216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2109 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2109  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 299 aa  603  9.999999999999999e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4541  helix-turn-helix domain-containing protein  62.11 
 
 		 307 aa  349  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0445  XRE family transcriptional regulator  54.51 
 
 		 296 aa  327  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3008  helix-turn-helix domain protein  55.83 
 
 		 303 aa  321  8e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000207491 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3750  helix-turn-helix domain-containing protein  57.04 
 
 		 298 aa  306  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1690  transcriptional regulator, XRE family  55.12 
 
 		 305 aa  301  6.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal  0.186529 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  50.88 
 
 		 293 aa  290  2e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3498  transcriptional regulator, XRE family  52.5 
 
 		 293 aa  287  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  48.83 
 
 		 293 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4120  helix-turn-helix domain protein  50.83 
 
 		 313 aa  281  1e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0682  transcriptional regulator, XRE family  49.66 
 
 		 292 aa  278  8e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  48.99 
 
 		 299 aa  276  3e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1568  transcriptional regulator, XRE family  52.1 
 
 		 304 aa  273  3e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  49.11 
 
 		 287 aa  271  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3277  helix-turn-helix domain protein  50 
 
 		 294 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14370  hypothetical protein  46.83 
 
 		 297 aa  263  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31240  Helix-turn-helix protein  49.3 
 
 		 290 aa  260  2e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20310  hypothetical protein  50.17 
 
 		 297 aa  259  3e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.643001  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04290  Helix-turn-helix protein  46.6 
 
 		 334 aa  252  5.000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2666  helix-turn-helix domain-containing protein  46.26 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.372203  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3682  helix-turn-helix domain protein  46.6 
 
 		 307 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2622  XRE family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2651  XRE family transcriptional regulator  45.91 
 
 		 297 aa  248  7e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12000  Helix-turn-helix protein  50.17 
 
 		 303 aa  235  5.0000000000000005e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19300  Helix-turn-helix protein  45.23 
 
 		 302 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  43.57 
 
 		 297 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0777  transcriptional regulator, XRE family  44.83 
 
 		 287 aa  224  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245899  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2718  helix-turn-helix domain protein  45.24 
 
 		 308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.479107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  41.44 
 
 		 309 aa  205  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0411  helix-turn-helix domain protein  40.53 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3299  helix-turn-helix domain protein  43.93 
 
 		 280 aa  196  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.043491  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  38.78 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  41.01 
 
 		 292 aa  189  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6984  helix-turn-helix domain protein  40.57 
 
 		 286 aa  189  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118873  normal  0.27222 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 285 aa  189  7e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 301 aa  187  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4080  XRE family transcriptional regulator  44.15 
 
 		 312 aa  186  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0766168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  41.39 
 
 		 302 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0367  helix-turn-helix domain protein  40.88 
 
 		 284 aa  179  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  41.91 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  39.05 
 
 		 303 aa  176  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  38.54 
 
 		 299 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  38.91 
 
 		 276 aa  175  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  36.89 
 
 		 318 aa  170  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4445  XRE family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20270  hypothetical protein  38.58 
 
 		 277 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.161196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1586  transcriptional regulator, XRE family  37.83 
 
 		 317 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2441  transcriptional regulator, XRE family  41.58 
 
 		 275 aa  166  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4218  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4284  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  38.35 
 
 		 314 aa  162  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  36.62 
 
 		 310 aa  162  7e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2562  XRE family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 342 aa  162  9e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19630  Helix-turn-helix protein  35.36 
 
 		 288 aa  161  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.879989  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  37.63 
 
 		 278 aa  160  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1995  transcriptional regulator, XRE family  36.97 
 
 		 313 aa  159  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000234374  normal  0.041772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0180  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 288 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7348  hypothetical protein  39.65 
 
 		 291 aa  159  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0189  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 288 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5666  putative transcriptional regulator, XRE family  37.45 
 
 		 273 aa  158  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4329  transcriptional regulator, XRE family  37.46 
 
 		 290 aa  156  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0368  transcriptional regulator, XRE family  37.35 
 
 		 291 aa  155  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14230  Helix-turn-helix protein  41.41 
 
 		 277 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.814537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2579  helix-turn-helix domain protein  34.78 
 
 		 328 aa  153  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  39.35 
 
 		 289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4361  transcriptional regulator, XRE family  40.51 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2188  transcriptional regulator, XRE family  38.11 
 
 		 281 aa  148  9e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371471  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8805  transcriptional regulator, XRE family  37.32 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2804  putative transcriptional regulator, XRE family  38.13 
 
 		 300 aa  145  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  38.81 
 
 		 281 aa  142  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2784  transcriptional regulator, XRE family  39.08 
 
 		 284 aa  139  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.583087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1003  putative transcriptional regulator, XRE family  38.66 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5457  helix-turn-helix domain-containing protein  36.25 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  37.85 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0750  XRE family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 283 aa  135  7.000000000000001e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6833  helix-turn-helix domain protein  34.2 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1893  helix-turn-helix domain protein  37.23 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.792434 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2377  transcriptional regulator, XRE family  35.42 
 
 		 283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000201287  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2494  helix-turn-helix domain protein  37.9 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106258  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  36.33 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2389  helix-turn-helix domain protein  36.4 
 
 		 311 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00160745  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3948  hypothetical protein  37.45 
 
 		 287 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00019593  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3153  transcriptional regulator, XRE family  34.15 
 
 		 290 aa  132  6.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3276  transcriptional regulator, XRE family  36.86 
 
 		 281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  35.06 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2521  helix-turn-helix domain protein  35.46 
 
 		 285 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.895975  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 299 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4588  XRE family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 286 aa  128  9.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000221272 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3598  transcriptional regulator, XRE family  36.86 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2624  transcriptional regulator, XRE family  34.1 
 
 		 274 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1956  putative transcriptional regulator, XRE family  35.4 
 
 		 331 aa  126  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5755  XRE family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 269 aa  125  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1464  helix-turn-helix domain-containing protein  32.06 
 
 		 301 aa  125  8.000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  35.19 
 
 		 313 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1949  transcriptional regulator, XRE family  33.94 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2649  helix-turn-helix domain-containing protein  35.68 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2137  helix-turn-helix domain protein  36.53 
 
 		 283 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.291672  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  30.26 
 
 		 280 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>