239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1199 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1199  pyridoxine 5'-phosphate synthase  100 
 
 
258 aa  523  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.39444  decreased coverage  0.00461164 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2616  pyridoxine 5'-phosphate synthase  79.53 
 
 
259 aa  410  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3263  pyridoxine 5'-phosphate synthase  78.74 
 
 
259 aa  407  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0574921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5258  pyridoxine 5'-phosphate synthase  80.71 
 
 
257 aa  393  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2344  pyridoxine 5'-phosphate synthase  76.73 
 
 
262 aa  368  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.954303  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1752  pyridoxine 5'-phosphate synthase  70.4 
 
 
252 aa  359  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.736096  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0595  pyridoxine 5'-phosphate synthase  68.4 
 
 
268 aa  340  9e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1405  pyridoxine 5'-phosphate synthase  71.31 
 
 
254 aa  326  3e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3632  pyridoxine 5'-phosphate synthase  67.46 
 
 
271 aa  318  7.999999999999999e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.757255  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0653  pyridoxine 5'-phosphate synthase  64.26 
 
 
265 aa  311  1e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0178796  normal  0.245911 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3058  pyridoxine 5'-phosphate synthase  66.53 
 
 
276 aa  309  2.9999999999999997e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2318  Pyridoxine 5'-phosphate synthase  57.61 
 
 
255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1713  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.61 
 
 
251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03472  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.88 
 
 
255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0014  pyridoxine 5'-phosphate synthase  53.91 
 
 
247 aa  236  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104614 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0038  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.6 
 
 
260 aa  228  8e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0740712  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0046  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.21 
 
 
260 aa  227  2e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2830  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.58 
 
 
241 aa  227  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4990  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  48.96 
 
 
245 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.128156  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2038  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.35 
 
 
245 aa  221  7e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.371359  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1493  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.41 
 
 
248 aa  217  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0630  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.52 
 
 
238 aa  215  7e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.377308 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2768  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.75 
 
 
250 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180597  normal  0.550753 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2794  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.5 
 
 
250 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0224689  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1341  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.69 
 
 
246 aa  210  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000107326  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3677  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.84 
 
 
240 aa  209  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1385  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.27 
 
 
246 aa  207  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0165798  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4728  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.28 
 
 
239 aa  206  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1810  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50 
 
 
245 aa  205  7e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2512  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.5 
 
 
250 aa  204  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.65849  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3403  pyridoxine 5'-phosphate synthase  44.96 
 
 
238 aa  202  6e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.735952 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1041  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.34 
 
 
238 aa  201  7e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04340  putative pyridoxine biosynthesis protein  42.32 
 
 
237 aa  199  3e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1695  pyridoxine 5'-phosphate synthase  41.67 
 
 
237 aa  196  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1982  pyridoxine 5'-phosphate synthase  43.75 
 
 
250 aa  192  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0918  pyridoxine 5'-phosphate synthase  43.33 
 
 
244 aa  185  7e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.184744  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3259  Pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.15 
 
 
255 aa  181  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0247328 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0377  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.31 
 
 
255 aa  154  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0844615  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13830  pyridoxine 5'-phosphate synthase  40.8 
 
 
248 aa  152  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1634  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.27 
 
 
270 aa  146  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0172383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3948  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.18 
 
 
246 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0997  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.34 
 
 
247 aa  145  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0370  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.59 
 
 
264 aa  145  9e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.225374  normal  0.0276101 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4214  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  40 
 
 
246 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256384  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0320  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.56 
 
 
244 aa  143  3e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3051  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.13 
 
 
243 aa  143  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.397726  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0336  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.34 
 
 
264 aa  142  4e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4371  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.27 
 
 
246 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.194442 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1076  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.87 
 
 
246 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1759  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.25 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1436  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.46 
 
 
246 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.532201  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0488  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.29 
 
 
251 aa  138  7e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1678  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.29 
 
 
240 aa  138  7e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1667  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.23 
 
 
247 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2629  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.21 
 
 
241 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3614  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.36 
 
 
243 aa  137  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1192  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.36 
 
 
243 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2929  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.71 
 
 
243 aa  138  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.513928  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1478  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39 
 
 
248 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.323845  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1071  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  36.36 
 
 
243 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.989266  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2782  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  37.23 
 
 
243 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0867  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.59 
 
 
240 aa  137  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0203459 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1011  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.59 
 
 
240 aa  137  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1385  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  35.29 
 
 
250 aa  137  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3666  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.23 
 
 
243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1139  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.93 
 
 
243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1265  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.17 
 
 
240 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0643  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.51 
 
 
244 aa  135  5e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2717  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.29 
 
 
243 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02458  pyridoxal phosphate biosynthetic protein  34.87 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1104  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  34.87 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548705  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3800  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.87 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02422  hypothetical protein  34.87 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2719  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.87 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0252  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  37.34 
 
 
245 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2850  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.87 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.445885  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1113  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.87 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4285  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.17 
 
 
240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2781  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.29 
 
 
243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2821  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.29 
 
 
243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3458  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.65 
 
 
249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.67158 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2956  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.29 
 
 
243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.586125  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2844  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.29 
 
 
243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.776191 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2740  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.29 
 
 
243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54290  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.43 
 
 
248 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0844  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.64 
 
 
254 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147174  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4746  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.02 
 
 
248 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.314773  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0409  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.93 
 
 
248 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1040  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.48 
 
 
245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.526796  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0911  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.48 
 
 
247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0316197  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0516  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.39 
 
 
248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2242  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.93 
 
 
244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.626957  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3068  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.5 
 
 
243 aa  129  6e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.867372  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2415  pyridoxine 5'-phosphate synthase  37.82 
 
 
260 aa  129  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2709  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.89 
 
 
248 aa  128  8.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0109345  normal  0.269213 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1733  pyridoxine 5'-phosphate synthase  39.58 
 
 
257 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0933039  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0446  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.34 
 
 
235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.86215  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1207  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.63 
 
 
243 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1854  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.43 
 
 
249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0279  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.33 
 
 
243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>