26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0248 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0248  putative ATP synthase protein I  100 
 
 		 183 aa  361  3e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.997494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0113  putative ATP synthase protein I  62.99 
 
 		 159 aa  187  7e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00400093  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0320  putative ATP synthase protein I  64.14 
 
 		 173 aa  182  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0365  putative ATP synthase protein I  57.69 
 
 		 156 aa  181  7e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0296  ATP synthase I chain  57.52 
 
 		 162 aa  166  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.713821  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0301  putative ATP synthase protein I  57.52 
 
 		 162 aa  166  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082487 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4877  putative ATP synthase protein I  52.83 
 
 		 161 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0413  putative ATP synthase protein I  55.48 
 
 		 160 aa  139  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.689873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0473  putative ATP synthase protein I  51.25 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.224139  normal  0.587808 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0190  putative ATP synthase protein I AtpI  49.64 
 
 		 168 aa  121  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.993599  normal  0.901194 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3533  putative ATP synthase protein I AtpI  50.72 
 
 		 164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0889946 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  28.98 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.47155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2956  F0F1-type ATP synthase subunit I-like  30.3 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0553053  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  30.3 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193052  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0033  putative ATP synthase protein I  28.66 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3281  F0F1-type ATP synthase subunit I-like  28.98 
 
 		 174 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310372  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3901  ATP synthase I chain  28.74 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0115  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  30.3 
 
 		 174 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3315  ATP synthase protein I, putative  29.05 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0596893  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0090  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  31.1 
 
 		 180 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000624383  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  28.81 
 
 		 175 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00813238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3034  ATP synthase I chain  28.66 
 
 		 181 aa  51.6  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0019  putative ATP synthase protein I AtpI  30.38 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00588549  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3501  ATP synthase I chain  34.44 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0200838  normal  0.153424 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3353  putative ATP synthase protein I  31.25 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0005  ATP synthase protein I, putative  30.77 
 
 		 123 aa  41.6  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0559665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>