More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0917 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0917  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  100 
 
 		 449 aa  907    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000000145882  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1474  signal recognition particle protein Srp54  49.32 
 
 		 446 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.570422  decreased coverage  0.000118802 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0918  signal recognition particle protein Srp54  50 
 
 		 443 aa  437  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0141  signal recognition particle protein Srp54  49.66 
 
 		 439 aa  436  1e-121  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0369  signal recognition particle protein Srp54  51.02 
 
 		 444 aa  436  1e-121  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3023  signal recognition particle protein Srp54  49.54 
 
 		 437 aa  432  1e-120  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0865  signal recognition particle protein Srp54  49.66 
 
 		 450 aa  420  1e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0440978  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1260  signal recognition particle protein Srp54  49.66 
 
 		 450 aa  421  1e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1964  signal recognition particle protein Srp54  49.29 
 
 		 443 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1877  signal recognition particle protein Srp54  48.71 
 
 		 441 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.189511 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0544  signal recognition particle protein Srp54  49.3 
 
 		 440 aa  414  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0717053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0799  signal recognition particle protein Srp54  48.05 
 
 		 450 aa  409  1e-113  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1119  signal recognition particle protein Srp54  48.51 
 
 		 450 aa  408  1e-113  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.227466  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1261  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  47.33 
 
 		 469 aa  404  1e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0025  signal recognition particle protein Srp54  48.05 
 
 		 450 aa  389  1e-107  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205386  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1757  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  46.73 
 
 		 446 aa  391  1e-107  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.941567  normal  0.290924 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1226  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  45.01 
 
 		 468 aa  386  1e-106  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1802  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  45.01 
 
 		 464 aa  385  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0496  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  45.48 
 
 		 464 aa  381  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.50914 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0260  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  46.19 
 
 		 463 aa  371  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0502  GTP-binding signal recognition particle  46.49 
 
 		 431 aa  363  3e-99  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0747031  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0597  GTP-binding signal recognition particle  43.69 
 
 		 433 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.000223356  hitchhiker  0.00000371893 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0531  GTP-binding signal recognition particle  46.38 
 
 		 442 aa  355  1e-96  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1726  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  42.82 
 
 		 431 aa  352  1e-95  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.878395 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1769  GTP-binding signal recognition particle  43.12 
 
 		 433 aa  348  2e-94  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0023858 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1950  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  44.04 
 
 		 447 aa  342  1e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.910344  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1519  GTP-binding signal recognition particle  43.06 
 
 		 433 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.262746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0296  GTP-binding signal recognition particle  41.29 
 
 		 449 aa  336  3.9999999999999995e-91  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000583511  normal  0.0555503 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26018  IISP family transporter: Signal recognition particle 54 kDa protein (SRP54)  38.75 
 
 		 513 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  39.91 
 
 		 443 aa  307  3e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4358  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.3 
 
 		 490 aa  300  3e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  41.71 
 
 		 446 aa  299  6e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  40.35 
 
 		 479 aa  298  9e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  40.89 
 
 		 469 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  39.91 
 
 		 446 aa  298  1e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0645  signal recognition particle protein  40.57 
 
 		 434 aa  298  1e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.196271  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  40.42 
 
 		 449 aa  296  4e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  40.42 
 
 		 449 aa  296  4e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  40.42 
 
 		 449 aa  296  4e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  40.42 
 
 		 449 aa  296  4e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13417  predicted protein  38.56 
 
 		 510 aa  296  4e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  40.42 
 
 		 449 aa  296  4e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  39.11 
 
 		 444 aa  296  6e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0319  signal recognition particle protein  37.7 
 
 		 439 aa  295  8e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000288102  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  40.18 
 
 		 449 aa  295  8e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  40.18 
 
 		 449 aa  295  8e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf350  signal recognition particle  39.55 
 
 		 441 aa  295  1e-78  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.826641  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  40.43 
 
 		 435 aa  295  1e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000012194  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  40.18 
 
 		 449 aa  294  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  40 
 
 		 453 aa  294  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  40.42 
 
 		 449 aa  294  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  40.27 
 
 		 433 aa  294  2e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  39.95 
 
 		 449 aa  294  3e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  39.95 
 
 		 449 aa  294  3e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2836  signal recognition particle protein  39.12 
 
 		 447 aa  294  3e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.533211  decreased coverage  0.000777787 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73416  Signal recognition particle 54 kDa protein  37.88 
 
 		 561 aa  293  3e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0128602 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  38.89 
 
 		 450 aa  293  5e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  38.89 
 
 		 444 aa  292  7e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1142  signal recognition particle protein  37.27 
 
 		 485 aa  292  8e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0433759  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  40.05 
 
 		 445 aa  292  8e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  39.59 
 
 		 433 aa  292  9e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  39.77 
 
 		 453 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1468  signal recognition particle protein  37.78 
 
 		 536 aa  291  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.396358 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4178  signal recognition particle protein  36.81 
 
 		 488 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  38.37 
 
 		 463 aa  291  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0181  signal recognition particle protein  38.19 
 
 		 491 aa  291  2e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.322699  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  38.81 
 
 		 450 aa  291  2e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  40.48 
 
 		 446 aa  291  2e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0983  signal recognition particle protein  37.7 
 
 		 525 aa  290  3e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0432973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  39.63 
 
 		 453 aa  290  3e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1967  signal recognition particle protein  38.63 
 
 		 452 aa  290  5.0000000000000004e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000299479  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1685  signal recognition particle protein  38.63 
 
 		 452 aa  290  5.0000000000000004e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  38.02 
 
 		 441 aa  289  8e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1773  hypothetical protein  36.12 
 
 		 442 aa  288  1e-76  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.128152 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0805  Signal recognition particle protein  39.91 
 
 		 451 aa  288  2e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.104742  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.44 
 
 		 443 aa  287  2e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  39.11 
 
 		 455 aa  287  2.9999999999999996e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0296  signal recognition particle protein  39.68 
 
 		 435 aa  287  2.9999999999999996e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130095  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  38.03 
 
 		 449 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  39.24 
 
 		 452 aa  286  4e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0638  signal recognition particle protein  39.24 
 
 		 444 aa  286  4e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000602256  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0572  signal recognition particle protein  36.77 
 
 		 492 aa  286  5e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  39.4 
 
 		 449 aa  286  5e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0589  signal recognition particle protein  36.77 
 
 		 492 aa  286  5e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.44 
 
 		 481 aa  286  5e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  38.75 
 
 		 452 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  38.75 
 
 		 453 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  38.53 
 
 		 448 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0592  signal recognition particle protein  38.53 
 
 		 515 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1707  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  39.11 
 
 		 511 aa  284  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0983445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.86 
 
 		 447 aa  284  3.0000000000000004e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1985  signal recognition particle protein  39.2 
 
 		 515 aa  284  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.421506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1538  signal recognition particle protein  41.18 
 
 		 436 aa  283  6.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000016303  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.83 
 
 		 527 aa  282  7.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.645209  normal  0.354043 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  38.57 
 
 		 476 aa  282  7.000000000000001e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.88 
 
 		 449 aa  282  7.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  38.48 
 
 		 455 aa  281  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  38.48 
 
 		 455 aa  281  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.75 
 
 		 470 aa  281  1e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000640801  normal  0.0289565 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  38.24 
 
 		 444 aa  281  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>