35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0113 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0113  putative ATP synthase protein I  100 
 
 		 159 aa  313  5e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00400093  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0248  putative ATP synthase protein I  62.99 
 
 		 183 aa  187  5.999999999999999e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.997494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0365  putative ATP synthase protein I  56.33 
 
 		 156 aa  160  6e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4877  putative ATP synthase protein I  54.61 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0320  putative ATP synthase protein I  53.64 
 
 		 173 aa  154  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0296  ATP synthase I chain  54.97 
 
 		 162 aa  151  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.713821  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0301  putative ATP synthase protein I  54.97 
 
 		 162 aa  151  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082487 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0413  putative ATP synthase protein I  50.62 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.689873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3533  putative ATP synthase protein I AtpI  49.3 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0889946 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0190  putative ATP synthase protein I AtpI  50 
 
 		 168 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.993599  normal  0.901194 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0473  putative ATP synthase protein I  44.94 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.224139  normal  0.587808 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0019  putative ATP synthase protein I AtpI  29.61 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00588549  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3501  ATP synthase I chain  34.81 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0200838  normal  0.153424 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3315  ATP synthase protein I, putative  32.88 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0596893  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  28.07 
 
 		 174 aa  48.1  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.47155  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2950  ATP synthase protein I, putative  31.09 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3008  putative ATP synthase protein I  31.09 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.384957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4049  F0F1-type ATP synthase, subunit I  31.09 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3975  F0F1-type ATP synthase, subunit I  31.09 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.100302  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1594  putative ATP synthase protein I  31.09 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00838653  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3362  putative ATP synthase protein I  31.09 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.152716  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3281  F0F1-type ATP synthase subunit I-like  25.5 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310372  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3324  hypothetical protein  32.12 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0142852  normal  0.211159 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3519  hypothetical protein  32.26 
 
 		 182 aa  44.3  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32738  decreased coverage  0.0000213039 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0115  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  26.32 
 
 		 174 aa  43.9  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  26.32 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193052  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2956  F0F1-type ATP synthase subunit I-like  26.32 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0553053  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3901  ATP synthase I chain  27.73 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0033  putative ATP synthase protein I  27.12 
 
 		 181 aa  42.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  25.83 
 
 		 175 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00813238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3353  putative ATP synthase protein I  33.33 
 
 		 172 aa  42.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0090  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  25.83 
 
 		 180 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000624383  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3194  ATP synthase I chain  30.97 
 
 		 182 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.559381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2876  ATP synthase I chain  34.4 
 
 		 146 aa  41.2  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.794417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3034  ATP synthase I chain  27.97 
 
 		 181 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>