41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0019 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0019  putative ATP synthase protein I AtpI  100 
 
 		 164 aa  327  3e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00588549  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3315  ATP synthase protein I, putative  40.76 
 
 		 176 aa  107  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0596893  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  37.27 
 
 		 175 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00813238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0090  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  37.27 
 
 		 180 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000624383  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3281  F0F1-type ATP synthase subunit I-like  37.66 
 
 		 174 aa  96.7  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310372  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2956  F0F1-type ATP synthase subunit I-like  37.5 
 
 		 174 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0553053  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  37.5 
 
 		 174 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193052  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0115  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  37.5 
 
 		 174 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3034  ATP synthase I chain  36.2 
 
 		 181 aa  93.6  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  36.02 
 
 		 174 aa  93.6  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.47155  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2950  ATP synthase protein I, putative  41.27 
 
 		 118 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3008  putative ATP synthase protein I  41.27 
 
 		 118 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.384957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4049  F0F1-type ATP synthase, subunit I  41.27 
 
 		 118 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3975  F0F1-type ATP synthase, subunit I  41.27 
 
 		 118 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.100302  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1594  putative ATP synthase protein I  41.27 
 
 		 118 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00838653  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3362  putative ATP synthase protein I  41.27 
 
 		 118 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.152716  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3901  ATP synthase I chain  36.36 
 
 		 181 aa  87.4  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0033  putative ATP synthase protein I  36.36 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3353  putative ATP synthase protein I  37.09 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3533  putative ATP synthase protein I AtpI  34.13 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0889946 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3501  ATP synthase I chain  33.79 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0200838  normal  0.153424 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3519  hypothetical protein  32.12 
 
 		 182 aa  64.3  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32738  decreased coverage  0.0000213039 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3324  hypothetical protein  31.55 
 
 		 190 aa  63.9  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0142852  normal  0.211159 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3194  ATP synthase I chain  31.52 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.559381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0320  putative ATP synthase protein I  30.3 
 
 		 173 aa  62  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0113  putative ATP synthase protein I  29.61 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00400093  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0301  putative ATP synthase protein I  31.76 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082487 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0296  ATP synthase I chain  31.76 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.713821  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0190  putative ATP synthase protein I AtpI  30.26 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.993599  normal  0.901194 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0365  putative ATP synthase protein I  31.58 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0248  putative ATP synthase protein I  31.17 
 
 		 183 aa  50.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.997494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4247  ATP synthase I chain  34.19 
 
 		 127 aa  48.1  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000661597  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0473  putative ATP synthase protein I  31.85 
 
 		 166 aa  47.8  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.224139  normal  0.587808 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3852  ATP synthase I chain  33.33 
 
 		 127 aa  47.4  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000120633  unclonable  0.00000154846 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4877  putative ATP synthase protein I  23.97 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3759  ATP synthase I chain  32.48 
 
 		 127 aa  45.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000537364  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4905  ATP synthase I chain  32.48 
 
 		 127 aa  42.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000915146  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4514  ATP synthase I chain  30.77 
 
 		 151 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00144664  normal  0.0252876 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3651  ATP synthase protein I  34.75 
 
 		 127 aa  42  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000619385  unclonable  0.00000639496 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0413  putative ATP synthase protein I  30.91 
 
 		 160 aa  41.6  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.689873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4493  ATP synthase I chain  31.62 
 
 		 130 aa  40.8  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000280508  hitchhiker  0.00000551135 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>