More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_1168 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_1168  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 463 aa  958    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.215526 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  62.26 
 
 		 455 aa  598  1e-170  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0506  DNA repair protein RadA  60.26 
 
 		 461 aa  577  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  59.3 
 
 		 458 aa  558  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  58.81 
 
 		 457 aa  561  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  57.24 
 
 		 453 aa  538  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2129  DNA repair protein RadA  57.46 
 
 		 454 aa  526  1e-148  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.124782  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0878  DNA repair protein RadA  56.22 
 
 		 457 aa  526  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01480  putative DNA repair protein  55.51 
 
 		 453 aa  522  1e-147  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0227  DNA repair protein RadA  52.07 
 
 		 461 aa  494  9.999999999999999e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  48.7 
 
 		 453 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  50.46 
 
 		 458 aa  442  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  50.34 
 
 		 457 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  49.02 
 
 		 457 aa  441  9.999999999999999e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  49.32 
 
 		 458 aa  435  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  47.4 
 
 		 454 aa  437  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  49.32 
 
 		 458 aa  435  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  49.54 
 
 		 458 aa  437  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  49.32 
 
 		 458 aa  434  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  49.32 
 
 		 458 aa  434  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  49.54 
 
 		 458 aa  434  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  49.32 
 
 		 458 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  49.77 
 
 		 484 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  49.32 
 
 		 458 aa  432  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  49.32 
 
 		 458 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  49.09 
 
 		 458 aa  434  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  45.53 
 
 		 457 aa  430  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  46.32 
 
 		 454 aa  430  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  46.32 
 
 		 454 aa  430  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  47.15 
 
 		 450 aa  430  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  46.44 
 
 		 457 aa  426  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  46.54 
 
 		 449 aa  423  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  47.31 
 
 		 459 aa  422  1e-117  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  46.39 
 
 		 448 aa  415  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  47.01 
 
 		 453 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  48.14 
 
 		 448 aa  414  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  45.45 
 
 		 470 aa  413  1e-114  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  47.07 
 
 		 454 aa  409  1e-113  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  45.82 
 
 		 451 aa  409  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  46.65 
 
 		 449 aa  410  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  45.85 
 
 		 450 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  44.69 
 
 		 457 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  44.59 
 
 		 460 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  47.34 
 
 		 453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  45.82 
 
 		 514 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  46.12 
 
 		 452 aa  402  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  45.82 
 
 		 514 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1499  DNA repair protein RadA  43.94 
 
 		 459 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4206  DNA repair protein RadA  44.61 
 
 		 520 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  44.15 
 
 		 489 aa  399  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02051  DNA repair protein RadA  43.51 
 
 		 459 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  0.619218 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01471  DNA repair protein RadA  44.25 
 
 		 461 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  49.53 
 
 		 449 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  44.03 
 
 		 465 aa  395  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0571  DNA repair protein RadA  46.59 
 
 		 494 aa  393  1e-108  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  44.65 
 
 		 476 aa  392  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1877  DNA repair protein RadA  42.91 
 
 		 507 aa  392  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0926  DNA repair protein RadA  43.89 
 
 		 455 aa  393  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  44.44 
 
 		 452 aa  392  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  43.38 
 
 		 453 aa  393  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  44.98 
 
 		 452 aa  394  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  42.58 
 
 		 466 aa  388  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5249  DNA repair protein RadA  46.88 
 
 		 453 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1204  DNA repair protein RadA  45.57 
 
 		 457 aa  389  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  42.64 
 
 		 467 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0756  DNA repair protein RadA  45.39 
 
 		 453 aa  385  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  45.34 
 
 		 462 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  45.62 
 
 		 455 aa  386  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1179  DNA repair protein RadA  43.94 
 
 		 457 aa  387  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.595072 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1487  DNA repair protein RadA  42.23 
 
 		 481 aa  385  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.652724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0956  DNA repair protein RadA  42 
 
 		 517 aa  388  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0419823 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  46.65 
 
 		 453 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1803  DNA repair protein RadA  49.12 
 
 		 415 aa  388  1e-106  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0626  DNA repair protein RadA  43.79 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  45.5 
 
 		 455 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0927  DNA repair protein RadA  41.93 
 
 		 482 aa  383  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  47.47 
 
 		 453 aa  382  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01611  DNA repair protein RadA  43.84 
 
 		 450 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.821199  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0646  DNA repair protein RadA  44.7 
 
 		 463 aa  383  1e-105  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0841  DNA repair protein RadA  45.77 
 
 		 457 aa  382  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1452  DNA repair protein RadA  45.86 
 
 		 478 aa  382  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00987951 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3455  DNA repair protein RadA  44.59 
 
 		 462 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1111  DNA repair protein RadA  44.37 
 
 		 457 aa  384  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0584  DNA repair protein RadA  42.18 
 
 		 518 aa  382  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.50622  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2178  DNA repair protein RadA  42.52 
 
 		 463 aa  385  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.965225  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0731  DNA repair protein RadA  44.7 
 
 		 463 aa  383  1e-105  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4644  DNA repair protein RadA  44.8 
 
 		 456 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.592741 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0794  DNA repair protein RadA  44.8 
 
 		 477 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0449  DNA repair protein RadA  44.22 
 
 		 467 aa  380  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165637  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  43.56 
 
 		 462 aa  380  1e-104  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4640  DNA repair protein RadA  45.03 
 
 		 455 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0562  DNA repair protein RadA  44.2 
 
 		 464 aa  379  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.814745  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0778  DNA repair protein RadA  44.61 
 
 		 454 aa  380  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4506  DNA repair protein RadA  44.8 
 
 		 456 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01501  DNA repair protein RadA  43.04 
 
 		 450 aa  382  1e-104  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.309187  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01540  DNA repair protein RadA  44.18 
 
 		 464 aa  379  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.850923  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0827  DNA repair protein RadA  42.24 
 
 		 482 aa  379  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4638  DNA repair protein RadA  44.8 
 
 		 456 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.854791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0963  DNA repair protein RadA  45.08 
 
 		 446 aa  382  1e-104  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000314277  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0157  DNA repair protein RadA  49.47 
 
 		 408 aa  381  1e-104  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>