31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0413 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0413  putative ATP synthase protein I  100 
 
 		 160 aa  313  7e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.689873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0296  ATP synthase I chain  65.56 
 
 		 162 aa  198  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.713821  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0301  putative ATP synthase protein I  65.56 
 
 		 162 aa  198  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082487 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0365  putative ATP synthase protein I  63.29 
 
 		 156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0248  putative ATP synthase protein I  55.48 
 
 		 183 aa  156  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.997494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0473  putative ATP synthase protein I  57.96 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.224139  normal  0.587808 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0113  putative ATP synthase protein I  50.62 
 
 		 159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00400093  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4877  putative ATP synthase protein I  50 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0320  putative ATP synthase protein I  51.63 
 
 		 173 aa  136  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0190  putative ATP synthase protein I AtpI  47.92 
 
 		 168 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.993599  normal  0.901194 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3533  putative ATP synthase protein I AtpI  45.91 
 
 		 164 aa  117  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0889946 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  32.68 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.47155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  32.03 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193052  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2956  F0F1-type ATP synthase subunit I-like  32.03 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0553053  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3315  ATP synthase protein I, putative  35.57 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0596893  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0115  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  32.26 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0090  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  35.29 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000624383  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  35.29 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00813238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3281  F0F1-type ATP synthase subunit I-like  31.13 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310372  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0019  putative ATP synthase protein I AtpI  31.52 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00588549  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3501  ATP synthase I chain  31.29 
 
 		 179 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0200838  normal  0.153424 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2950  ATP synthase protein I, putative  36.89 
 
 		 118 aa  51.6  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3008  putative ATP synthase protein I  36.89 
 
 		 118 aa  51.6  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.384957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4049  F0F1-type ATP synthase, subunit I  36.89 
 
 		 118 aa  51.6  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3975  F0F1-type ATP synthase, subunit I  36.89 
 
 		 118 aa  51.6  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.100302  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1594  putative ATP synthase protein I  36.89 
 
 		 118 aa  51.6  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00838653  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3362  putative ATP synthase protein I  36.89 
 
 		 118 aa  51.6  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.152716  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3901  ATP synthase I chain  31.61 
 
 		 181 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3034  ATP synthase I chain  29.27 
 
 		 181 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3353  putative ATP synthase protein I  32.08 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0033  putative ATP synthase protein I  30.32 
 
 		 181 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337462  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>