37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0099 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  100 
 
 		 175 aa  350  5e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00813238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0090  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  98.86 
 
 		 180 aa  348  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000624383  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0115  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  92.57 
 
 		 174 aa  322  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3281  F0F1-type ATP synthase subunit I-like  92 
 
 		 174 aa  321  4e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310372  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  92 
 
 		 174 aa  320  8e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.47155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2956  F0F1-type ATP synthase subunit I-like  91.43 
 
 		 174 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0553053  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  91.43 
 
 		 174 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193052  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3315  ATP synthase protein I, putative  77.84 
 
 		 176 aa  270  6e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0596893  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3901  ATP synthase I chain  69.89 
 
 		 181 aa  248  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3034  ATP synthase I chain  68.75 
 
 		 181 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0033  putative ATP synthase protein I  68.18 
 
 		 181 aa  239  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3008  putative ATP synthase protein I  83.9 
 
 		 118 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.384957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4049  F0F1-type ATP synthase, subunit I  83.9 
 
 		 118 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3975  F0F1-type ATP synthase, subunit I  83.9 
 
 		 118 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.100302  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1594  putative ATP synthase protein I  83.9 
 
 		 118 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00838653  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3362  putative ATP synthase protein I  83.9 
 
 		 118 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.152716  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2950  ATP synthase protein I, putative  83.9 
 
 		 118 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3353  putative ATP synthase protein I  43.12 
 
 		 172 aa  119  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3501  ATP synthase I chain  38.2 
 
 		 179 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0200838  normal  0.153424 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0019  putative ATP synthase protein I AtpI  37.27 
 
 		 164 aa  98.6  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00588549  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3324  hypothetical protein  35.91 
 
 		 190 aa  96.7  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0142852  normal  0.211159 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3519  hypothetical protein  35 
 
 		 182 aa  87  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32738  decreased coverage  0.0000213039 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3194  ATP synthase I chain  36.16 
 
 		 182 aa  87  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.559381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3533  putative ATP synthase protein I AtpI  33.76 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0889946 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0320  putative ATP synthase protein I  32.34 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0301  putative ATP synthase protein I  34.01 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082487 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0296  ATP synthase I chain  34.01 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.713821  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0365  putative ATP synthase protein I  34.18 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0190  putative ATP synthase protein I AtpI  35.17 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.993599  normal  0.901194 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3312  ATP synthase protein I, putative  37.14 
 
 		 125 aa  52.4  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26583  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0248  putative ATP synthase protein I  31.13 
 
 		 183 aa  52.4  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.997494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0413  putative ATP synthase protein I  33.97 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.689873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4247  ATP synthase I chain  35.78 
 
 		 127 aa  45.1  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000661597  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2917  hypothetical protein  38.55 
 
 		 131 aa  44.7  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3060  hypothetical protein  38.55 
 
 		 131 aa  44.7  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0113  putative ATP synthase protein I  25.83 
 
 		 159 aa  42  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00400093  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4877  putative ATP synthase protein I  29.03 
 
 		 161 aa  41.2  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>