  0.57964 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.53 
 
 
257 aa  298  7e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00108701 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.2 
 
 
256 aa  284  1e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2476  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.83 
 
 
239 aa  281  7e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.42 
 
 
257 aa  279  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0293  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.03 
 
 
257 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.673149  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.47 
 
 
255 aa  271  7e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.86 
 
 
255 aa  266  3e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.13 
 
 
251 aa  264  8e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00162277  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.83 
 
 
264 aa  248  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2695  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  55.12 
 
 
277 aa  239  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.12 
 
 
271 aa  238  8e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1513  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  55.12 
 
 
277 aa  237  1e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.729699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2363  Short-chain dehydrogenase/reductase  52.34 
 
 
254 aa  225  7e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.34 
 
 
254 aa  224  8e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.824888  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.24 
 
 
254 aa  221  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496264  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.05 
 
 
255 aa  221  9e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.199732  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.05 
 
 
255 aa  220  2e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.05 
 
 
255 aa  220  2e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.150517  normal  0.215397 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.6 
 
 
256 aa  220  2e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.872247 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.1 
 
 
258 aa  218  7e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29820  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  50 
 
 
261 aa  214  8e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.88 
 
 
254 aa  213  2e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251484  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.67 
 
 
254 aa  212  6e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3588  hypothetical protein  45.56 
 
 
254 aa  208  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00208776  normal  0.410255 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2411  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.31 
 
 
255 aa  206  3e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1454  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.27 
 
 
256 aa  206  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.108685 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.84 
 
 
269 aa  206  4e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.26 
 
 
257 aa  196  4e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.34144  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0615  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.26 
 
 
257 aa  194  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000368197  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6105  short-chain dehydrogenase/reductase  44.19 
 
 
265 aa  190  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  40.55 
 
 
260 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 
257 aa  184  8e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.47 
 
 
255 aa  184  2e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.31904e-06  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  39.53 
 
 
259 aa  182  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1763  gluconate 5-dehydrogenase  40.55 
 
 
260 aa  180  3e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.401808  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1484  gluconate 5-dehydrogenase  40.16 
 
 
260 aa  179  3e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0155973  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  42.13 
 
 
255 aa  180  3e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42 
 
 
247 aa  179  5e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1443  gluconate 5-dehydrogenase  40.16 
 
 
260 aa  179  5e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325951  normal  0.0253033 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2333  gluconate 5-dehydrogenase  42.47 
 
 
259 aa  178  9e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.885017  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86346  peroxisomal 2,4- dienoyl-CoA reductase and sorbitol utilization protein  42.41 
 
 
285 aa  177  2e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  42.58 
 
 
252 aa  175  7e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.02 
 
 
255 aa  174  2e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 
255 aa  172  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
258 aa  171  7e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07590  hypothetical protein similar to NADP-dependent mannitol dehydrogenase (Broad)  42.58 
 
 
266 aa  171  8e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 
255 aa  171  9e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2921  dehydrogenase  46.21 
 
 
261 aa  171  9e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 
254 aa  171  9e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0175  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.36 
 
 
247 aa  170  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.49 
 
 
248 aa  170  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  5.36759e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.47 
 
 
257 aa  168  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.47 
 
 
257 aa  168  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1409  gluconate 5-dehydrogenase  39.69 
 
 
260 aa  168  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2037  short chain dehydrogenase  38.91 
 
 
262 aa  168  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00988022  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2397  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  40.23 
 
 
254 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0465114  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3756  gluconate 5-dehydrogenase  37.8 
 
 
257 aa  167  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 
270 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3725  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 
269 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725023  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2492  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  40.65 
 
 
245 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6365  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 
263 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.54288  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.47 
 
 
257 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.600374  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46750  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
257 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.658343  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  40.56 
 
 
254 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 
254 aa  166  3e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3124  short chain dehydrogenase  40 
 
 
262 aa  166  3e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 
253 aa  166  3e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.044107  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.87 
 
 
246 aa  166  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2403  gluconate 5-dehydrogenase  39.13 
 
 
258 aa  166  5e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.525317  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7084  gluconate 5-dehydrogenase  37.74 
 
 
255 aa  165  6e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2692  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.37 
 
 
272 aa  165  7e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0908  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.11 
 
 
257 aa  165  8e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.117831  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
257 aa  165  8e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1851  gluconate 5-dehydrogenase  37.15 
 
 
260 aa  164  1e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.198252 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.34 
 
 
247 aa  164  1e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2389  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  41.27 
 
 
255 aa  163  2e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2494  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.65 
 
 
248 aa  164  2e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  8.2608e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
254 aa  163  2e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1360  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.08 
 
 
243 aa  163  2e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  4.68393e-09  normal  0.0479743 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 
257 aa  164  2e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
251 aa  163  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0180  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.55 
 
 
245 aa  162  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00307059  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19760  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  42.34 
 
 
256 aa  162  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000927245  normal  0.0200652 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0167  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.16 
 
 
245 aa  163  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.619009  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20330  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.74 
 
 
281 aa  163  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_642  oxidoreductase, short chain dehydrogenase  39.62 
 
 
265 aa  163  3e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  1.00952e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1381  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  41.77 
 
 
248 aa  163  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.049098  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4012  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
276 aa  162  4e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
255 aa  162  4e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24294  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.45 
 
 
244 aa  162  5e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5289  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
263 aa  162  5e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0559291  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1603  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.2 
 
 
248 aa  162  5e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  4.01343e-08  decreased coverage  0.000161546 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0349  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.08 
 
 
257 aa  162  6e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38255  peroxisomal 2,4- dienoyl-CoA reductase, and sorbitol utilization protein  38.74 
 
 
282 aa  162  6e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>