38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3324 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3324  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0142852  normal  0.211159 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3519  hypothetical protein  82.07 
 
 		 182 aa  252  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32738  decreased coverage  0.0000213039 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3194  ATP synthase I chain  80.98 
 
 		 182 aa  248  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.559381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3353  putative ATP synthase protein I  51.48 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3501  ATP synthase I chain  46.99 
 
 		 179 aa  122  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0200838  normal  0.153424 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3034  ATP synthase I chain  36.11 
 
 		 181 aa  118  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0033  putative ATP synthase protein I  39.62 
 
 		 181 aa  111  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3901  ATP synthase I chain  39.24 
 
 		 181 aa  110  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3281  F0F1-type ATP synthase subunit I-like  36.81 
 
 		 174 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310372  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0115  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  37.43 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  36.87 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193052  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2956  F0F1-type ATP synthase subunit I-like  36.87 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0553053  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3315  ATP synthase protein I, putative  40.65 
 
 		 176 aa  105  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0596893  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  36.81 
 
 		 174 aa  105  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.47155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0090  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  36.46 
 
 		 180 aa  104  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000624383  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  35.91 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00813238  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2950  ATP synthase protein I, putative  40.32 
 
 		 118 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3362  putative ATP synthase protein I  40.32 
 
 		 118 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.152716  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1594  putative ATP synthase protein I  40.32 
 
 		 118 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00838653  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3975  F0F1-type ATP synthase, subunit I  40.32 
 
 		 118 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.100302  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4049  F0F1-type ATP synthase, subunit I  40.32 
 
 		 118 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3008  putative ATP synthase protein I  40.32 
 
 		 118 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.384957  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0019  putative ATP synthase protein I AtpI  31.55 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00588549  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0113  putative ATP synthase protein I  32.12 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00400093  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0208  hypothetical protein  38 
 
 		 113 aa  53.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3533  putative ATP synthase protein I AtpI  32.08 
 
 		 164 aa  51.6  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0889946 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2141  ATP synthase F0, I subunit  31.25 
 
 		 133 aa  50.4  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0183  ATP synthase protein I  31.25 
 
 		 161 aa  48.9  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.682673  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3312  ATP synthase protein I, putative  38.83 
 
 		 125 aa  48.5  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26583  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2917  hypothetical protein  39.36 
 
 		 131 aa  48.5  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3060  hypothetical protein  39.36 
 
 		 131 aa  48.5  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0190  putative ATP synthase protein I AtpI  30.68 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.993599  normal  0.901194 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0248  putative ATP synthase protein I  29.73 
 
 		 183 aa  44.7  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.997494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0320  putative ATP synthase protein I  29.65 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4493  ATP synthase I chain  34.15 
 
 		 130 aa  42  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000280508  hitchhiker  0.00000551135 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0301  putative ATP synthase protein I  29.94 
 
 		 162 aa  42.4  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082487 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0296  ATP synthase I chain  29.94 
 
 		 162 aa  42.4  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.713821  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0005  ATP synthase protein I, putative  30.63 
 
 		 123 aa  41.6  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0559665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>