68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp3060 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp3060  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  263  5e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2917  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  263  5e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5737  F0F1 ATP synthase subunit I  48.45 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00016778  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73320  F0F1 ATP synthase subunit I  48 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.691131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6363  F0F1 ATP synthase subunit I  47.96 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5438  F0F1 ATP synthase subunit I  46.39 
 
 		 135 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5207  F0F1 ATP synthase subunit I  46.39 
 
 		 135 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5420  F0F1 ATP synthase subunit I  46.39 
 
 		 135 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5302  F0F1 ATP synthase subunit I  46.39 
 
 		 135 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244326  normal  0.0929101 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3291  ATP synthase I chain  46.59 
 
 		 161 aa  83.6  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755083  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5128  F0F1 ATP synthase subunit I  46.39 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4052  ATP synthase I chain  38.02 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5606  ATP synthase F0, I subunit  46.39 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4754  ATP synthase protein I  38.4 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3932  ATP synthase I chain  38.4 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000705136  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4024  ATP synthase I chain  38.4 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00201847  normal  0.85532 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4372  ATP synthase I chain  37.6 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000845636  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4373  ATP synthase I chain  37.6 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000669  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4137  ATP synthase I chain  38.4 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000292688  hitchhiker  0.000119081 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4317  ATP synthase I chain  37.6 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000703874  hitchhiker  0.0000000000823347 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4493  ATP synthase I chain  37.31 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000280508  hitchhiker  0.00000551135 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4514  ATP synthase I chain  36.8 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00144664  normal  0.0252876 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4905  ATP synthase I chain  39.2 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000915146  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3852  ATP synthase I chain  35.54 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000120633  unclonable  0.00000154846 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3651  ATP synthase protein I  37.19 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000619385  unclonable  0.00000639496 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3759  ATP synthase I chain  36 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000537364  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4247  ATP synthase I chain  37.21 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000661597  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3066  F0F1 ATP synthase subunit I  34.78 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4302  ATP synthase I chain  29.81 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121609  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52230  ATP synthase I chain  44.21 
 
 		 95 aa  67  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0005  ATP synthase protein I, putative  33.33 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0559665  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3963  ATP synthase I chain  36.84 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.296292  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0055  ATP synthase protein I  37.04 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00429  F0F1 ATP synthase subunit I  33.04 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002023  ATP synthase protein I  33.64 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000172705  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3737  ATP synthase I chain  28.7 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.383514  normal  0.351861 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2141  ATP synthase F0, I subunit  34.21 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0183  ATP synthase protein I  37.08 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.682673  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3882  ATP synthase I chain  36.17 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0112913  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3312  ATP synthase protein I, putative  38.82 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26583  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2521  F0F1 ATP synthase subunit I  36.36 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399856  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04090  membrane-bound ATP synthase subunit, F1-F0-type proton-ATPase  29.77 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000818292  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3973  TonB-dependent receptor  39.02 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03911  normal  0.271142 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2437  ATP synthase I chain  38.46 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.317288  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4469  ATP synthase I chain  37.5 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000279802  hitchhiker  0.00000000148592 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4250  F0F1 ATP synthase subunit I  38.21 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000394682  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3034  ATP synthase I chain  36.9 
 
 		 181 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2031  ATP synthase protein, subunit I  28.71 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00141456  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4540  F0F1 ATP synthase subunit I  37.11 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000830263  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3501  ATP synthase I chain  37.38 
 
 		 179 aa  47  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0200838  normal  0.153424 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2334  putative ATP synthase protein, subunit I  28.71 
 
 		 132 aa  47  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0382608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0033  putative ATP synthase protein I  36.14 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3353  putative ATP synthase protein I  36.19 
 
 		 172 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3901  ATP synthase I chain  36.14 
 
 		 181 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0303  ATP synthase protein I  30.93 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00058209  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3281  F0F1-type ATP synthase subunit I-like  37.35 
 
 		 174 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310372  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0115  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  37.35 
 
 		 174 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  38.55 
 
 		 175 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00813238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2956  F0F1-type ATP synthase subunit I-like  37.35 
 
 		 174 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0553053  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  37.35 
 
 		 174 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193052  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0090  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  38.55 
 
 		 180 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000624383  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4107  ATP synthase protein I  29.41 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.09604e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3324  hypothetical protein  50.85 
 
 		 190 aa  43.9  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0142852  normal  0.211159 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4614  F0F1 ATP synthase subunit I  43.1 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  36.14 
 
 		 174 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.47155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0208  hypothetical protein  39.39 
 
 		 113 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4209  F0F1 ATP synthase subunit I  32.46 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000251091  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0248  putative ATP synthase protein I  29.27 
 
 		 183 aa  40.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.997494  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>