59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3759 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3759  ATP synthase I chain  100 
 
 		 127 aa  250  4.0000000000000004e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000537364  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4024  ATP synthase I chain  90.55 
 
 		 127 aa  228  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00201847  normal  0.85532 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3932  ATP synthase I chain  90.55 
 
 		 127 aa  228  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000705136  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4754  ATP synthase protein I  89.76 
 
 		 127 aa  228  3e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4137  ATP synthase I chain  89.76 
 
 		 127 aa  227  4e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000292688  hitchhiker  0.000119081 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4372  ATP synthase I chain  88.98 
 
 		 127 aa  226  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000845636  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4373  ATP synthase I chain  88.98 
 
 		 127 aa  226  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000669  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4317  ATP synthase I chain  88.98 
 
 		 127 aa  226  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000703874  hitchhiker  0.0000000000823347 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4514  ATP synthase I chain  88.19 
 
 		 151 aa  224  3e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00144664  normal  0.0252876 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3852  ATP synthase I chain  87.4 
 
 		 127 aa  221  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000120633  unclonable  0.00000154846 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4905  ATP synthase I chain  85.04 
 
 		 127 aa  219  7e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000915146  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4493  ATP synthase I chain  83.46 
 
 		 130 aa  214  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000280508  hitchhiker  0.00000551135 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3651  ATP synthase protein I  79.53 
 
 		 127 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000619385  unclonable  0.00000639496 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3963  ATP synthase I chain  77.17 
 
 		 151 aa  194  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.296292  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4052  ATP synthase I chain  74.8 
 
 		 129 aa  194  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4247  ATP synthase I chain  70.87 
 
 		 127 aa  180  8.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000661597  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3066  F0F1 ATP synthase subunit I  40.46 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2521  F0F1 ATP synthase subunit I  39.37 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399856  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6363  F0F1 ATP synthase subunit I  41.18 
 
 		 126 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73320  F0F1 ATP synthase subunit I  41.18 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.691131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3737  ATP synthase I chain  35.16 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.383514  normal  0.351861 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00429  F0F1 ATP synthase subunit I  35.88 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3060  hypothetical protein  36 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2917  hypothetical protein  36 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3312  ATP synthase protein I, putative  42.86 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26583  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002023  ATP synthase protein I  39.77 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000172705  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5207  F0F1 ATP synthase subunit I  36.44 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5438  F0F1 ATP synthase subunit I  36.44 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5420  F0F1 ATP synthase subunit I  36.44 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5302  F0F1 ATP synthase subunit I  36.44 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244326  normal  0.0929101 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5737  F0F1 ATP synthase subunit I  36.67 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00016778  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04090  membrane-bound ATP synthase subunit, F1-F0-type proton-ATPase  35.48 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000818292  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5606  ATP synthase F0, I subunit  42.05 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5128  F0F1 ATP synthase subunit I  42.05 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4302  ATP synthase I chain  31.09 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121609  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0005  ATP synthase protein I, putative  35.77 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0559665  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3291  ATP synthase I chain  36.78 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755083  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2141  ATP synthase F0, I subunit  33.61 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0183  ATP synthase protein I  33.61 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.682673  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2876  ATP synthase I chain  42.65 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.794417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52230  ATP synthase I chain  39.33 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3986  F0F1 ATP synthase subunit I  38.27 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0055  ATP synthase protein I  29.01 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4107  ATP synthase protein I  32.41 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.09604e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3882  ATP synthase I chain  37.66 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0112913  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4250  F0F1 ATP synthase subunit I  32.73 
 
 		 127 aa  47.4  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000394682  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4540  F0F1 ATP synthase subunit I  32.29 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000830263  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4209  F0F1 ATP synthase subunit I  36.08 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000251091  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4219  F0F1 ATP synthase subunit I  36.08 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000301046  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4183  F0F1 ATP synthase subunit I  36.08 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000276133  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0033  putative ATP synthase protein I  32.5 
 
 		 181 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0019  putative ATP synthase protein I AtpI  32.48 
 
 		 164 aa  45.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00588549  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3034  ATP synthase I chain  37.5 
 
 		 181 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2437  ATP synthase I chain  35.82 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.317288  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0001  F0F1 ATP synthase subunit I  32.97 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174013  hitchhiker  0.0034501 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3901  ATP synthase I chain  31.67 
 
 		 181 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4469  ATP synthase I chain  29.41 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000279802  hitchhiker  0.00000000148592 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4125  F0F1 ATP synthase subunit I  37.31 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000524554  normal  0.148775 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3973  TonB-dependent receptor  32.5 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03911  normal  0.271142 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>