More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4221 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  100 
 
 		 411 aa  841    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  44.13 
 
 		 433 aa  303  5.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  42.42 
 
 		 380 aa  301  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  44.12 
 
 		 378 aa  300  3e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  42.86 
 
 		 384 aa  296  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  43.42 
 
 		 373 aa  293  3e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  41.11 
 
 		 379 aa  288  1e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  41.67 
 
 		 370 aa  282  7.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  40.21 
 
 		 379 aa  279  6e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  40.16 
 
 		 388 aa  277  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  40.05 
 
 		 371 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  40 
 
 		 373 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  36.88 
 
 		 390 aa  271  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  40.57 
 
 		 382 aa  269  5e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  39.13 
 
 		 375 aa  268  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  40.32 
 
 		 369 aa  266  5e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  36.48 
 
 		 373 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  42.33 
 
 		 380 aa  262  1e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  35.79 
 
 		 373 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  39.95 
 
 		 379 aa  259  7e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  39.95 
 
 		 379 aa  259  8e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  37.17 
 
 		 390 aa  259  9e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  35.79 
 
 		 373 aa  257  2e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  36.92 
 
 		 389 aa  256  5e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  38.34 
 
 		 380 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  37.5 
 
 		 389 aa  251  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  40.67 
 
 		 388 aa  251  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  38.68 
 
 		 390 aa  249  5e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  36.1 
 
 		 380 aa  249  6e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  36.53 
 
 		 395 aa  247  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  36.81 
 
 		 377 aa  248  2e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  36.07 
 
 		 391 aa  247  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  38.5 
 
 		 406 aa  246  4e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  35.81 
 
 		 391 aa  246  4e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  35.26 
 
 		 403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  35.01 
 
 		 392 aa  243  5e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  35.28 
 
 		 391 aa  242  7e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  35.54 
 
 		 391 aa  243  7e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  35.28 
 
 		 391 aa  242  7e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  35.54 
 
 		 391 aa  242  7e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  35.92 
 
 		 395 aa  242  9e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  35.28 
 
 		 391 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  35.01 
 
 		 391 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  35.43 
 
 		 403 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  35.43 
 
 		 403 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  35.28 
 
 		 391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  36.15 
 
 		 391 aa  239  4e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0259  alanine racemase  36.83 
 
 		 396 aa  239  4e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.060575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  37.99 
 
 		 370 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  37.02 
 
 		 390 aa  238  1e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  33.85 
 
 		 441 aa  236  8e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  36.77 
 
 		 395 aa  232  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1337  alanine racemase  33.95 
 
 		 369 aa  231  2e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000100581  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  36.51 
 
 		 395 aa  229  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  38.17 
 
 		 376 aa  228  1e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  34.55 
 
 		 398 aa  228  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23341  alanine racemase  37.89 
 
 		 398 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  37.27 
 
 		 364 aa  227  3e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0233  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  35.06 
 
 		 834 aa  227  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  36.48 
 
 		 376 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  34.72 
 
 		 386 aa  225  9e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  36.24 
 
 		 395 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  35.01 
 
 		 408 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  34.99 
 
 		 386 aa  223  4e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  38.1 
 
 		 851 aa  223  4.9999999999999996e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1245  alanine racemase  35.48 
 
 		 384 aa  221  9.999999999999999e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5524  alanine racemase  38.1 
 
 		 365 aa  221  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5321  alanine racemase  39.37 
 
 		 357 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274538 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  36.56 
 
 		 375 aa  219  5e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5269  alanine racemase  38.85 
 
 		 357 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  34.85 
 
 		 395 aa  219  6e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5375  alanine racemase  37.5 
 
 		 402 aa  219  8.999999999999998e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1646  alanine racemase  34.29 
 
 		 374 aa  218  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.064552  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3487  alanine racemase  37.57 
 
 		 393 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1850  alanine racemase  35.47 
 
 		 367 aa  217  2.9999999999999998e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.801979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5179  alanine racemase  38.58 
 
 		 357 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265512  normal  0.266317 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0326  alanine racemase  33.86 
 
 		 369 aa  216  8e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.442092  normal  0.535526 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  34.46 
 
 		 379 aa  215  9.999999999999999e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1098  alanine racemase  35.54 
 
 		 402 aa  215  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2737  alanine racemase  38.24 
 
 		 382 aa  215  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115785  hitchhiker  0.00850953 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2520  alanine racemase  38.2 
 
 		 811 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  34.29 
 
 		 387 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  36.03 
 
 		 387 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0201  alanine racemase  37.53 
 
 		 357 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394182 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16471  alanine racemase  36.07 
 
 		 381 aa  213  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0230  alanine racemase  37.8 
 
 		 389 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2128  alanine racemase  34.57 
 
 		 374 aa  212  1e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01510  alanine racemase  33.93 
 
 		 421 aa  211  2e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0441968 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1498  alanine racemase  35.25 
 
 		 378 aa  211  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19731  alanine racemase  35.54 
 
 		 402 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2011  alanine racemase  36.36 
 
 		 368 aa  210  3e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.0449726 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0238  alanine racemase  37.53 
 
 		 389 aa  209  8e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0609  alanine racemase  39.16 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561464  normal  0.417929 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0198  alanine racemase  36.92 
 
 		 324 aa  208  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1885  alanine racemase  37.76 
 
 		 397 aa  207  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.849261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  37.98 
 
 		 384 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  36.75 
 
 		 389 aa  206  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  36.75 
 
 		 389 aa  207  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1701  alanine racemase  34.66 
 
 		 367 aa  206  4e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  37.01 
 
 		 389 aa  206  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>