82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4247 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_4247  ATP synthase I chain  100 
 
 		 127 aa  248  3e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000661597  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4905  ATP synthase I chain  74.8 
 
 		 127 aa  189  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000915146  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3852  ATP synthase I chain  73.23 
 
 		 127 aa  185  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000120633  unclonable  0.00000154846 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4493  ATP synthase I chain  73.23 
 
 		 130 aa  181  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000280508  hitchhiker  0.00000551135 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3651  ATP synthase protein I  72.44 
 
 		 127 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000619385  unclonable  0.00000639496 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3759  ATP synthase I chain  70.87 
 
 		 127 aa  180  8.000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000537364  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4024  ATP synthase I chain  67.72 
 
 		 127 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00201847  normal  0.85532 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3932  ATP synthase I chain  67.72 
 
 		 127 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000705136  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4754  ATP synthase protein I  68.5 
 
 		 127 aa  177  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4372  ATP synthase I chain  68.5 
 
 		 127 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000845636  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4317  ATP synthase I chain  68.5 
 
 		 127 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000703874  hitchhiker  0.0000000000823347 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4373  ATP synthase I chain  68.5 
 
 		 127 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000669  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3963  ATP synthase I chain  70.87 
 
 		 151 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.296292  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4137  ATP synthase I chain  66.93 
 
 		 127 aa  176  7e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000292688  hitchhiker  0.000119081 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4514  ATP synthase I chain  67.72 
 
 		 151 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00144664  normal  0.0252876 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4052  ATP synthase I chain  67.72 
 
 		 129 aa  169  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2521  F0F1 ATP synthase subunit I  44.88 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399856  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3066  F0F1 ATP synthase subunit I  42.75 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00429  F0F1 ATP synthase subunit I  38.58 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6363  F0F1 ATP synthase subunit I  55.06 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73320  F0F1 ATP synthase subunit I  55.06 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.691131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3737  ATP synthase I chain  36.15 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.383514  normal  0.351861 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2917  hypothetical protein  37.21 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3060  hypothetical protein  37.21 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002023  ATP synthase protein I  43.33 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000172705  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4302  ATP synthase I chain  36.97 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121609  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5438  F0F1 ATP synthase subunit I  38.66 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5207  F0F1 ATP synthase subunit I  38.66 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5302  F0F1 ATP synthase subunit I  38.66 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244326  normal  0.0929101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5420  F0F1 ATP synthase subunit I  38.66 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04090  membrane-bound ATP synthase subunit, F1-F0-type proton-ATPase  38.94 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000818292  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5128  F0F1 ATP synthase subunit I  48.81 
 
 		 135 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5737  F0F1 ATP synthase subunit I  46.07 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00016778  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5606  ATP synthase F0, I subunit  48.81 
 
 		 135 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0001  F0F1 ATP synthase subunit I  47.73 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174013  hitchhiker  0.0034501 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0055  ATP synthase protein I  37.01 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4219  F0F1 ATP synthase subunit I  42.73 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000301046  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4183  F0F1 ATP synthase subunit I  42.73 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000276133  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4540  F0F1 ATP synthase subunit I  42.05 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000830263  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4250  F0F1 ATP synthase subunit I  39.09 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000394682  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4209  F0F1 ATP synthase subunit I  46.43 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000251091  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3986  F0F1 ATP synthase subunit I  43.9 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3312  ATP synthase protein I, putative  33.33 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26583  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0005  ATP synthase protein I, putative  42.68 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0559665  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4187  F0F1 ATP synthase subunit I  45.07 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0000826403  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  36.13 
 
 		 174 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193052  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2956  F0F1-type ATP synthase subunit I-like  36.13 
 
 		 174 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0553053  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0115  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  36.13 
 
 		 174 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3281  F0F1-type ATP synthase subunit I-like  36.13 
 
 		 174 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310372  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3882  ATP synthase I chain  40.74 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0112913  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0033  putative ATP synthase protein I  32.77 
 
 		 181 aa  50.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3291  ATP synthase I chain  36.78 
 
 		 161 aa  50.1  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755083  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2141  ATP synthase F0, I subunit  33.87 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0183  ATP synthase protein I  33.87 
 
 		 161 aa  48.9  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.682673  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4125  F0F1 ATP synthase subunit I  43.66 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000524554  normal  0.148775 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3034  ATP synthase I chain  31.93 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2437  ATP synthase I chain  37.25 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.317288  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52230  ATP synthase I chain  42.7 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3901  ATP synthase I chain  31.09 
 
 		 181 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0019  putative ATP synthase protein I AtpI  34.19 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00588549  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2950  ATP synthase protein I, putative  35 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3362  putative ATP synthase protein I  35 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.152716  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1594  putative ATP synthase protein I  35 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00838653  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3008  putative ATP synthase protein I  35 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.384957  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3975  F0F1-type ATP synthase, subunit I  35 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.100302  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4049  F0F1-type ATP synthase, subunit I  35 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3315  ATP synthase protein I, putative  35.65 
 
 		 176 aa  47  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0596893  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4228  ATP synthase I chain  42.86 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000294824  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03567  hypothetical protein  42.86 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000214026  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4182  F0F1 ATP synthase subunit I  42.86 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000328591  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03623  F0F1 ATP synthase subunit I  42.86 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000273392  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4255  F0F1 ATP synthase subunit I  42.86 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000153619  normal  0.0333498 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3955  F0F1 ATP synthase subunit I  42.86 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000204463  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4255  F0F1 ATP synthase subunit I  42.86 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000721396  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  35.78 
 
 		 175 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00813238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0090  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  36.7 
 
 		 180 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000624383  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0099  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  34.45 
 
 		 174 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.47155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2876  ATP synthase I chain  33.9 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.794417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4469  ATP synthase I chain  40.32 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000279802  hitchhiker  0.00000000148592 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3973  TonB-dependent receptor  34.48 
 
 		 107 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03911  normal  0.271142 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4107  ATP synthase protein I  31.48 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.09604e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3353  putative ATP synthase protein I  33.33 
 
 		 172 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>