41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2847 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2847  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
296 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.453576  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2753  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  96.96 
 
 
296 aa  464  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0702685  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2662  endonuclease/exonuclease/phosphatase  86.82 
 
 
300 aa  352  5.9999999999999994e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.273775  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2642  endonuclease/exonuclease/phosphatase  56.48 
 
 
289 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.415202  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3228  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.95 
 
 
385 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.139058 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1364  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.48 
 
 
345 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0989  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.41 
 
 
375 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1247  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.22 
 
 
437 aa  73.2  0.000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3854  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.31 
 
 
380 aa  72.4  0.000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.676972  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2121  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.97 
 
 
382 aa  69.3  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5499  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.38 
 
 
399 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.749951  normal  0.0277313 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2720  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.33 
 
 
375 aa  61.2  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389489  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1934  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.66 
 
 
368 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0236  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.77 
 
 
381 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1073  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.15 
 
 
597 aa  58.9  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0232  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.69 
 
 
381 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2783  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.07 
 
 
313 aa  56.2  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0990816  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.85 
 
 
269 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0605  hypothetical protein  28.37 
 
 
413 aa  51.6  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.662935 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02630  hypothetical protein  23.53 
 
 
359 aa  51.6  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.249483  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0824  endonuclease/exonuclease/phosphatase, putative  24.27 
 
 
431 aa  51.2  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0502024  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4013  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.34 
 
 
810 aa  50.4  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1021  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.01 
 
 
342 aa  49.7  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0041  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.51 
 
 
460 aa  49.3  0.00008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.294388  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0247  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.47 
 
 
338 aa  48.9  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3704  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40 
 
 
322 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0496  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.57 
 
 
246 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32901  predicted protein  31.29 
 
 
249 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0382374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7068  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.39 
 
 
1007 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332521  normal  0.746742 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1431  hypothetical protein  27.91 
 
 
331 aa  47  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31 
 
 
265 aa  47  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1518  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.88 
 
 
336 aa  46.6  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000454364  hitchhiker  0.00000000880332 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1498  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.6 
 
 
370 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0930511  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1506  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.22 
 
 
310 aa  45.1  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0135963  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05956  hypothetical protein  27.81 
 
 
317 aa  43.9  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.39 
 
 
271 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4612  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.6 
 
 
268 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0765415  normal  0.0123856 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0972  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.52 
 
 
1266 aa  43.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.705534  normal  0.368107 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1186  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.03 
 
 
342 aa  43.1  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.402884  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1102  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.94 
 
 
341 aa  42.7  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15630  predicted extracellular nuclease  32.61 
 
 
802 aa  42.4  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.35443  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>