More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1352 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  100 
 
 
91 aa  187  5.999999999999999e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  72.22 
 
 
90 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  72.41 
 
 
90 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  72.41 
 
 
90 aa  138  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  67.82 
 
 
139 aa  137  6e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  71.26 
 
 
90 aa  137  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  71.26 
 
 
90 aa  137  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  71.26 
 
 
90 aa  137  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  71.26 
 
 
90 aa  137  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  71.26 
 
 
90 aa  137  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  71.26 
 
 
90 aa  137  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  71.26 
 
 
90 aa  137  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  71.26 
 
 
90 aa  137  7e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  71.26 
 
 
90 aa  137  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  65.56 
 
 
90 aa  134  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  59.34 
 
 
91 aa  132  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000677791  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  58.89 
 
 
90 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  70 
 
 
81 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  67.47 
 
 
90 aa  124  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  58.89 
 
 
90 aa  124  6e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  68.75 
 
 
86 aa  122  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  64.71 
 
 
88 aa  123  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  56.67 
 
 
90 aa  122  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  62.79 
 
 
88 aa  120  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  60.92 
 
 
88 aa  120  8e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  58.62 
 
 
88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  52.22 
 
 
90 aa  119  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  62.5 
 
 
81 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  58.62 
 
 
88 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1322  30S ribosomal protein S16  57.14 
 
 
91 aa  114  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1297  30S ribosomal protein S16  57.14 
 
 
91 aa  114  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000043058  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0804  30S ribosomal protein S16  57.14 
 
 
91 aa  113  7.999999999999999e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525288  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0798  SSU ribosomal protein S16P  52.75 
 
 
96 aa  113  7.999999999999999e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000268891  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1303  ribosomal protein S16  58.75 
 
 
81 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0170665  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2055  ribosomal protein S16  62.5 
 
 
89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000864984  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1328  ribosomal protein S16  61.25 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  67.95 
 
 
96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  62.96 
 
 
82 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0656  ribosomal protein S16  54.95 
 
 
92 aa  111  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0001625  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1388  SSU ribosomal protein S16P  57.32 
 
 
85 aa  111  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159057  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  65 
 
 
81 aa  111  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  65 
 
 
81 aa  111  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  58.75 
 
 
81 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1369  SSU ribosomal protein S16P  58.54 
 
 
82 aa  110  8.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000301445  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2408  30S ribosomal protein S16  58.02 
 
 
81 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000382163  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0547  30S ribosomal protein S16  53.41 
 
 
108 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  61.54 
 
 
86 aa  105  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000265446  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  61.54 
 
 
86 aa  105  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000430382  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  59.76 
 
 
85 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0103  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
183 aa  104  4e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2657  30S ribosomal protein S16  58.54 
 
 
154 aa  103  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1419  ribosomal protein S16  63.41 
 
 
141 aa  102  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.206604  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2224  30S ribosomal protein S16  51.76 
 
 
86 aa  102  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98252e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2727  ribosomal protein S16  54.88 
 
 
201 aa  102  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1398  ribosomal protein S16  54.22 
 
 
131 aa  102  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00441352 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2871  30S ribosomal protein S16  50.6 
 
 
88 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000408452  hitchhiker  0.000000516516 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0035  ribosomal protein S16  48.35 
 
 
204 aa  102  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173963  normal  0.182146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1384  ribosomal protein S16  52.38 
 
 
186 aa  101  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.227441  normal  0.758588 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  56.76 
 
 
81 aa  101  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3616  30S ribosomal protein S16  51.61 
 
 
120 aa  100  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0072517 
 
 
-
 
NC_002950  PG2117  30S ribosomal protein S16  51.19 
 
 
192 aa  100  9e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.595697 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1463  30S ribosomal protein S16  56.47 
 
 
122 aa  100  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.190646  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0632  30S ribosomal protein S16  50.54 
 
 
120 aa  100  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1226  30S ribosomal protein S16  52.81 
 
 
95 aa  99.4  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0664  30S ribosomal protein S16  49.46 
 
 
120 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3431  30S ribosomal protein S16  53.01 
 
 
88 aa  99.4  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000117102  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3493  30S ribosomal protein S16  53.01 
 
 
88 aa  99.4  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18951e-29 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0653  30S ribosomal protein S16  49.46 
 
 
120 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.141648  normal  0.112542 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1229  30S ribosomal protein S16  52.81 
 
 
95 aa  99.4  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888168  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1301  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
188 aa  99.4  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  52.44 
 
 
87 aa  98.6  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000801266  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3763  30S ribosomal protein S16  51.81 
 
 
88 aa  99.4  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744609  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0985  ribosomal protein S16  56.63 
 
 
136 aa  98.6  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000245762  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3352  30S ribosomal protein S16  53.76 
 
 
120 aa  98.2  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3682  30S ribosomal protein S16  51.76 
 
 
119 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl542  30S ribosomal protein S16  48.31 
 
 
89 aa  98.2  4e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264239  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0643  30S ribosomal protein S16  51.25 
 
 
95 aa  97.1  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144131  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04640  ribosomal protein S16  47.62 
 
 
191 aa  97.1  7e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  58.44 
 
 
86 aa  97.1  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3305  ribosomal protein S16  50.62 
 
 
81 aa  97.1  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  58.44 
 
 
86 aa  97.1  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2888  30S ribosomal protein S16  50.59 
 
 
119 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0568  30S ribosomal protein S16  48.75 
 
 
82 aa  96.3  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000021123  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1824  30S ribosomal protein S16  52.38 
 
 
134 aa  96.3  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0320  ribosomal protein S16  43.68 
 
 
111 aa  96.3  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000084035  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2582  30S ribosomal protein S16  48.81 
 
 
197 aa  96.3  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00178967  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_507  ribosomal protein S16  48.75 
 
 
82 aa  96.3  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000394154  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1756  30S ribosomal protein S16  52.38 
 
 
134 aa  96.3  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0646  30S ribosomal protein S16  48.86 
 
 
90 aa  96.3  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.151605  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0688  ribosomal protein S16  55.26 
 
 
128 aa  96.3  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000224694  hitchhiker  0.000468142 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2309  ribosomal protein S16  53.16 
 
 
82 aa  96.3  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000155548  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0662  SSU ribosomal protein S16P  50.6 
 
 
146 aa  95.5  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.646804  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3339  30S ribosomal protein S16  51.19 
 
 
134 aa  95.5  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.762714  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09150  SSU ribosomal protein S16P  52.33 
 
 
156 aa  95.5  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.791565  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3097  30S ribosomal protein S16  51.76 
 
 
124 aa  95.5  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.458494  normal  0.937059 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0109  30S ribosomal protein S16  47.62 
 
 
119 aa  95.1  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2540  ribosomal protein S16  53.01 
 
 
152 aa  95.1  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2153  30S ribosomal protein S16  51.58 
 
 
114 aa  94.7  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.399128  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0542  30S ribosomal protein S16  48.75 
 
 
82 aa  95.1  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000153303  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1561  SSU ribosomal protein S16P  48.84 
 
 
174 aa  95.1  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0890595 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>