34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3533 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3533  putative ATP synthase protein I AtpI  100 
 
 		 164 aa  319  9.999999999999999e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0889946 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0190  putative ATP synthase protein I AtpI  63.29 
 
 		 168 aa  185  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.993599  normal  0.901194 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0320  putative ATP synthase protein I  53.42 
 
 		 173 aa  142  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0296  ATP synthase I chain  50.62 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.713821  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0301  putative ATP synthase protein I  50.62 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082487 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4877  putative ATP synthase protein I  45.51 
 
 		 161 aa  124  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0113  putative ATP synthase protein I  49.3 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00400093  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0248  putative ATP synthase protein I  50.72 
 
 		 183 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.997494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0365  putative ATP synthase protein I  50.67 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0413  putative ATP synthase protein I  45.91 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.689873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0473  putative ATP synthase protein I  45.89 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.224139  normal  0.587808 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0019  putative ATP synthase protein I AtpI  34.13 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00588549  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  34.78 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.47155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3901  ATP synthase I chain  35.4 
 
 		 181 aa  67  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3315  ATP synthase protein I, putative  36.77 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0596893  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  33.76 
 
 		 175 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00813238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3034  ATP synthase I chain  31.29 
 
 		 181 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0090  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  33.76 
 
 		 180 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000624383  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2956  F0F1-type ATP synthase subunit I-like  32.26 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0553053  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  32.26 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193052  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0115  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  32.26 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3281  F0F1-type ATP synthase subunit I-like  31.68 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310372  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0033  putative ATP synthase protein I  33.54 
 
 		 181 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337462  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2950  ATP synthase protein I, putative  39.67 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3008  putative ATP synthase protein I  39.67 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.384957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4049  F0F1-type ATP synthase, subunit I  39.67 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3975  F0F1-type ATP synthase, subunit I  39.67 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.100302  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1594  putative ATP synthase protein I  39.67 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00838653  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3362  putative ATP synthase protein I  39.67 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.152716  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3353  putative ATP synthase protein I  32.5 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0208  hypothetical protein  36.84 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3519  hypothetical protein  33.12 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32738  decreased coverage  0.0000213039 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3324  hypothetical protein  32.08 
 
 		 190 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0142852  normal  0.211159 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3194  ATP synthase I chain  31.14 
 
 		 182 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.559381  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>